151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0625 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0625  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 
212 aa  434  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.67903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0578  phosphatidylserine decarboxylase  58.49 
 
 
212 aa  259  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0703  phosphatidylserine decarboxylase  58.88 
 
 
212 aa  259  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1610  phosphatidylserine decarboxylase  57.28 
 
 
212 aa  241  3.9999999999999997e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0540  phosphatidylserine decarboxylase  56.19 
 
 
217 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0597  phosphatidylserine decarboxylase  55.19 
 
 
213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0676696 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1747  phosphatidylserine decarboxylase  51.4 
 
 
212 aa  225  3e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1996  phosphatidylserine decarboxylase related protein  44.95 
 
 
235 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2554  phosphatidylserine decarboxylase  45.19 
 
 
220 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0252012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2500  phosphatidylserine decarboxylase  42.25 
 
 
219 aa  168  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000480867  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1263  phosphatidylserine decarboxylase  43.54 
 
 
218 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0592817  hitchhiker  0.00000000666847 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0393  phosphatidylserine decarboxylase  41.78 
 
 
217 aa  161  6e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3216  phosphatidylserine decarboxylase  40 
 
 
218 aa  160  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1908  phosphatidylserine decarboxylase  41.26 
 
 
218 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0031301  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1049  phosphatidylserine decarboxylase  41.12 
 
 
230 aa  160  2e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.518165  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0503  phosphatidylserine decarboxylase  38.86 
 
 
215 aa  155  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.833912  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1789  phosphatidylserine decarboxylase  40.85 
 
 
214 aa  154  7e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109391 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2217  phosphatidylserine decarboxylase  44.64 
 
 
224 aa  149  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000482693  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1988  phosphatidylserine decarboxylase  35.61 
 
 
208 aa  148  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0779  phosphatidylserine decarboxylase  38.54 
 
 
226 aa  148  6e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0901  phosphatidylserine decarboxylase related protein  42.94 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0273  phosphatidylserine decarboxylase related protein  37.62 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.72024  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0483  phosphatidylserine decarboxylase  37.91 
 
 
232 aa  144  8.000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3505  phosphatidylserine decarboxylase  40.38 
 
 
232 aa  144  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2946  phosphatidylserine decarboxylase  42.24 
 
 
208 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2744  phosphatidylserine decarboxylase  41.99 
 
 
219 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1174  phosphatidylserine decarboxylase  38.39 
 
 
232 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1745  phosphatidylserine decarboxylase  41.46 
 
 
213 aa  143  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.535362  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1022  phosphatidylserine decarboxylase  38.39 
 
 
232 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.243181 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1497  phosphatidylserine decarboxylase  41.44 
 
 
219 aa  142  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.665119 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0357  phosphatidylserine decarboxylase  36.79 
 
 
220 aa  142  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0296  phosphatidylserine decarboxylase  41.76 
 
 
226 aa  142  5e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1016  phosphatidylserine decarboxylase  37.2 
 
 
214 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.300701  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2225  phosphatidylserine decarboxylase  39.9 
 
 
215 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1902  phosphatidylserine decarboxylase  39.42 
 
 
215 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.500487 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2438  phosphatidylserine decarboxylase  41.57 
 
 
232 aa  141  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0610672 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2074  phosphatidylserine decarboxylase  38.94 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.855604  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3084  phosphatidylserine decarboxylase  40.57 
 
 
233 aa  140  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2300  phosphatidylserine decarboxylase  37.2 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.221496  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0723  phosphatidylserine decarboxylase  42.25 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2178  phosphatidylserine decarboxylase  37.2 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0719  phosphatidylserine decarboxylase  41.01 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656741  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5589  phosphatidylserine decarboxylase  36.23 
 
 
214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1651  phosphatidylserine decarboxylase  36.23 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2262  phosphatidylserine decarboxylase  36.23 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2374  phosphatidylserine decarboxylase  41.01 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.422276 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2285  phosphatidylserine decarboxylase  36.23 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.786265 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3228  phosphatidylserine decarboxylase  36.89 
 
 
212 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570292  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0458  phosphatidylserine decarboxylase  37.16 
 
 
257 aa  138  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  0.724626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2019  phosphatidylserine decarboxylase  37.38 
 
 
212 aa  138  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1461  phosphatidylserine decarboxylase  40.24 
 
 
213 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.672327  normal  0.166696 
 
 
-
 
NC_004310  BR0443  phosphatidylserine decarboxylase  36.97 
 
 
232 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.527505  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0950  phosphatidylserine decarboxylase  38.28 
 
 
217 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0450  phosphatidylserine decarboxylase  36.97 
 
 
232 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0794  phosphatidylserine decarboxylase  37.29 
 
 
225 aa  137  1e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.143743 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0554  phosphatidylserine decarboxylase related protein  41.07 
 
 
219 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000080045  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0665  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.23 
 
 
217 aa  136  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1114  phosphatidylserine decarboxylase related protein  42.13 
 
 
225 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2714  phosphatidylserine decarboxylase  37.74 
 
 
225 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.701165  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0043  phosphatidylserine decarboxylase  36.97 
 
 
219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4863  phosphatidylserine decarboxylase  40.33 
 
 
220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.619442  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1048  phosphatidylserine decarboxylase  34.93 
 
 
216 aa  135  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0122315  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2360  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  39.44 
 
 
221 aa  135  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4662  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.23 
 
 
233 aa  135  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.2141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0436  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.8 
 
 
237 aa  135  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1366  phosphatidylserine decarboxylase  37.56 
 
 
252 aa  135  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1679  phosphatidylserine decarboxylase related protein  38.32 
 
 
232 aa  135  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.386839 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1845  phosphatidylserine decarboxylase  34.93 
 
 
216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00789748  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1422  phosphatidylserine decarboxylase  34.93 
 
 
216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1471  phosphatidylserine decarboxylase  38.2 
 
 
232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1116  phosphatidylserine decarboxylase  34.93 
 
 
216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0750  phosphatidylserine decarboxylase  34.93 
 
 
224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1277  phosphatidylserine decarboxylase  34.93 
 
 
216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1284  phosphatidylserine decarboxylase  34.93 
 
 
216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0399  phosphatidylserine decarboxylase  34.93 
 
 
216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.819025  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3062  phosphatidylserine decarboxylase  42.77 
 
 
225 aa  134  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000000800998  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0556  phosphatidylserine decarboxylase  36.02 
 
 
232 aa  134  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0248  phosphatidylserine decarboxylase-related protein  45.29 
 
 
225 aa  134  8e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1331  phosphatidylserine decarboxylase  35.92 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0645947 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2985  phosphatidylserine decarboxylase related protein  42.69 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000580157  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3027  phosphatidylserine decarboxylase related protein  42.69 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0587182 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0813  phosphatidylserine decarboxylase  35.41 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1992  phosphatidylserine decarboxylase  36.74 
 
 
216 aa  132  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1963  phosphatidylserine decarboxylase  40.96 
 
 
262 aa  132  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.546846  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2095  phosphatidylserine decarboxylase  37.91 
 
 
232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0448862  normal  0.695487 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2597  phosphatidylserine decarboxylase  36.45 
 
 
217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1234  phosphatidylserine decarboxylase  37.9 
 
 
247 aa  132  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0692  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40 
 
 
237 aa  132  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2197  phosphatidylserine decarboxylase  37.04 
 
 
208 aa  131  6e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000671717  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3367  phosphatidylserine decarboxylase  39.34 
 
 
232 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0111385 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5649  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.2 
 
 
223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5280  phosphatidylserine decarboxylase related protein  36.62 
 
 
236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0915  phosphatidylserine decarboxylase  41.18 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1495  phosphatidylserine decarboxylase related protein  40.86 
 
 
237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146505  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1060  phosphatidylserine decarboxylase  34.93 
 
 
215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4740  phosphatidylserine decarboxylase related protein  36.15 
 
 
236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5207  phosphatidylserine decarboxylase related protein  36.15 
 
 
236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.195602  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0978  phosphatidylserine decarboxylase  40.1 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4692  phosphatidylserine decarboxylase  40.68 
 
 
226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.177779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0141  phosphatidylserine decarboxylase related protein  39.11 
 
 
232 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>