More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4182 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  100 
 
 		 364 aa  747    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0056  glycosyl transferase, group 1  65.16 
 
 		 358 aa  473  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03358  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  62.54 
 
 		 362 aa  454  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  54.87 
 
 		 349 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2117  glycosyl transferase, group 1  40 
 
 		 362 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  36.77 
 
 		 351 aa  223  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  34.93 
 
 		 349 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2977  glycosyl transferase group 1  35.59 
 
 		 352 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.179436  normal  0.153707 
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  35.98 
 
 		 354 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  35.98 
 
 		 354 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3128  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  35.6 
 
 		 367 aa  213  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.360612  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  33.52 
 
 		 348 aa  212  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5673  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  37.54 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.108379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  35.67 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1661  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 		 340 aa  207  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.781616  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0722  glycosyl transferase, group 1  35.65 
 
 		 357 aa  202  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0042  glycosyl transferase, group 1  36.24 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2716  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 		 352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0032  glycosyl transferase, group 1  36.52 
 
 		 344 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 360 aa  193  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0983  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase lpcC  34.1 
 
 		 352 aa  186  7e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.327737  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 		 378 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 		 377 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 377 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  26.05 
 
 		 383 aa  93.6  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 		 375 aa  93.2  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 394 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 		 377 aa  89.7  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1107  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 396 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 748 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 378 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 375 aa  86.7  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 		 360 aa  86.7  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 		 413 aa  86.3  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 		 403 aa  85.9  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.9 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  21.79 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  38.6 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 		 452 aa  84  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  37.12 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1212  TatD family deoxyribonuclease  32.07 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0798  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 391 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 		 398 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  25.19 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  27.11 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.46 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  28.4 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.88 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 434 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0735  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0112  UDP-sugar hydrolase  27.27 
 
 		 367 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.45 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  24.64 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.45 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  31.45 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.89 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  31.45 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  24.52 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.45 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.87 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  31.45 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  26.15 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.87 
 
 		 498 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.87 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2177  putative glycosyl transferase  30 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.010709  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  30.68 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  27.53 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.87 
 
 		 499 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>