102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09360 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_09360  probable hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  100 
 
 		 416 aa  813    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.268783 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1396  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  39.65 
 
 		 385 aa  243  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000155309  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1599  putative hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  38.87 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0130344  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0569  putative hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  36.58 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000369717  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0640  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  29.18 
 
 		 438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0545  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  29.35 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2771  putative hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  30.14 
 
 		 446 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0255944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1042  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  29.43 
 
 		 438 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144538  normal  0.528331 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4975  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  29.6 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3437  nucleobase/cation symporter, (NCS1) family  29.43 
 
 		 438 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4921  NCS1 nucleoside transporter  27.86 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4797  putative hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  27.86 
 
 		 427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4974  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  28.09 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0257  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.8 
 
 		 458 aa  104  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000119311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7829  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  29.55 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.458665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0493  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.86 
 
 		 430 aa  100  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2434  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.59 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.116228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2759  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.89 
 
 		 457 aa  96.7  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1794  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  28.07 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0041  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.66 
 
 		 457 aa  92.8  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.758493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2463  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.5 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.291531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4713  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  25.77 
 
 		 427 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.244042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2332  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.75 
 
 		 438 aa  88.2  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0095  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.15 
 
 		 448 aa  87.8  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0125  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.55 
 
 		 448 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2841  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.6 
 
 		 444 aa  79.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.810699  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.73 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1993  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.56 
 
 		 443 aa  76.3  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4072  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.21 
 
 		 450 aa  76.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2400  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  28.57 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.603733  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0413  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.3 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1545  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.75 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2198  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.99 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0171933  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3060  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.73 
 
 		 460 aa  66.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2203  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.703215 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1725  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  21.57 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1044  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.65 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955284  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0815  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.26 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3467  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.18 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.21 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.27545  normal  0.552006 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3279  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.88 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00201301  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3584  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.99 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0158  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.45 
 
 		 450 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1965  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.54 
 
 		 439 aa  53.9  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0801  cytosine permease  25.48 
 
 		 431 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141599  normal  0.241333 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000566  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  24.25 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2333  cytosine permease  25.56 
 
 		 420 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2529  cytosine permease  26.04 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0365158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3187  cytosine permease  25.16 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2654  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.09 
 
 		 489 aa  51.6  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2351  cytosine permease  22.02 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1118  cytosine permease  23.86 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1032  cytosine permease  23.86 
 
 		 441 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2802  cytosine permease  24.01 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.018065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22900  purine-cytosine permease-like transporter  27.08 
 
 		 455 aa  50.8  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.383587 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0601  cytosine permease  25.56 
 
 		 420 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1641  cytosine permease  23.78 
 
 		 420 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18791  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0866  cytosine permease  23.2 
 
 		 441 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1833  cytosine permease  23.2 
 
 		 441 aa  50.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184024  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3034  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.19 
 
 		 448 aa  50.4  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3524  cytosine permease  24.26 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0460  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.75 
 
 		 502 aa  49.7  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6019  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.42 
 
 		 480 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3596  cytosine permease  23.67 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3631  cytosine permease  23.96 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0779  cytosine permease  26.09 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05320  cytosine permease  24.25 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3201  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.22 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0862  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  25.47 
 
 		 507 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.472129  normal  0.0659585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2654  cytosine permease  26.5 
 
 		 421 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0650  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.34 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0343903 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2188  cytosine permease  23.34 
 
 		 421 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2208  cytosine permease  25.17 
 
 		 421 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.739585 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4197  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  21.52 
 
 		 407 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3526  cytosine permease  23.47 
 
 		 449 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0630  cytosine permease  25 
 
 		 417 aa  46.6  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.201877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2142  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  29.36 
 
 		 453 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1867  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.08 
 
 		 480 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4136  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.02 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0539  cytosine permease  24.35 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3693  cytosine permease  23.47 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2922  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.38 
 
 		 489 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.185419  normal  0.664118 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4185  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.27 
 
 		 476 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4251  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.27 
 
 		 476 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.236014 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1149  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.32 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.451386  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00290  cytosine transporter  23.53 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3270  NCS1 nucleoside transporter family  23.53 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4412  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.01 
 
 		 476 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.274319 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0401  cytosine permease  23.53 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0360  cytosine permease  23.53 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3289  cytosine permease  23.53 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0367  cytosine permease  23.53 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.506759 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0409  cytosine permease  23.53 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00294  hypothetical protein  23.53 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1469  purine-cytosine permease or related protein  21.71 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.454286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1854  cytosine permease  23.36 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.382094  hitchhiker  0.0000028856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05700  cytosine permease  24.06 
 
 		 416 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3607  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.03 
 
 		 474 aa  43.9  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3367  putative cytosine permease  24.03 
 
 		 439 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130336  normal  0.0781791 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03710  putative permease  21.26 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>