More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0630 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0630  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 299 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000148774  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0055  transcriptional regulator, LysR family  39.64 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000650557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  34.47 
 
 		 314 aa  172  5.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0221  transcriptional regulator, LysR family  35.37 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 307 aa  165  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3776  transcriptional regulator, LysR family  35.13 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.988638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0637  transcriptional regulator, LysR family  34.18 
 
 		 312 aa  157  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000713061  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  34.22 
 
 		 319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 302 aa  155  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  32.97 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  31.29 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 294 aa  152  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2885  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 298 aa  152  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0269  LysR substrate-binding  30.07 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0142  transcriptional regulator, LysR family  31.48 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0448  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2253  transcriptional regulator, LysR family  30.95 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105468  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 294 aa  145  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  29.9 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  28.18 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  32.31 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1184  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0902  transcriptional regulator, LysR family  28.33 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1783  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 302 aa  142  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000134706  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0345  transcriptional regulator, LysR family  29.23 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20130  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.65 
 
 		 300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0701  transcriptional regulator, LysR family  30.58 
 
 		 307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0266  LysR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2747  transcriptional regulator, LysR family  27.57 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437645  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1732  putative transcriptional regulator  29.66 
 
 		 308 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0726  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.414898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1292  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.781932 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4080  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0263  transcriptional regulator, LysR family  28.9 
 
 		 322 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1902  LysR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1637  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 308 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  30.29 
 
 		 304 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1386  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.83 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4022  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162423 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1239  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  hitchhiker  0.00000000418584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4025  transcriptional regulator, LysR family  29.83 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5262  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  29.86 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3204  transcriptional regulator, LysR family  29.76 
 
 		 326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0357264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  30.29 
 
 		 304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  30.55 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  30.55 
 
 		 303 aa  133  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0953  transcriptional regulator, LysR family  34.54 
 
 		 294 aa  132  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  30.88 
 
 		 295 aa  132  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1597  putative transcriptional regulator LysR-type  30 
 
 		 308 aa  132  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02086  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.17 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0640427  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02045  hypothetical protein  29.17 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.074382  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2304  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.17 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791446 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2454  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.17 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3293  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.17 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.020887  normal  0.438576 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2293  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.17 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1614  LysR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.625262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4548  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456524 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0809  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.82 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1631  transcriptional regulator, LysR family  32.28 
 
 		 310 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4982  transcriptional regulator, LysR family  28.16 
 
 		 298 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1928  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.17 
 
 		 290 aa  129  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0121617  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1014  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 296 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  28.87 
 
 		 296 aa  129  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5945  transcriptional regulator, LysR family  31.52 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  31.05 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1694  LysR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1657  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.47 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0307226  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4630  LysR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2915  transcriptional regulator, LysR family  29.24 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  30.94 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0666  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  31.14 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0698  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2037  transcriptional regulator, LysR family  27.8 
 
 		 304 aa  125  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0223119  hitchhiker  0.000202643 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1501  transcriptional regulator, LysR family  29.37 
 
 		 268 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205194  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1491  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.37 
 
 		 268 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000696654  normal  0.0147604 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  29.25 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2392  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.78 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.26292  hitchhiker  0.00212314 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2436  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.78 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0199714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2348  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.78 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000261353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>