More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12130 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_12130  uracil phosphoribosyltransferase  100 
 
 
213 aa  431  1e-120  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1036  uracil phosphoribosyltransferase  73.91 
 
 
211 aa  317  7.999999999999999e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0997591 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1579  Uracil phosphoribosyltransferase  62.62 
 
 
209 aa  273  1.0000000000000001e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1306  uracil phosphoribosyltransferase  61.17 
 
 
214 aa  270  9e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.12178  normal  0.272748 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0633  uracil phosphoribosyltransferase  55.66 
 
 
213 aa  257  8e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0099  uracil phosphoribosyltransferase  56.94 
 
 
210 aa  256  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3312  uracil phosphoribosyltransferase  56.8 
 
 
209 aa  254  8e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000424943  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1439  Uracil phosphoribosyltransferase  59.61 
 
 
203 aa  254  9e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000704473  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0756  uracil phosphoribosyltransferase  56.31 
 
 
209 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.100559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3424  uracil phosphoribosyltransferase  56.8 
 
 
209 aa  252  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2185  uracil phosphoribosyltransferase  59.02 
 
 
211 aa  251  4.0000000000000004e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0012098  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2186  uracil phosphoribosyltransferase  56.8 
 
 
209 aa  249  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2148  uracil phosphoribosyltransferase  56.8 
 
 
209 aa  249  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.853574  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2462  uracil phosphoribosyltransferase  56.8 
 
 
209 aa  249  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2172  uracil phosphoribosyltransferase  56.31 
 
 
209 aa  249  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0574841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17920  uracil phosphoribosyltransferase  55.45 
 
 
226 aa  249  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0260  uracil phosphoribosyltransferase  54.59 
 
 
209 aa  248  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000384888  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1718  uracil phosphoribosyltransferase  56.8 
 
 
209 aa  248  5e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2857  uracil phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 
209 aa  248  5e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219047 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1586  uracil phosphoribosyltransferase  58.13 
 
 
209 aa  248  6e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0143232  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0394  uracil phosphoribosyltransferase  56.16 
 
 
209 aa  247  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0456  uracil phosphoribosyltransferase  55.61 
 
 
211 aa  246  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4825  uracil phosphoribosyltransferase  55.83 
 
 
209 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576364  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  57.28 
 
 
370 aa  245  3e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1245  uracil phosphoribosyltransferase  55.34 
 
 
209 aa  246  3e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000033391  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2598  uracil phosphoribosyltransferase  55.07 
 
 
209 aa  244  9e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.603921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0811  uracil phosphoribosyltransferase  56.1 
 
 
207 aa  241  6e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5113  uracil phosphoribosyltransferase  53.88 
 
 
209 aa  241  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000923033  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3834  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 
209 aa  241  7e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000428341  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5437  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 
209 aa  239  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000902075  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5440  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 
209 aa  239  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000136173  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5514  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 
209 aa  239  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166649  hitchhiker  9.91191e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5164  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 
209 aa  239  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000108027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4997  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 
209 aa  239  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.57452e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5014  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 
209 aa  239  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000524858  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5557  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 
209 aa  239  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5406  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 
209 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.45769e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5493  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 
209 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000780071  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2394  uracil phosphoribosyltransferase  54.85 
 
 
208 aa  238  5e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0693016  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1892  uracil phosphoribosyltransferase  55.19 
 
 
213 aa  235  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2767  uracil phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 
209 aa  234  7e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2515  uracil phosphoribosyltransferase  56.59 
 
 
208 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0833  uracil phosphoribosyltransferase  52.68 
 
 
303 aa  231  4.0000000000000004e-60  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00074745  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0843  uracil phosphoribosyltransferase  55.66 
 
 
211 aa  231  5e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4179  uracil phosphoribosyltransferase  54.63 
 
 
209 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1569  uracil phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 
210 aa  231  8.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4467  uracil phosphoribosyltransferase  54.63 
 
 
209 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0439778  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2971  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 
211 aa  229  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3987  uracil phosphoribosyltransferase  55.61 
 
 
227 aa  229  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0371905  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0831  uracil phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
210 aa  229  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.155687  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4570  uracil phosphoribosyltransferase  55.39 
 
 
205 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000263054  normal  0.0155857 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1697  uracil phosphoribosyltransferase  52.17 
 
 
209 aa  228  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3025  uracil phosphoribosyltransferase  56.1 
 
 
216 aa  228  8e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0316309 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0525  uracil phosphoribosyltransferase  55.5 
 
 
207 aa  227  9e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1726  uracil phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 
209 aa  227  9e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.847313 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1893  uracil phosphoribosyltransferase  52.17 
 
 
209 aa  227  9e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.439463  normal  0.245011 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1005  uracil phosphoribosyltransferase  53.66 
 
 
208 aa  227  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0557  uracil phosphoribosyltransferase  52.2 
 
 
209 aa  227  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000988166  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0240  uracil phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
208 aa  226  2e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1963  uracil phosphoribosyltransferase  50.94 
 
 
213 aa  226  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1827  uracil phosphoribosyltransferase  51.44 
 
 
216 aa  226  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.407732 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1316  uracil phosphoribosyltransferase  54.15 
 
 
208 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.58002  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1067  uracil phosphoribosyltransferase  53.17 
 
 
208 aa  225  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.608376  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1547  uracil phosphoribosyltransferase  51.44 
 
 
216 aa  225  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356534  normal  0.150214 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04610  uracil phosphoribosyltransferase  54.73 
 
 
209 aa  224  5.0000000000000005e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107009  hitchhiker  0.000000328703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3518  uracil phosphoribosyltransferase  52.22 
 
 
209 aa  224  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000866568  normal  0.165207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2002  uracil phosphoribosyltransferase  50.73 
 
 
220 aa  224  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17928  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1736  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 
208 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000718639  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1774  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 
208 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411747  normal  0.785811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3489  uracil phosphoribosyltransferase  53.17 
 
 
218 aa  223  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.125966  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1731  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 
208 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00552662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0465  uracil phosphoribosyltransferase  50.73 
 
 
220 aa  223  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.309204  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2548  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 
208 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000189333  hitchhiker  0.0000000219395 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2544  uracil phosphoribosyltransferase  53.88 
 
 
208 aa  223  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000155874  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2872  uracil phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
208 aa  223  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02390  uracil phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
208 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.158587  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1171  uracil phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
208 aa  223  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.357619  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2781  uracil phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
208 aa  223  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.205174  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2759  uracil phosphoribosyltransferase  53.88 
 
 
208 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1178  uracil phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
208 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0242269 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02352  hypothetical protein  52.91 
 
 
208 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.229942  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1597  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 
208 aa  223  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000154969  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2645  uracil phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
208 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.325171  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3523  uracil phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
209 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00113059  normal  0.884309 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2379  uracil phosphoribosyltransferase  53.88 
 
 
208 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  0.622917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2451  uracil phosphoribosyltransferase  53.88 
 
 
208 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00571838  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2633  uracil phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
208 aa  223  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3720  uracil phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
208 aa  223  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109857  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1818  uracil phosphoribosyltransferase  54.37 
 
 
208 aa  222  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1694  uracil phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
216 aa  222  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0615  uracil phosphoribosyltransferase  52.68 
 
 
207 aa  222  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.587001  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1065  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 
208 aa  222  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2219  uracil phosphoribosyltransferase  50.24 
 
 
211 aa  222  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.584245  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2986  uracil phosphoribosyltransferase  53.4 
 
 
208 aa  221  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0699433 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2991  uracil phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
208 aa  221  8e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2735  uracil phosphoribosyltransferase  52.43 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2389  uracil phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2757  uracil phosphoribosyltransferase  52.43 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131964  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2645  uracil phosphoribosyltransferase  52.43 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0438743  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0279  uracil phosphoribosyltransferase  51.21 
 
 
210 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>