More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0485 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
769 aa  1527    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38180  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  65.12 
 
 
396 aa  413  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6906  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  64.62 
 
 
381 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0695  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  59.26 
 
 
377 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.656465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1259  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  62.65 
 
 
373 aa  378  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0649127  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4210  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  55.62 
 
 
383 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3745  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  55.22 
 
 
389 aa  364  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191864  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04550  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, periplasmic  56.16 
 
 
383 aa  364  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000316579  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0440  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  55.42 
 
 
385 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01400  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  56.73 
 
 
408 aa  355  2.9999999999999997e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2432  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  58.79 
 
 
390 aa  354  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0322751  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0177  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  56.83 
 
 
369 aa  352  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12050  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  58.7 
 
 
425 aa  352  2e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0051177  normal  0.272152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7923  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  57.54 
 
 
358 aa  350  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2092  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  55.02 
 
 
368 aa  348  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.269694 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48120  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  55.31 
 
 
370 aa  346  7e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000260107  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2209  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  58.28 
 
 
355 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0235433 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0502  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, periplasmic precursor protein  53.31 
 
 
378 aa  326  9e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.496674 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0378  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.34 
 
 
379 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3194  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  52.41 
 
 
378 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204858  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3177  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.41 
 
 
378 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329153  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1884  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  52.41 
 
 
378 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968096  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0393  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.34 
 
 
379 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.76423 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2022  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  52.41 
 
 
378 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.779674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0892  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  52.41 
 
 
378 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.569984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2725  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  52.41 
 
 
378 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3140  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  52.41 
 
 
378 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3685  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.25 
 
 
381 aa  319  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1750  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.25 
 
 
381 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102428  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1425  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  52.11 
 
 
378 aa  318  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.830481  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3256  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.65 
 
 
381 aa  318  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4105  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.95 
 
 
381 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0314166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4261  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.95 
 
 
381 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.036739  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4158  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.95 
 
 
381 aa  317  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.54259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0425  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.88 
 
 
392 aa  316  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4260  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.38 
 
 
360 aa  316  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4329  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.11 
 
 
381 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00293344  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0859  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.15 
 
 
356 aa  314  2.9999999999999996e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4713  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.52 
 
 
350 aa  313  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.3 
 
 
383 aa  310  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6042  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  49.7 
 
 
406 aa  308  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0245  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.94 
 
 
332 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.710509  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4038  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.6 
 
 
371 aa  299  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.690604 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.42 
 
 
419 aa  296  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4172  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.61 
 
 
333 aa  296  8e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536145  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1072  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.14 
 
 
419 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1046  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.45 
 
 
375 aa  293  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413626  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0228  hypothetical protein  46.48 
 
 
390 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03494  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.88 
 
 
366 aa  286  8e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2633  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  49.25 
 
 
367 aa  278  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2384  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.31 
 
 
374 aa  278  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0398882  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2756  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.15 
 
 
396 aa  276  8e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.721808  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3422  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.15 
 
 
396 aa  276  9e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236253  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2070  hypothetical protein  42.89 
 
 
417 aa  276  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.927231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1298  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  46.11 
 
 
399 aa  273  9e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0120956  normal  0.755683 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0237  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  44.57 
 
 
412 aa  269  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4776  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  47.85 
 
 
356 aa  267  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.82712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4437  hypothetical protein  38.96 
 
 
487 aa  249  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.05 
 
 
1027 aa  248  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3128  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.13 
 
 
397 aa  248  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1112  hypothetical protein  35.94 
 
 
457 aa  240  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1314  hypothetical protein  39.46 
 
 
415 aa  240  9e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0619252  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1141  hypothetical protein  35.7 
 
 
457 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.07 
 
 
1372 aa  228  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0332  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.88 
 
 
395 aa  226  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3369  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.34 
 
 
381 aa  221  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4448  putative signal peptide protein  35.83 
 
 
454 aa  200  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983302  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1723  hypothetical protein  35.22 
 
 
464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.532519  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.9 
 
 
2668 aa  197  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4733  hypothetical protein  34.75 
 
 
454 aa  193  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3732  hypothetical protein  34.56 
 
 
451 aa  191  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0797  putative signal peptide protein  33.57 
 
 
452 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.532583 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0107  hypothetical protein  34.2 
 
 
448 aa  188  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0371  hypothetical protein  32.93 
 
 
448 aa  187  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1224  hypothetical protein  32.93 
 
 
448 aa  187  6e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0438  hypothetical protein  32.93 
 
 
448 aa  186  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1100  hypothetical protein  34.42 
 
 
452 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3903  hypothetical protein  31.78 
 
 
451 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4785  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  32.64 
 
 
451 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.432202  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1247  hypothetical protein  35.53 
 
 
452 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.171773  normal  0.0628011 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5264  hypothetical protein  33.79 
 
 
452 aa  183  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1793  putative signal peptide  34.74 
 
 
448 aa  182  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1841  hypothetical protein  32.09 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2872  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.29 
 
 
341 aa  180  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3317  periplasmic protein  34.58 
 
 
473 aa  180  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3050  hypothetical protein  33.51 
 
 
458 aa  177  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1319  hypothetical protein  31.38 
 
 
452 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1281  hypothetical protein  33.6 
 
 
458 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4103  hypothetical protein  32.63 
 
 
451 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.901263  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0828  hypothetical protein  27.27 
 
 
441 aa  162  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0751  hypothetical protein  27.66 
 
 
441 aa  161  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.767551  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4745  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.33 
 
 
451 aa  160  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311266  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4754  hypothetical protein  33.84 
 
 
451 aa  158  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.512063  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03310  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.25 
 
 
356 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1712  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.73 
 
 
352 aa  135  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002678  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.6 
 
 
351 aa  134  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0855489  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3959  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.14 
 
 
361 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0259448  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1401  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.83 
 
 
329 aa  132  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000351864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0198  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.18 
 
 
360 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0002  glycerophosphodiester phosphodiesterase  29.51 
 
 
355 aa  128  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000133502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>