More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0796 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1061  citrate lyase, subunit 1  87.19 
 
 
398 aa  731    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0796  citrate lyase, subunit 1  100 
 
 
398 aa  810    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.620183  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1089  ATP-grasp domain protein  85.43 
 
 
399 aa  706    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.520899  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1307  ATP citrate lyase subunit 1  88.19 
 
 
398 aa  737    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.810397  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1350  ATP-grasp domain protein  84.42 
 
 
398 aa  704    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1392  ATP-grasp domain protein  89.45 
 
 
398 aa  744    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.254868  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1232  ATP-grasp domain protein  88.69 
 
 
398 aa  733    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1056  ATP citrate synthase, subunit 1  35.24 
 
 
435 aa  171  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00742266  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54477  atp-citrate synthase  33.25 
 
 
1082 aa  161  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00800  conserved hypothetical protein  32.84 
 
 
1149 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0570  ATP-dependent citrate lyase beta subunit  31.55 
 
 
444 aa  152  8e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02435  citrate lyase subunit (Eurofung)  31.6 
 
 
485 aa  152  8.999999999999999e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.031235  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1267  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  30.89 
 
 
423 aa  133  5e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0986  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  28.84 
 
 
368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000000927253  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2086  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.19 
 
 
382 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  28.07 
 
 
389 aa  113  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2396  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  31.65 
 
 
375 aa  112  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000351393  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  28.32 
 
 
392 aa  107  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1220  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  26.88 
 
 
377 aa  106  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.23479  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3930  succinyl-CoA synthetase subunit beta  28.42 
 
 
379 aa  106  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0293  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  28.21 
 
 
337 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  27.2 
 
 
410 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2207  succinyl-CoA synthetase subunit beta  28.72 
 
 
381 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.499624 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  28.39 
 
 
392 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  27.27 
 
 
379 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  27.76 
 
 
391 aa  102  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4214  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  28.43 
 
 
403 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3089  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  28.01 
 
 
425 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000498843  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0397  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  30.03 
 
 
417 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.254112  normal  0.0232854 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0671  succinyl-CoA synthetase subunit beta  28.79 
 
 
388 aa  102  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.131482 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1367  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.37 
 
 
378 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  29.01 
 
 
390 aa  100  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  27.95 
 
 
390 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1562  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  27.74 
 
 
362 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0357  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  28.83 
 
 
362 aa  99.8  8e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0021079 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0479  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  29.09 
 
 
362 aa  99.4  9e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0289  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  28.42 
 
 
382 aa  99.4  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0043  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  28.23 
 
 
360 aa  98.6  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0438  succinyl-CoA synthetase subunit beta  28.27 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0060  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  26.81 
 
 
393 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156365 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2717  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.55 
 
 
387 aa  97.1  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1243  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  27.69 
 
 
393 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766366  hitchhiker  0.00547287 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  28.39 
 
 
391 aa  96.7  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4569  succinyl-CoA synthetase subunit beta  28.76 
 
 
378 aa  96.7  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0102197  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1740  succinyl-CoA synthase, beta subunit  26.13 
 
 
389 aa  95.9  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0062076  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2062  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  30.1 
 
 
384 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07260  succinate-CoA ligase (ADP-forming), putative  27.86 
 
 
418 aa  95.5  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1026  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.05 
 
 
382 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000227763  unclonable  8.1657e-23 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1996  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  28.17 
 
 
398 aa  94.7  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0808  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  32.23 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0604  succinyl-CoA synthetase subunit beta  27.57 
 
 
392 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  28.04 
 
 
392 aa  94.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1058  succinyl-CoA synthetase subunit beta  27.83 
 
 
385 aa  94.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161245  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0654  succinyl-CoA synthetase subunit beta  28.46 
 
 
393 aa  94.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.308517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3999  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.04 
 
 
411 aa  94  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00455857  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0380  succinyl-CoA synthetase subunit beta  27.3 
 
 
392 aa  94  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1694  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  27.9 
 
 
395 aa  94  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4221  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  25.2 
 
 
396 aa  93.6  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.687915  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0430  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  25.67 
 
 
362 aa  93.6  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.147024  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5543  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  29.14 
 
 
384 aa  93.2  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  27.99 
 
 
383 aa  92.8  9e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43950  succinyl-CoA synthetase subunit beta  28.44 
 
 
388 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0993593  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4482  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  27.73 
 
 
389 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3998  succinyl-CoA synthetase subunit beta  28.31 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0030268  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0319  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  27 
 
 
382 aa  92.4  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0729  succinyl-CoA synthetase subunit beta  27.19 
 
 
385 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000827995  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0815  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.54 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04270  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.77 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0981  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  26.83 
 
 
405 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23259  normal  0.387246 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0456  succinyl-CoA synthetase subunit beta  29.26 
 
 
400 aa  91.3  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00206405  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08536  Succinyl-CoA synthetase, beta subunit  28.27 
 
 
397 aa  91.3  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2714  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.2 
 
 
382 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0773834 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4424  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  32.6 
 
 
387 aa  90.9  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.780368  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3509  succinyl-CoA synthetase subunit beta  28.53 
 
 
388 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.019231  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3686  succinyl-CoA synthetase subunit beta  28.13 
 
 
388 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  27.1 
 
 
392 aa  90.5  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1463  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.2 
 
 
379 aa  90.5  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0737  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  29.43 
 
 
385 aa  90.5  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0979  succinyl-CoA synthetase subunit beta  29.34 
 
 
387 aa  90.1  5e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  27.74 
 
 
386 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0932  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.27 
 
 
389 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  27.97 
 
 
386 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09090  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.13 
 
 
389 aa  89.7  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2178  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  30.12 
 
 
387 aa  89.7  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.84529  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4186  succinyl-CoA synthetase subunit beta  28.22 
 
 
388 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146804  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0841  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  28.38 
 
 
361 aa  89.7  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2537  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  26.96 
 
 
393 aa  89.4  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1668  succinyl-CoA synthetase subunit beta  28.22 
 
 
388 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.11525  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2202  succinyl-CoA synthase, beta subunit  27.24 
 
 
388 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00971799  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2012  succinyl-CoA synthetase subunit beta  27.24 
 
 
388 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0148  succinyl-CoA synthetase subunit beta  28.06 
 
 
386 aa  89.4  1e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0183836  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1730  succinyl-CoA synthetase subunit beta  27.32 
 
 
397 aa  89  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0208  succinyl-CoA synthetase subunit beta  22.87 
 
 
386 aa  88.2  2e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1617  succinyl-CoA synthetase subunit beta  27.55 
 
 
388 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3170  succinyl-CoA synthetase subunit beta  27.33 
 
 
399 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7987  succinyl-CoA synthetase subunit beta  26.78 
 
 
392 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0931  succinyl-CoA synthetase subunit beta  27.81 
 
 
398 aa  87.8  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1911  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  28.14 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0154  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  26.3 
 
 
400 aa  87.4  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306338  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1657  succinyl-CoA synthetase subunit beta  25.98 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.231909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>