More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3642 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
145 aa  292  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  46.77 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  41.03 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 
143 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  39.66 
 
 
165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  39.66 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  39.66 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  40.17 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  39.66 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  39.66 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  39.66 
 
 
144 aa  108  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  39.66 
 
 
144 aa  108  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 
144 aa  107  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  41.22 
 
 
137 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  43.18 
 
 
142 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 
138 aa  106  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  38.79 
 
 
144 aa  104  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  41.67 
 
 
138 aa  104  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  38.79 
 
 
144 aa  104  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  39.1 
 
 
146 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  44.8 
 
 
143 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
145 aa  101  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  43.65 
 
 
145 aa  100  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  44 
 
 
143 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  44 
 
 
143 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  39.69 
 
 
135 aa  99.8  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  36.57 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  38.97 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  42.11 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 
149 aa  97.1  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  37.96 
 
 
140 aa  96.7  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  37.96 
 
 
140 aa  96.7  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1532  histidine triad (HIT) protein  41.54 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  0.453293 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  36.23 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  42.45 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  36.11 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4085  putative HIT family protein  42.24 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47340  putative HIT family protein  42.24 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  42.15 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  34.85 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  45.05 
 
 
141 aa  94.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  38.58 
 
 
142 aa  94.4  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  35.9 
 
 
139 aa  94  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6595  histidine triad (HIT) protein  39.57 
 
 
148 aa  94  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  39.81 
 
 
139 aa  94  7e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  36.15 
 
 
136 aa  93.6  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  34.4 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl245  putative nucleotidyl hydrolase/transferase  33.08 
 
 
135 aa  92  3e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  40.16 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  41.48 
 
 
141 aa  91.7  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3316  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3046  histidine triad (HIT) protein  40.3 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  39.64 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  39.02 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1292  histidine triad (HIT) protein  38.06 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268815  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  34.81 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  32.59 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  41.44 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  37.8 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  36.21 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  41.12 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  32.12 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  38.58 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4754  hypothetical protein  40.98 
 
 
141 aa  89.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419636  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  34.33 
 
 
145 aa  88.6  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 
141 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  34.04 
 
 
149 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  41.28 
 
 
143 aa  88.2  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2542  histidine triad (HIT) protein  38.94 
 
 
174 aa  88.2  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0492  HIT family protein  40.37 
 
 
138 aa  87  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  34.82 
 
 
149 aa  87  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3536  histidine triad (HIT) protein  42.25 
 
 
144 aa  86.7  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.806394 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  37.39 
 
 
139 aa  86.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  40.74 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  32.06 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  27.69 
 
 
131 aa  86.7  1e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  39.45 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  39.45 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  39.45 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0238  HIT family protein  39.45 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  39.45 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1614  histidine triad (HIT) protein  39.85 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  38.39 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2703  HIT family protein  39.45 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  39.45 
 
 
138 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  40.74 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  40.16 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  37.21 
 
 
139 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  37.61 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 
139 aa  84  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  35.77 
 
 
144 aa  84  7e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  41.13 
 
 
149 aa  83.6  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  35.4 
 
 
140 aa  83.6  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 
133 aa  83.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0919  histidine triad (HIT) protein  41.44 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420438  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1664  histidine triad (HIT) protein  40.15 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.147901  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1499  histidine triad (HIT) protein  36.84 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.348624  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>