120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1396 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1396  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  100 
 
 
385 aa  739    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000155309  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1599  putative hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  47.75 
 
 
389 aa  317  3e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0130344  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09360  probable hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  39.7 
 
 
416 aa  258  2e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.268783 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0569  putative hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  37.17 
 
 
392 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000369717  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0640  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  27.2 
 
 
438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0545  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.43 
 
 
429 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2771  putative hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  25.36 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0255944  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1042  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  27.56 
 
 
438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144538  normal  0.528331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3437  nucleobase/cation symporter, (NCS1) family  27.36 
 
 
438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2434  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.64 
 
 
434 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.116228  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4975  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  27.96 
 
 
429 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7829  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.4 
 
 
452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.458665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2759  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  27.1 
 
 
457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2463  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.28 
 
 
435 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.291531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2332  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.49 
 
 
438 aa  109  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4921  NCS1 nucleoside transporter  28.28 
 
 
427 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0951814  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4797  putative hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  28.28 
 
 
427 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0041  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  26.98 
 
 
457 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.758493  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2203  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.02 
 
 
429 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.703215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4974  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  28.09 
 
 
427 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1794  permease for cytosine/purine, uracil, thiamine, allantoin  30.03 
 
 
446 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0493  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  28.72 
 
 
430 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113424  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0125  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.73 
 
 
448 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371605  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4713  hydroxymethylpyrimidine transporter CytX  28.08 
 
 
427 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.244042 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2841  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  27.7 
 
 
444 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.810699  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0257  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.92 
 
 
458 aa  87  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000119311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0095  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.75 
 
 
448 aa  84  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2400  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.02 
 
 
446 aa  81.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.603733  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1993  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.07 
 
 
443 aa  76.3  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000566  cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  25 
 
 
412 aa  69.7  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6361  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.17 
 
 
481 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2198  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.14 
 
 
445 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0171933  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05320  cytosine permease  24.76 
 
 
412 aa  66.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6019  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.6 
 
 
480 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213946  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3279  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.73 
 
 
431 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00201301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3467  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.47 
 
 
439 aa  64.3  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.05 
 
 
451 aa  64.3  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.82356  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0630  cytosine permease  26.04 
 
 
417 aa  63.9  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.201877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1725  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.83 
 
 
434 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5704  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  26.16 
 
 
490 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.323568  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0413  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.01 
 
 
432 aa  60.1  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3060  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.15 
 
 
460 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4194  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.52 
 
 
431 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5706  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.25 
 
 
479 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829822  normal  0.11286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3034  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.29 
 
 
448 aa  57.4  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1854  cytosine permease  25.23 
 
 
395 aa  57.4  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.382094  hitchhiker  0.0000028856 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1044  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.22 
 
 
438 aa  56.2  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.955284  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4415  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.25 
 
 
479 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2380  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  21.86 
 
 
474 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2802  cytosine permease  23.38 
 
 
421 aa  55.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.018065  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72073  predicted protein  24.87 
 
 
511 aa  54.3  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0815  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.05 
 
 
438 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0417  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  21.86 
 
 
474 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.370818  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1795  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  21.86 
 
 
474 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0465  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  21.86 
 
 
474 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.446257  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0016  cytosine permease  23.86 
 
 
417 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3584  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.02 
 
 
438 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0539  cytosine permease  24.31 
 
 
416 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0564  hypothetical protein  23.58 
 
 
487 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0831  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  21.58 
 
 
474 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.831321  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05700  cytosine permease  24.31 
 
 
416 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2519  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  21.58 
 
 
474 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00290  cytosine transporter  22.7 
 
 
419 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3270  NCS1 nucleoside transporter family  22.7 
 
 
419 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0401  cytosine permease  22.7 
 
 
419 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0360  cytosine permease  22.7 
 
 
419 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3289  cytosine permease  22.7 
 
 
419 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0367  cytosine permease  22.7 
 
 
419 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.506759 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3596  cytosine permease  24.44 
 
 
417 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00294  hypothetical protein  22.7 
 
 
419 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3261  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.29 
 
 
468 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3283  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3270  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.81 
 
 
471 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0406317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3631  cytosine permease  24.12 
 
 
425 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3524  cytosine permease  23.93 
 
 
417 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0409  cytosine permease  22.7 
 
 
419 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4072  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.48 
 
 
450 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2188  cytosine permease  24.31 
 
 
421 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6124  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  23.14 
 
 
470 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.874343  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0843  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  20.71 
 
 
420 aa  50.4  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.27545  normal  0.552006 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1828  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.17 
 
 
455 aa  50.1  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4820  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  21.56 
 
 
487 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3693  cytosine permease  24.09 
 
 
425 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3526  cytosine permease  24.09 
 
 
449 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6647  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  22.04 
 
 
469 aa  49.7  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104211  normal  0.0424999 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0628  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin permease family protein  21.58 
 
 
474 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.309989  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0460  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.8 
 
 
502 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2142  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  25.79 
 
 
453 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1965  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  22.54 
 
 
439 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7084  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.46 
 
 
475 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.083974 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0678  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.76 
 
 
450 aa  47.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.232179  normal  0.0587875 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0157  cytosine/purines/uracil/thiamine/allantoin family permease  21.67 
 
 
460 aa  47.4  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.489113  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0405  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.93 
 
 
452 aa  47  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0202053  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2484  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  24.1 
 
 
464 aa  47.4  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.307403  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1584  cytosine permease  21.27 
 
 
417 aa  47.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5793  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  21.72 
 
 
462 aa  46.6  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.610023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3052  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  23.2 
 
 
459 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1591  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  24.09 
 
 
456 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0862  permease for cytosine/purines uracil thiamine allantoin  22.33 
 
 
455 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000967478  normal  0.747959 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6996  cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin transporter  22.07 
 
 
473 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.181128  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1114  permease for cytosine/purines, uracil, thiamine, allantoin  20.1 
 
 
492 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>