54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1012 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1012  ribonuclease BN  100 
 
 		 344 aa  653    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25840  predicted membrane protein  53.4 
 
 		 375 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2955  ribonuclease BN  54.36 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00451533  decreased coverage  0.000148448 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0817  ribonuclease BN  43.61 
 
 		 315 aa  195  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14240  predicted membrane protein  38.73 
 
 		 352 aa  164  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00629012  normal  0.0181744 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0986  ribonuclease BN  41.58 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3967  ribonuclease BN  34.57 
 
 		 357 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.565971 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1198  ribonuclease BN  27.78 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000216425 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1124  ribonuclease BN  30.23 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3957  ribonuclease BN  31.1 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.707734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  31.05 
 
 		 341 aa  93.6  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1295  ribonuclease  30.53 
 
 		 361 aa  87  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.381565 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0143  hypothetical protein  29.5 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.23892  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4405  ribonuclease BN  30.65 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1264  membrane protein-like protein  27.9 
 
 		 311 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0663  ribonuclease BN  28.52 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362248  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5966  ribonuclease BN  27.04 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.172061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0671  ribonuclease BN  29.86 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.157242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  25.95 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05300  ribonuclease, putative  27.48 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  28.66 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  25.61 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  24.76 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3886  ribonuclease  22.73 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3919  putative ribonuclease  23.57 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3826  putative ribonuclease  24.1 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.135959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  28.22 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  24.83 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03323  hypothetical protein  23.74 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0191  ribonuclease  23.74 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4885  putative ribonuclease  23.74 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03370  conserved inner membrane protein  23.74 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0762767  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3725  putative ribonuclease  23.74 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4010  putative ribonuclease  23.74 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3927  putative ribonuclease  23.74 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0195  ribonuclease  23.74 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  25.81 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1769  ribonuclease BN  26.67 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  24.77 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  24.77 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  24.4 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  24.4 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3983  putative ribonuclease  22.86 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344715 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3880  putative ribonuclease  22.86 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3924  putative ribonuclease  22.86 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3802  putative ribonuclease  22.86 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3815  putative ribonuclease  22.86 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0950  ribonuclease  22.79 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4073  ribonuclease  24.52 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1240  putative ribonuclease  25.7 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0799  ribonuclease BN  26.72 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0743  ribonuclease BN  24.81 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183226  hitchhiker  0.000468275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1764  ribonuclease BN  28.25 
 
 		 313 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  20.81 
 
 		 360 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>