More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0904 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 254 aa  494  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  68.22 
 
 		 237 aa  298  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  59.15 
 
 		 227 aa  255  5e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  56.12 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.47 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  54.47 
 
 		 231 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  54.47 
 
 		 231 aa  240  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  54.47 
 
 		 230 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  54.47 
 
 		 230 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  54.47 
 
 		 230 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.22 
 
 		 229 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  54.31 
 
 		 230 aa  232  5e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.87 
 
 		 229 aa  229  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  54.66 
 
 		 235 aa  223  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.43 
 
 		 224 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 228 aa  218  7.999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.36 
 
 		 228 aa  216  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.72 
 
 		 224 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  53.42 
 
 		 234 aa  211  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  52.36 
 
 		 232 aa  211  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.72 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  48.15 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.27 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 239 aa  208  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  53.45 
 
 		 228 aa  208  9e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  53.45 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.38 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  46.41 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  46.03 
 
 		 252 aa  206  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 223 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  51.91 
 
 		 224 aa  205  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  47.68 
 
 		 406 aa  205  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  51.28 
 
 		 224 aa  205  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.74 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  48.51 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 224 aa  201  7e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.96 
 
 		 240 aa  201  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0468  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.16 
 
 		 223 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  45.76 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.18 
 
 		 242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  44.17 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  44.87 
 
 		 227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  44.87 
 
 		 227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  44.87 
 
 		 227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.3 
 
 		 236 aa  198  7e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.68 
 
 		 239 aa  198  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  44.35 
 
 		 257 aa  197  9e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  46.84 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  47.08 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  50.86 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.84 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0228  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.85 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.41 
 
 		 225 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1090  DNA-binding response regulator  43.83 
 
 		 228 aa  195  7e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00019826  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.07 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  45.26 
 
 		 223 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  48.72 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  42.74 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.78 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.68 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 		 227 aa  192  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  43.4 
 
 		 224 aa  191  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  43.4 
 
 		 224 aa  191  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 229 aa  191  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.93 
 
 		 254 aa  191  9e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  48.95 
 
 		 246 aa  191  9e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  44.86 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1345  response regulator receiver  40.68 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.71904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.46 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  45.49 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.51 
 
 		 243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  42.92 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.97 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  45.19 
 
 		 237 aa  189  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.57 
 
 		 273 aa  189  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  42.55 
 
 		 224 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 		 244 aa  188  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  42.5 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.38 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.32 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  42.13 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  42.13 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.39 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  47.21 
 
 		 283 aa  186  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  42.06 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.43 
 
 		 232 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.13 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.88 
 
 		 245 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  41.39 
 
 		 243 aa  186  4e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  42.06 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>