More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0440 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0440  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 
385 aa  786    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.548504  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04550  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, periplasmic  94.81 
 
 
383 aa  733    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000316579  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4210  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  68.56 
 
 
383 aa  521  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48120  Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  74.1 
 
 
370 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000260107  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2092  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  59.01 
 
 
368 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.269694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38180  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  53.77 
 
 
396 aa  376  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0695  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  55.56 
 
 
377 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.656465 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12050  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  54.14 
 
 
425 aa  361  1e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0051177  normal  0.272152 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3745  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  53.96 
 
 
389 aa  360  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191864  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  56.7 
 
 
769 aa  358  8e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.335084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2432  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  55.09 
 
 
390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0322751  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1259  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  53.21 
 
 
373 aa  352  5e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0649127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6906  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  56.53 
 
 
381 aa  349  4e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0177  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.57 
 
 
369 aa  347  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0485  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  53.47 
 
 
383 aa  346  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2209  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.37 
 
 
355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0235433 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0425  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  47.04 
 
 
392 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6042  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.29 
 
 
406 aa  333  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7923  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.74 
 
 
358 aa  330  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3256  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.28 
 
 
381 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03494  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.45 
 
 
366 aa  325  8.000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4329  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.28 
 
 
381 aa  323  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00293344  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3177  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.58 
 
 
378 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329153  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1425  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  52.28 
 
 
378 aa  322  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.830481  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3194  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  52.13 
 
 
378 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204858  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01400  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.36 
 
 
408 aa  322  8e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1750  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  53.19 
 
 
381 aa  322  8e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102428  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1884  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  52.28 
 
 
378 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.968096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2725  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  52.28 
 
 
378 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2022  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  52.28 
 
 
378 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.779674  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0378  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.92 
 
 
379 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3140  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  52.28 
 
 
378 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0892  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family protein  52.28 
 
 
378 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.569984  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4105  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.67 
 
 
381 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0314166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4261  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.67 
 
 
381 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.036739  normal  0.183785 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0502  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, periplasmic precursor protein  51.23 
 
 
378 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.496674 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0393  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.31 
 
 
379 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.76423 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4158  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.83 
 
 
381 aa  318  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.54259 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3685  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.28 
 
 
381 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4260  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  49.55 
 
 
360 aa  318  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4713  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.29 
 
 
350 aa  316  4e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4038  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.18 
 
 
371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.690604 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0245  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  49.85 
 
 
332 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.710509  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2633  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  50.61 
 
 
367 aa  301  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1072  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.58 
 
 
419 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0859  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.26 
 
 
356 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1101  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.3 
 
 
419 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4172  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.17 
 
 
333 aa  297  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536145  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2384  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.19 
 
 
374 aa  295  6e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0398882  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1046  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48.97 
 
 
375 aa  295  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413626  normal  0.0540655 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0237  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.97 
 
 
412 aa  293  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1298  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.32 
 
 
399 aa  280  5e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0120956  normal  0.755683 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3128  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.78 
 
 
397 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3422  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.24 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236253  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2756  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.24 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.721808  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0332  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.42 
 
 
395 aa  270  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.21 
 
 
1027 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4776  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.59 
 
 
356 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.82712  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.88 
 
 
1372 aa  227  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3369  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  41.48 
 
 
381 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.74 
 
 
2668 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2872  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.83 
 
 
341 aa  202  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002678  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.59 
 
 
351 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0855489  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03310  glycerophosphodiester phosphodiesterase  36.49 
 
 
356 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3959  glycerophosphodiester phosphodiesterase  36.84 
 
 
361 aa  175  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0259448  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0198  glycerophosphodiester phosphodiesterase  36.01 
 
 
359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.482615  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4745  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.51 
 
 
451 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311266  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0224  glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.06 
 
 
371 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1401  glycerophosphodiester phosphodiesterase  36.5 
 
 
329 aa  172  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000351864  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1712  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.01 
 
 
352 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3992  glycerophosphodiester phosphodiesterase  33.52 
 
 
371 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.220581  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02165  periplasmic glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.51 
 
 
358 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2510  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.69 
 
 
356 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02124  hypothetical protein  35.51 
 
 
358 aa  170  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.828625  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2626  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.69 
 
 
356 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.538824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2418  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.69 
 
 
356 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2522  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.69 
 
 
356 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2467  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.69 
 
 
356 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.52374  normal  0.0759304 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2536  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.51 
 
 
358 aa  170  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3376  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.51 
 
 
358 aa  170  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1412  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.94 
 
 
358 aa  169  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.308397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2391  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.51 
 
 
358 aa  169  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.51 
 
 
358 aa  169  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.43101  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2379  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.51 
 
 
358 aa  169  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2621  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.51 
 
 
358 aa  169  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0198  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.86 
 
 
360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00238018  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3177  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.95 
 
 
359 aa  166  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0002  glycerophosphodiester phosphodiesterase  35.24 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000133502  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0564  glycerophosphodiester phosphodiesterase  36.15 
 
 
291 aa  143  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0510  glycerophosphodiester phosphodiesterase  31.03 
 
 
361 aa  142  8e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.554252  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02740  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.68 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0235  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.26 
 
 
452 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1551  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.12 
 
 
334 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000013117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2623  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.93 
 
 
293 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0307  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.41 
 
 
319 aa  113  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1048  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.66 
 
 
355 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3517  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.11 
 
 
314 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3270  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.11 
 
 
314 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.164149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2622  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.28 
 
 
291 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000747655 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3560  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.11 
 
 
314 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>