More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0552 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 555 aa  1128    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  41.35 
 
 		 558 aa  423  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  37.98 
 
 		 557 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.7 
 
 		 554 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  35.71 
 
 		 521 aa  296  6e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  36.31 
 
 		 521 aa  294  3e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.27 
 
 		 536 aa  263  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.27 
 
 		 536 aa  263  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  32.04 
 
 		 538 aa  229  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.43 
 
 		 438 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2064  mismatch repair ATPase  36.27 
 
 		 427 aa  200  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  25.6 
 
 		 607 aa  156  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.27 
 
 		 605 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  33.2 
 
 		 596 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  29.86 
 
 		 595 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  29.86 
 
 		 595 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  31.2 
 
 		 598 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.33 
 
 		 615 aa  126  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.08 
 
 		 624 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.88 
 
 		 626 aa  125  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  28.37 
 
 		 590 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.73 
 
 		 604 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.04 
 
 		 610 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.73 
 
 		 593 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  30.2 
 
 		 586 aa  114  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  27.27 
 
 		 590 aa  114  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  25.36 
 
 		 597 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1406  DNA mismatch repair protein MutS-like  25.45 
 
 		 597 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  27.35 
 
 		 594 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  25.36 
 
 		 597 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  29.18 
 
 		 601 aa  111  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.91 
 
 		 618 aa  110  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  24.25 
 
 		 610 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  27.59 
 
 		 601 aa  106  9e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  27.89 
 
 		 893 aa  99  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  29.17 
 
 		 442 aa  97.1  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0916  hypothetical protein  25.07 
 
 		 685 aa  96.7  9e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0756379 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  28.2 
 
 		 917 aa  95.5  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  27.14 
 
 		 956 aa  95.1  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  25.98 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  26.81 
 
 		 900 aa  90.5  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  24.6 
 
 		 918 aa  89  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  25.19 
 
 		 443 aa  87  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0467  hypothetical protein  25.77 
 
 		 726 aa  87  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  24.38 
 
 		 856 aa  87  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0948  DNA mismatch repair protein MutS  27.47 
 
 		 868 aa  86.7  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  24.31 
 
 		 902 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  24.38 
 
 		 856 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  24.45 
 
 		 864 aa  85.9  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  25.09 
 
 		 874 aa  86.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  24.91 
 
 		 883 aa  85.9  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0562  DNA mismatch repair protein MutS-like  25.62 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  24.38 
 
 		 856 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  26.92 
 
 		 863 aa  84  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.65 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  25.46 
 
 		 855 aa  84  0.000000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1537  DNA mismatch repair protein MutS  27.98 
 
 		 880 aa  84  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  29.61 
 
 		 865 aa  84  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  26.86 
 
 		 868 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  24.38 
 
 		 856 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  23.93 
 
 		 856 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  26.86 
 
 		 896 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  25.59 
 
 		 869 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0292  DNA mismatch repair protein MutS  25.65 
 
 		 784 aa  82.8  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.518405  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  26.59 
 
 		 793 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  23.93 
 
 		 856 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  25.45 
 
 		 853 aa  81.3  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  25.45 
 
 		 873 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  22.26 
 
 		 859 aa  80.9  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0174  DNA mismatch repair protein MutS  27.57 
 
 		 820 aa  80.5  0.00000000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  23.74 
 
 		 861 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  25.09 
 
 		 870 aa  80.1  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2124  DNA mismatch repair protein MutS  25.45 
 
 		 886 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  24.46 
 
 		 890 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  23.08 
 
 		 880 aa  80.1  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  26.74 
 
 		 870 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  27.24 
 
 		 828 aa  79.7  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  25.68 
 
 		 848 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  23.93 
 
 		 861 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1998  DNA mismatch repair protein MutS  25.45 
 
 		 885 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  23.93 
 
 		 861 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  20.65 
 
 		 870 aa  79.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2520  DNA mismatch repair protein MutS  25.99 
 
 		 894 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00821283  hitchhiker  0.000000391787 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  25.45 
 
 		 903 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  23.7 
 
 		 870 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0081  DNA mismatch repair protein MutS  24.81 
 
 		 905 aa  79.3  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294772  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  20.65 
 
 		 870 aa  79.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  24.01 
 
 		 893 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  25.09 
 
 		 895 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  24.11 
 
 		 853 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  25.53 
 
 		 874 aa  78.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0195  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  26.94 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  26.89 
 
 		 878 aa  78.2  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2559  DNA mismatch repair protein MutS  26.95 
 
 		 891 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  26.95 
 
 		 891 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  27.91 
 
 		 867 aa  78.2  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  25.47 
 
 		 793 aa  77.8  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3337  DNA mismatch repair protein MutS  24.32 
 
 		 864 aa  78.2  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  26.95 
 
 		 939 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  26.95 
 
 		 939 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>