More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0128 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0128  two-component response regulator  100 
 
 		 228 aa  453  1e-127  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.4797  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1103  two-component response regulator  56.11 
 
 		 221 aa  224  7e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1280  DNA-binding response regulator  49.54 
 
 		 220 aa  222  4e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000547046  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1358  DNA-binding response regulator  60.18 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0519481  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1236  DNA-binding response regulator  60.18 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000188808  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1324  extracellular solute-binding protein  49.32 
 
 		 220 aa  218  7e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0504  DNA-binding response regulator  59.28 
 
 		 221 aa  214  9e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000376141  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0136  transcriptional activator protein CopR  49.77 
 
 		 220 aa  201  6e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0840  transcriptional activator protein CopR  48.86 
 
 		 222 aa  201  9e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.048163  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  45.09 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1365  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00130586  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0528  transcriptional activator protein CopR  48.62 
 
 		 220 aa  177  9e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0120  response regulator receiver  42.73 
 
 		 221 aa  167  9e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0884  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68851  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  40.64 
 
 		 220 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0625  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  36.99 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1773  two component transcriptional regulator  38.01 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1917  DNA-binding response regulator  35.16 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1845  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  34.25 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.1 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  34.7 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3651  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.41 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0435949 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0985  DNA-binding response regulator CiaR  35.71 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.447626  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0272  response regulator receiver  36.36 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  36.28 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  32.72 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  34.25 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  34.25 
 
 		 220 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 		 220 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 222 aa  128  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  33.79 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  34.7 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  31.84 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1213  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 223 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  31.17 
 
 		 237 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.42 
 
 		 223 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1034  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.62 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.171933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  32.88 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  31.39 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.47 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3460  two component transcriptional regulator  35.4 
 
 		 238 aa  121  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0108229  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3593  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.21 
 
 		 226 aa  121  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000142937  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.47 
 
 		 279 aa  121  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  32 
 
 		 220 aa  121  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5387  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.62 
 
 		 236 aa  121  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  31.39 
 
 		 257 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2552  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.17 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000276879  normal  0.180215 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.33 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  33.79 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  29.82 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0209  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.96 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.39 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0142  DNA-binding response regulator  34.53 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  31.47 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2897  DNA-binding response regulator TctD  30.97 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3610  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.28 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2964  transcriptional regulator TctD  30.97 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  30.36 
 
 		 236 aa  119  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2928  transcriptional regulatory protein TctD  30.97 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2981  transcriptional regulator TctD  30.97 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.510212 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  33.79 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3084  transcriptional regulator TctD  30.97 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.56 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5521  two component response regulator  32.43 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.28 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.195761 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  31.05 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.05 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  30.04 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 221 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.5 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  33.79 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  33.79 
 
 		 224 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  33.79 
 
 		 220 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 222 aa  118  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  29.73 
 
 		 230 aa  118  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  31.39 
 
 		 221 aa  118  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.89 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  31.51 
 
 		 219 aa  118  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  29.61 
 
 		 246 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0738  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.67 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000482292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.22 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.22 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  31.22 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.59 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0998  two component transcriptional regulator  31.51 
 
 		 220 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333129  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  29.68 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  30.59 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5383  two component heavy metal response transcriptional regulator  30.49 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_004310  BR0604  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  32.04 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  33.79 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  33.03 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>