92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3631 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3631  addiction module antitoxin  100 
 
 
100 aa  199  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2090  RelB antitoxin  67.01 
 
 
98 aa  128  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.406192  normal  0.733737 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8393  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  70.93 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7897  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  70.93 
 
 
102 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.373381  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3232  addiction module antitoxin  62.89 
 
 
102 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4666  RelB antitoxin  63.95 
 
 
101 aa  114  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0384532  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5830  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  60.98 
 
 
98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3758  addiction module antitoxin  62.96 
 
 
99 aa  110  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0622  addiction module antitoxin  60.98 
 
 
97 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4999  addiction module antitoxin  61.73 
 
 
99 aa  104  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3591  addiction module antitoxin  60.53 
 
 
97 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2239  addiction module antitoxin  60.76 
 
 
99 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.635404  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1223  addiction module antitoxin  60.53 
 
 
101 aa  100  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.528862  normal  0.677479 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3782  DNA-damage-inducible protein  68.75 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1163  addiction module antitoxin  60.42 
 
 
87 aa  62.8  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3887  DNA-damage-inducible protein J  60.78 
 
 
86 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0254  addiction module antitoxin  58.82 
 
 
86 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0259  addiction module antitoxin  58.82 
 
 
86 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0270  addiction module antitoxin component DinJ  58.82 
 
 
86 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.686864 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00225  hypothetical protein  58.82 
 
 
86 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3394  addiction module antitoxin  58.82 
 
 
86 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0238  addiction module antitoxin component DinJ  58.82 
 
 
86 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3381  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  58.82 
 
 
86 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00221  predicted antitoxin of YafQ-DinJ toxin-antitoxin system  58.82 
 
 
86 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4380  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  60.42 
 
 
95 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3825  DNA-damage-inducible protein J  58.82 
 
 
86 aa  60.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4999  addiction module antitoxin  62.5 
 
 
86 aa  60.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4297  addiction module antitoxin  62.5 
 
 
87 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000000082937  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6453  RelB antitoxin  62.5 
 
 
87 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0190461  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3908  addiction module antitoxin  58.33 
 
 
87 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.339882  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2158  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  62.5 
 
 
87 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2867  addiction module antitoxin  62.5 
 
 
87 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.041013  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36920  RelB antitoxin  54.17 
 
 
86 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4452  addiction module antitoxin  56.25 
 
 
63 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.128999  hitchhiker  0.00983141 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0833  DNA-damage-inducible protein J  54 
 
 
87 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.407516 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0379  DNA-damage-inducible protein J, putative  52.94 
 
 
64 aa  57  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2503  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  58.33 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3344  addiction module antitoxin  50.98 
 
 
109 aa  54.3  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0218664  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2034  RelB antitoxin  50 
 
 
91 aa  52  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3767  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  42.03 
 
 
90 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1299  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  48.94 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000279332  hitchhiker  0.000000000509211 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2916  hypothetical protein  60 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1589  DNA-damage-inducible protein J  48.94 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0499234  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0139  hypothetical protein  60 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0821  RelB/DinJ family addiction module antitoxin  53.66 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.83996 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0507  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  40.38 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.038501 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0966  hypothetical protein  51.28 
 
 
49 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00430801  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7599  hypothetical protein  52.78 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0150  hypothetical protein  28.16 
 
 
103 aa  47.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000721335  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4715  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.71 
 
 
80 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5118  addiction module antitoxin  54.76 
 
 
88 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.659791  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0434  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.71 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4700  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.71 
 
 
80 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.85974 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4795  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.71 
 
 
80 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4850  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.71 
 
 
80 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4829  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  35.71 
 
 
80 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1183  hypothetical protein  38.18 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.291195  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3180  hypothetical protein  62.96 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.588168  hitchhiker  0.000000131612 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1922  RelB antitoxin  52.38 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.119991  normal  0.0247415 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1496  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  45.1 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11400  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  30.99 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1995  hypothetical protein  59.26 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0257344  normal  0.0183843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2226  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  40.28 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0088475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2078  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  38.57 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0200075  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2071  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  38.57 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1874  addiction module antitoxin  52.08 
 
 
85 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  0.190999 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4262  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  38.57 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4226  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  38.57 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0058  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.963562  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1377  RelB antitoxin  36.73 
 
 
94 aa  43.9  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0852734  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4340  hypothetical protein  55.56 
 
 
62 aa  43.9  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0139  hypothetical protein  58.82 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.882218  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2863  addiction module antitoxin  43.48 
 
 
87 aa  43.5  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421266  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3445  addiction module antitoxin, RelB/DinJ family  27.17 
 
 
101 aa  43.5  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4468  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  39.44 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.791173  normal  0.577271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3169  hypothetical protein  48.89 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304276  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4331  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  39.44 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2279  hypothetical protein  51.52 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000345992  hitchhiker  0.00000000000000772672 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4396  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  39.44 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal  0.921307 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0017  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  38.57 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1068  addiction module antitoxin  33.82 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0145416  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4646  bifunctional antitoxin/transcriptional repressor RelB  39.44 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0742  CopG family transcriptional regulator  29.47 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.716439  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1257  hypothetical protein  48.48 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482621  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2510  RelB antitoxin  40.48 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.400211  normal  0.98229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1573  hypothetical protein  55.56 
 
 
60 aa  42  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.863098  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0435  DNA-damage-inducible protein J, putative  28.12 
 
 
97 aa  41.2  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0978363  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00557  hypothetical protein  51.61 
 
 
60 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0393  hypothetical protein  26.39 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00921245  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0747  putative toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix domain protein  35.29 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000814382 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0969  RelB protein  33.96 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1047  DNA-damage-inducible protein J  40 
 
 
94 aa  40  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532229  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>