More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0447 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0447  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 159 aa  317  3e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000981328  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0507  50S ribosomal protein L10  81.13 
 
 		 159 aa  263  5.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000655679  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1458  50S ribosomal protein L10  80.5 
 
 		 159 aa  262  1e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000221032  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0526  50S ribosomal protein L10  81.13 
 
 		 159 aa  262  1e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.142497  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0172  50S ribosomal protein L10  74.68 
 
 		 161 aa  239  2e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.33126  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0179  50S ribosomal protein L10  74.05 
 
 		 161 aa  238  2.9999999999999997e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1318  50S ribosomal protein L10  71.52 
 
 		 161 aa  233  9e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000548659  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1665  50S ribosomal protein L10  69.62 
 
 		 157 aa  227  5e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.701017  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0351  ribosomal protein L10  59.87 
 
 		 160 aa  201  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0874946  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0351  50S ribosomal protein L10  54.78 
 
 		 159 aa  179  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00255818  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  38.06 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  38.06 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  35 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  34.38 
 
 		 166 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  33.75 
 
 		 166 aa  97.1  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  33.75 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  33.75 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  33.75 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  33.75 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  33.75 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  33.56 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  33.75 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  33.75 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  33.75 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  38.03 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  38.03 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  38.03 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  33.77 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  30.86 
 
 		 170 aa  95.5  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  38.03 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 176 aa  94.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  39.01 
 
 		 165 aa  94.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  32.26 
 
 		 166 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  32.26 
 
 		 166 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  39.01 
 
 		 165 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  39.01 
 
 		 165 aa  94.4  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  39.01 
 
 		 165 aa  94  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0479  ribosomal protein L10  37.58 
 
 		 164 aa  94  7e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  39.01 
 
 		 165 aa  94.4  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  38.3 
 
 		 165 aa  94  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  36.69 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  39.01 
 
 		 184 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  39.01 
 
 		 184 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  39.01 
 
 		 184 aa  93.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  34.78 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  38.3 
 
 		 188 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  35.29 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  32.28 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3180  50S ribosomal protein L10  38.41 
 
 		 140 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000385503  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 168 aa  90.5  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  35.06 
 
 		 172 aa  90.5  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  31.85 
 
 		 167 aa  90.5  9e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 168 aa  90.5  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  37.59 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  36.88 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  36.88 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  31.87 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 172 aa  89  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  32.37 
 
 		 172 aa  87.8  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  31.21 
 
 		 173 aa  87  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  31.21 
 
 		 173 aa  87  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  32.67 
 
 		 173 aa  87  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  31.79 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  34.48 
 
 		 174 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  30.2 
 
 		 176 aa  85.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  31.25 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  32.94 
 
 		 174 aa  85.9  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  33.11 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  33.11 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  36.73 
 
 		 172 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  31.46 
 
 		 174 aa  84.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0857  50S ribosomal protein L10  31.4 
 
 		 177 aa  84.3  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259828  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  34.38 
 
 		 173 aa  84.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  28.85 
 
 		 256 aa  84.3  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2951  ribosomal protein L10  34.15 
 
 		 186 aa  84  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0265827  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  31.76 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  30.23 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  32.33 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  30.54 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  35.57 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  33.77 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  30.72 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0441  50S ribosomal protein L10  32.88 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4678  50S ribosomal protein L10  32.7 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000989378  decreased coverage  0.00291158 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2074  50S ribosomal protein L10  30.52 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0286  ribosomal protein L10  35.66 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  30.43 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  32.87 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0569  50S ribosomal protein L10  35.17 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000818206  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  30.19 
 
 		 178 aa  80.5  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  33.54 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  32.86 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  32.65 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  34.23 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1634  50S ribosomal protein L10  30.41 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  33.33 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  28.9 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0566  50S ribosomal protein L10  32.17 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1529  50S ribosomal protein L10  34.9 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>