More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4832 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4832  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 
365 aa  744    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04032  gamma-glutamyl kinase  51.09 
 
 
365 aa  365  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4269  gamma-glutamyl kinase  48.77 
 
 
365 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4146  gamma-glutamyl kinase  44.48 
 
 
368 aa  315  7e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2721  gamma-glutamyl kinase  41.92 
 
 
385 aa  303  4.0000000000000003e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00343  gamma-glutamyl kinase  42.28 
 
 
384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000428896  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01674  gamma-glutamyl kinase  44.1 
 
 
369 aa  295  9e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000140445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3014  gamma-glutamyl kinase  46.06 
 
 
366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0763  gamma-glutamyl kinase  45.92 
 
 
368 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3848  gamma-glutamyl kinase  45.54 
 
 
368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3941  gamma-glutamyl kinase  45.54 
 
 
368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4056  gamma-glutamyl kinase  45.54 
 
 
368 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0082  gamma-glutamyl kinase  43.06 
 
 
366 aa  281  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0290  gamma-glutamyl kinase  43.13 
 
 
384 aa  280  2e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000240512  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4424  gamma-glutamyl kinase  41.71 
 
 
366 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4284  gamma-glutamyl kinase  41.71 
 
 
366 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4237  gamma-glutamyl kinase  41.71 
 
 
366 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0320  gamma-glutamyl kinase  43.13 
 
 
384 aa  279  6e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00950173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  41.48 
 
 
373 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0116  gamma-glutamyl kinase  41.16 
 
 
366 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  38.48 
 
 
379 aa  272  7e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  38.38 
 
 
372 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  38.25 
 
 
372 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  38.25 
 
 
372 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  38.25 
 
 
372 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  38.25 
 
 
372 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  37.47 
 
 
372 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0150  gamma-glutamyl kinase  44.04 
 
 
369 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  38.38 
 
 
372 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  37.23 
 
 
374 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  38.96 
 
 
371 aa  266  5e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  39.18 
 
 
373 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  39.51 
 
 
376 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  37.23 
 
 
369 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  39.73 
 
 
393 aa  262  6.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  39.45 
 
 
367 aa  262  6.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  37.64 
 
 
363 aa  259  6e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1121  gamma-glutamyl kinase  38.52 
 
 
372 aa  253  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  38.02 
 
 
367 aa  252  6e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  38.9 
 
 
373 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  37.57 
 
 
367 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  37.57 
 
 
367 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  37.57 
 
 
367 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  37.57 
 
 
367 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  37.57 
 
 
367 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01162  gamma-glutamyl kinase  39.23 
 
 
379 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  36.31 
 
 
370 aa  250  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  38.52 
 
 
372 aa  250  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  37.74 
 
 
367 aa  249  4e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  37.74 
 
 
367 aa  249  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  37.74 
 
 
367 aa  249  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  37.74 
 
 
367 aa  249  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  37.74 
 
 
367 aa  249  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004268  glutamate 5-kinase  39.23 
 
 
379 aa  249  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  37.74 
 
 
367 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  37.74 
 
 
367 aa  249  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0954  gamma-glutamyl kinase  37.98 
 
 
372 aa  249  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.458593  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  37.74 
 
 
367 aa  249  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  37.74 
 
 
367 aa  249  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0952  gamma-glutamyl kinase  37.98 
 
 
372 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208466  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0990  gamma-glutamyl kinase  37.98 
 
 
372 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1080  glutamate 5-kinase  36.84 
 
 
377 aa  248  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.068481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  37.36 
 
 
390 aa  247  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1864  gamma-glutamyl kinase  38.12 
 
 
377 aa  246  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000076218  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  36.74 
 
 
369 aa  245  6.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0344  gamma-glutamyl kinase  37.7 
 
 
376 aa  243  3e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000011704  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  36.19 
 
 
370 aa  242  7e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  37.87 
 
 
373 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  36.89 
 
 
367 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1467  gamma-glutamyl kinase  37.29 
 
 
368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.148048  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3431  gamma-glutamyl kinase  38.25 
 
 
367 aa  240  4e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00966992  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  38.08 
 
 
372 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1479  glutamate 5-kinase  37.26 
 
 
385 aa  239  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  34.62 
 
 
372 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  36.16 
 
 
376 aa  239  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0900  gamma-glutamyl kinase  37.77 
 
 
367 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3284  gamma-glutamyl kinase  37.98 
 
 
367 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  37.6 
 
 
373 aa  237  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3807  gamma-glutamyl kinase  36.99 
 
 
369 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0507753  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  37.16 
 
 
378 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  37.81 
 
 
372 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  37.53 
 
 
374 aa  237  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0252  gamma-glutamyl kinase  36.78 
 
 
376 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203212  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0935  gamma-glutamyl kinase  38.8 
 
 
367 aa  237  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  37.6 
 
 
373 aa  236  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1670  gamma-glutamyl kinase  37.91 
 
 
367 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  36.99 
 
 
368 aa  236  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3875  gamma-glutamyl kinase  37.13 
 
 
389 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0186948 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0192  gamma-glutamyl kinase  38.5 
 
 
370 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.266887  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  38.74 
 
 
372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2670  glutamate 5-kinase  35.15 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4199  gamma-glutamyl kinase  37.13 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.229237  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  37.36 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2197  gamma-glutamyl kinase  36.19 
 
 
367 aa  233  3e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.408107 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  36.26 
 
 
373 aa  233  3e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  36.81 
 
 
374 aa  233  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0443  gamma-glutamyl kinase  36.24 
 
 
379 aa  233  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2953  gamma-glutamyl kinase  37.85 
 
 
378 aa  233  5e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.839271  normal  0.0806681 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2649  gamma-glutamyl kinase  37.81 
 
 
372 aa  232  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124742  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3150  gamma-glutamyl kinase  36.89 
 
 
367 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.384204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>