More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2587 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2587  aminotransferase class V  100 
 
 		 377 aa  745    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.577396  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3263  aminotransferase class V  50.93 
 
 		 400 aa  329  4e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.867544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1312  aminotransferase, class V  49.72 
 
 		 387 aa  296  4e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.085766  normal  0.715303 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2108  aminotransferase class V  44.87 
 
 		 405 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44473  normal  0.0661399 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2842  aminotransferase, class V  48.78 
 
 		 390 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5849  aminotransferase class V  48.34 
 
 		 391 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.402198  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1901  aminotransferase class V  44.36 
 
 		 388 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2995  aminotransferase, class V  50 
 
 		 388 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0581835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5110  aminotransferase class V  48.97 
 
 		 391 aa  270  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400085 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2741  aminotransferase class V  48.06 
 
 		 390 aa  269  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4470  aminotransferase class V  52.32 
 
 		 424 aa  267  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.425504 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2434  cysteine desulfurase  46.6 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  46.13 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4456  aminotransferase class V  47.2 
 
 		 390 aa  260  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.259181  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2329  aminotransferase, class V  49.06 
 
 		 399 aa  259  6e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  45.87 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1665  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  49.31 
 
 		 393 aa  256  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.502772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4344  aminotransferase class V  45.5 
 
 		 390 aa  255  8e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3965  cysteine desulfurase  51.37 
 
 		 387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.707417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2884  cysteine desulfurase  46.22 
 
 		 373 aa  251  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2027  aminotransferase, class V  47.89 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159236  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0930  cysteine desulfurase, putative  42.78 
 
 		 392 aa  248  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0484195  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0924  putative cysteine desulfurase  42.78 
 
 		 392 aa  247  3e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0617  aminotransferase class V  48.31 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.314376  normal  0.0656763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1782  aminotransferase, class V  45.74 
 
 		 388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0097  aminotransferase class V  44.27 
 
 		 393 aa  245  9e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.765035 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2455  aminotransferase, class V  45.26 
 
 		 390 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  45.03 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2257  aminotransferase class V  42.23 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  42.19 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1609  aminotransferase class V  47.27 
 
 		 392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1469  aminotransferase class V  45.17 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.747649  normal  0.0112306 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  38.12 
 
 		 392 aa  239  6.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3976  aminotransferase class V  45.5 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  47.8 
 
 		 381 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  39.42 
 
 		 382 aa  236  6e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  39.22 
 
 		 400 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  37.24 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0693  aminotransferase class V  44.9 
 
 		 389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456582  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  39.25 
 
 		 392 aa  233  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  36.81 
 
 		 394 aa  229  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  36.55 
 
 		 394 aa  229  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  37.08 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0705  aminotransferase, class V  37.57 
 
 		 378 aa  228  2e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0675  aminotransferase, class V  43.66 
 
 		 385 aa  227  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00811405  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1175  aminotransferase class V  47.65 
 
 		 381 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3963  cysteine desulfurase  45.43 
 
 		 355 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0421265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1241  aminotransferase, class V  44.74 
 
 		 347 aa  226  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  37.21 
 
 		 394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  38.24 
 
 		 392 aa  226  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1048  aminotransferase, class V  45.29 
 
 		 381 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0809  aminotransferase, class V  41.47 
 
 		 382 aa  226  6e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  39.94 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  37.24 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  39.44 
 
 		 396 aa  224  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  37.95 
 
 		 388 aa  222  8e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  42.48 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  36.03 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  39.34 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  35.31 
 
 		 414 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  40.48 
 
 		 383 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  37.01 
 
 		 398 aa  219  5e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  36.34 
 
 		 398 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  36.34 
 
 		 398 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  38.42 
 
 		 409 aa  219  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  35.44 
 
 		 393 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  40 
 
 		 398 aa  218  8.999999999999998e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  37.5 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  38.9 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  40.74 
 
 		 383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  38.67 
 
 		 396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0809  aminotransferase, class V  36.92 
 
 		 382 aa  216  4e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0512399  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  36.39 
 
 		 381 aa  216  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1766  aminotransferase, class V  50.57 
 
 		 380 aa  216  7e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.101589  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  37.39 
 
 		 381 aa  215  8e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  39.5 
 
 		 384 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  41.21 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  41.21 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  40.83 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2179  cysteine desulfurase  34.82 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  34.17 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  36.84 
 
 		 381 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  37.31 
 
 		 388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  39.89 
 
 		 380 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2729  aminotransferase, class V  43.31 
 
 		 408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560546  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  37.57 
 
 		 401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  41.99 
 
 		 380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  38.59 
 
 		 389 aa  213  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  35.83 
 
 		 381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  40.93 
 
 		 403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2352  aminotransferase class V  35.77 
 
 		 388 aa  213  5.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  36.02 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  36.11 
 
 		 381 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  36.11 
 
 		 381 aa  212  7e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  40.93 
 
 		 403 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  38.42 
 
 		 388 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  35.9 
 
 		 397 aa  212  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  37.67 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  39.67 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  35.83 
 
 		 381 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>