More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06940 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_06940  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 395 aa  799    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.417246  normal  0.55711 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1347  aminotransferase class V  59.24 
 
 		 401 aa  432  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.145912  normal  0.878821 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09940  cysteine desulfurase family protein  50.89 
 
 		 392 aa  352  8.999999999999999e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.128931  hitchhiker  0.00000254642 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  40.66 
 
 		 400 aa  294  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  41.92 
 
 		 394 aa  287  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  42.78 
 
 		 388 aa  285  7e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  44.21 
 
 		 382 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  41.27 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  38.73 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  40.84 
 
 		 1143 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  39.75 
 
 		 384 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  40.4 
 
 		 392 aa  279  6e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  39.49 
 
 		 384 aa  279  8e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  40.84 
 
 		 381 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  41.71 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  39.24 
 
 		 394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  38.68 
 
 		 382 aa  269  7e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  41.77 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  42.49 
 
 		 383 aa  267  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  39.29 
 
 		 388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  40.81 
 
 		 388 aa  266  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  40.31 
 
 		 398 aa  266  5.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  38.87 
 
 		 1139 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  39.55 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  39.04 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  40.55 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  39.14 
 
 		 402 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  39.55 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4292  aminotransferase, class V  39.04 
 
 		 381 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000991667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  39.7 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4626  aminotransferase, class V  39.04 
 
 		 381 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  39.04 
 
 		 381 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  40.51 
 
 		 386 aa  263  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0732  aminotransferase class V  41.22 
 
 		 382 aa  263  4e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0224667  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  40.94 
 
 		 380 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  38.79 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  38.4 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1722  aminotransferase class V  41.21 
 
 		 412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  38.29 
 
 		 381 aa  259  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  38.79 
 
 		 398 aa  259  8e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  40.79 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  38.04 
 
 		 381 aa  257  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  39.24 
 
 		 397 aa  257  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  40.57 
 
 		 422 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4856  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  39.49 
 
 		 389 aa  257  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224928 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  41 
 
 		 393 aa  257  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  38.25 
 
 		 398 aa  256  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  43.04 
 
 		 383 aa  256  6e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  38.72 
 
 		 385 aa  256  6e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  39.22 
 
 		 383 aa  256  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  39.04 
 
 		 414 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5030  aminotransferase class V  39.49 
 
 		 388 aa  255  8e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  40.79 
 
 		 404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  40.79 
 
 		 404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  40.79 
 
 		 404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  40.79 
 
 		 404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  37.13 
 
 		 400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  41.05 
 
 		 404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  40.79 
 
 		 404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  37.06 
 
 		 393 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  40.79 
 
 		 404 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  40.79 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  40.79 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  38.32 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  40.79 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  40.79 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  40.79 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  40.79 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  38.42 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  40.79 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  40.79 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  40.79 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  40.79 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  38.73 
 
 		 404 aa  253  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  39.39 
 
 		 384 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  40.45 
 
 		 409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  38.1 
 
 		 401 aa  251  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  40.53 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22050  aminotransferase class V  36.91 
 
 		 381 aa  251  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.718227  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  40.47 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  38.27 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  40.58 
 
 		 388 aa  250  3e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  34.77 
 
 		 383 aa  249  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  39.59 
 
 		 403 aa  250  4e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2848  aminotransferase, class V  40.36 
 
 		 382 aa  250  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  37.66 
 
 		 401 aa  249  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0199  aminotransferase, class V  39.9 
 
 		 382 aa  249  6e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  38.27 
 
 		 388 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  39.39 
 
 		 396 aa  249  8e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  41.69 
 
 		 380 aa  248  9e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1629  cysteine desulfurase IscS  39.9 
 
 		 408 aa  248  2e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000331255  hitchhiker  0.0000285871 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  37 
 
 		 396 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2175  aminotransferase class V  38.13 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.670004  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  39.58 
 
 		 404 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  38.05 
 
 		 389 aa  247  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  37.5 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  37.5 
 
 		 398 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  39.74 
 
 		 1135 aa  247  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  41.39 
 
 		 382 aa  246  4e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1344  aminotransferase class V  37.28 
 
 		 406 aa  246  4e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>