More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2579 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2579  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
503 aa  979    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.214107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2202  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  40.37 
 
 
483 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5071  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 
496 aa  267  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6839  acyl-CoA synthetase  38.41 
 
 
503 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189698  normal  0.806841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3344  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  38.35 
 
 
925 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0408204 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  29.56 
 
 
582 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 
514 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29 
 
 
561 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29 
 
 
561 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29 
 
 
561 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29 
 
 
561 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  28.73 
 
 
587 aa  153  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3772  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  29.46 
 
 
531 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.910601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.81 
 
 
561 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  28.88 
 
 
540 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  31.12 
 
 
511 aa  150  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  29.78 
 
 
565 aa  150  7e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  30.04 
 
 
516 aa  149  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.97 
 
 
503 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 
520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.04 
 
 
561 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  27.86 
 
 
561 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.86 
 
 
561 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.86 
 
 
561 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.86 
 
 
561 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  27.86 
 
 
561 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0237  AMP-dependent synthetase and ligase  34.34 
 
 
602 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280787 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  27.88 
 
 
583 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.88 
 
 
583 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 
511 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 
570 aa  147  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 
551 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.68 
 
 
561 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  29.18 
 
 
504 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  28.1 
 
 
512 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  31.32 
 
 
502 aa  145  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  26.73 
 
 
559 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  28.54 
 
 
523 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.17 
 
 
572 aa  143  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  28.74 
 
 
510 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  28.49 
 
 
520 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  27.18 
 
 
521 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 
532 aa  142  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.54 
 
 
572 aa  142  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  26.94 
 
 
561 aa  141  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4908  AMP-dependent synthetase and ligase  27.84 
 
 
512 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.96823  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 
499 aa  140  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2153  AMP-dependent synthetase and ligase  29.95 
 
 
591 aa  139  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  29.78 
 
 
520 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 
521 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  28.32 
 
 
514 aa  139  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  29.43 
 
 
525 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 
501 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 
508 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.31 
 
 
514 aa  138  3.0000000000000003e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 
553 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.737985 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  29.79 
 
 
531 aa  137  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330906 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  27.02 
 
 
601 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.455088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 
553 aa  137  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2101  AMP-dependent synthetase and ligase  28.81 
 
 
543 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197388  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  27.93 
 
 
569 aa  136  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  25.75 
 
 
550 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  28.09 
 
 
517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  30.62 
 
 
503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0558  AMP-dependent synthetase and ligase  26.69 
 
 
584 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 
532 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  27.08 
 
 
515 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19550  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.4 
 
 
533 aa  134  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  25.2 
 
 
662 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  26.97 
 
 
599 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180137  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4746  putative o-succinylbenzoate--CoA synthetase  30.68 
 
 
601 aa  134  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2231  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.14 
 
 
572 aa  134  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00224599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 
507 aa  134  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  27.19 
 
 
549 aa  134  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 
527 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  27.05 
 
 
549 aa  134  5e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4086  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 
527 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432912  normal  0.782905 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0209  AMP-dependent synthetase and ligase  29.02 
 
 
526 aa  134  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0775  AMP-dependent synthetase and ligase  30.58 
 
 
583 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4481  AMP-dependent synthetase and ligase  29.26 
 
 
506 aa  133  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.8 
 
 
529 aa  133  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 
508 aa  133  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 
770 aa  133  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  31.04 
 
 
508 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.25 
 
 
491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 
561 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  29.03 
 
 
522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  25.79 
 
 
557 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  29.59 
 
 
528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2778  putative long chain fatty-acid CoA ligase(long- chain acyl-CoA synthetase)  26.68 
 
 
604 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422591  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  27.05 
 
 
549 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  28.71 
 
 
508 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  29.61 
 
 
509 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3836  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.67 
 
 
562 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.77 
 
 
525 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 
512 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.1 
 
 
492 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  29.45 
 
 
512 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  33.48 
 
 
518 aa  131  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  29.75 
 
 
509 aa  131  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>