More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3981 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3981  sensor histidine kinase  100 
 
 		 738 aa  1516    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2192  sensor histidine kinase  50.71 
 
 		 687 aa  692    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.43 
 
 		 722 aa  731    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03558  putative sensor histidine kinase  47.29 
 
 		 722 aa  665    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2121  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.01 
 
 		 725 aa  728    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355217  normal  0.132598 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1790  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.93 
 
 		 723 aa  708    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0621858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2519  histidine kinase  53.12 
 
 		 728 aa  746    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2451  histidine kinase  51.43 
 
 		 722 aa  731    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0542472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.36 
 
 		 719 aa  727    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.66 
 
 		 738 aa  738    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.33918  normal  0.73238 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2006  sensor histidine kinase  50.27 
 
 		 719 aa  725    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3919  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.91 
 
 		 750 aa  682    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681981  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2203  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.23 
 
 		 719 aa  729    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2280  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.23 
 
 		 719 aa  729    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.372267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1622  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.95 
 
 		 723 aa  734    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.43 
 
 		 722 aa  732    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.856072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.43 
 
 		 722 aa  731    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2413  ATPase domain-containing protein  51.09 
 
 		 719 aa  729    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0954524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1015  sensor histidine kinase  30.38 
 
 		 690 aa  282  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3686  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 678 aa  180  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1202  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 519 aa  145  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.868764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 		 616 aa  102  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2011  putative sensor histidine kinase BvrS  23.02 
 
 		 589 aa  100  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128135  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  25.35 
 
 		 616 aa  100  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 		 605 aa  100  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  25.35 
 
 		 616 aa  100  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  22.82 
 
 		 601 aa  98.2  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.16 
 
 		 615 aa  95.5  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 597 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.13 
 
 		 601 aa  94.4  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5434  histidine kinase  24.65 
 
 		 605 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212441  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.58 
 
 		 607 aa  92  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 602 aa  90.9  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.541285 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  23.26 
 
 		 564 aa  90.5  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.33 
 
 		 578 aa  90.1  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 627 aa  89.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 		 465 aa  88.6  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.39 
 
 		 549 aa  88.2  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.64 
 
 		 574 aa  87.8  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 		 611 aa  87  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.96 
 
 		 572 aa  86.3  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2048  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.63 
 
 		 501 aa  85.9  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  21.58 
 
 		 611 aa  85.5  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0596  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.62 
 
 		 566 aa  84.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.85 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.22 
 
 		 596 aa  84.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0045  two-component sensor histidine kinase protein  23.11 
 
 		 590 aa  83.2  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.5 
 
 		 599 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.927229  normal  0.192666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.76 
 
 		 563 aa  84  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0162025 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 		 577 aa  84  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.361958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0360  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.25 
 
 		 581 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340361  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.24 
 
 		 592 aa  81.6  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.14941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 		 466 aa  80.1  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0903  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 		 468 aa  80.1  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211263  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.26 
 
 		 529 aa  80.1  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0202652  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  22.84 
 
 		 596 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.37 
 
 		 589 aa  79.7  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0190  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.85 
 
 		 487 aa  79.3  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.482621 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1333  sensor histidine kinase BvrS  23.5 
 
 		 607 aa  80.1  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.642449  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  23.45 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1308  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  24.23 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0075  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.64 
 
 		 540 aa  78.2  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5480  histidine kinase  22.49 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23 
 
 		 559 aa  77.4  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7368  signal transduction histidine kinase  21.53 
 
 		 605 aa  77.4  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.19 
 
 		 469 aa  77.4  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  22.97 
 
 		 474 aa  76.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.1 
 
 		 525 aa  76.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  24.29 
 
 		 458 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  25.08 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2176  hypothetical protein  26.07 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01831  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2665  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.13 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11798  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  22.88 
 
 		 1162 aa  74.7  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  21.57 
 
 		 468 aa  74.7  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  24.65 
 
 		 480 aa  74.3  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.28 
 
 		 465 aa  73.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1248  histidine kinase  23.88 
 
 		 458 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0335979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.79 
 
 		 613 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1682  two-component sensor histidine kinase  22.46 
 
 		 572 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1447  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.4 
 
 		 486 aa  72.8  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  22.29 
 
 		 518 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0315  histidine kinase  22.46 
 
 		 572 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.29 
 
 		 518 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3715  sensor histidine kinase  21.52 
 
 		 536 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0148032 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2971  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  23.39 
 
 		 455 aa  72  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  26.17 
 
 		 465 aa  72  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 459 aa  72  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1737  histidine kinase  23.33 
 
 		 633 aa  72  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181813  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.25 
 
 		 462 aa  72  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06113  histidine kinase  24.38 
 
 		 446 aa  72  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2564  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.01 
 
 		 550 aa  71.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754787  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  22.46 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  21.85 
 
 		 566 aa  71.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1664  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  23 
 
 		 633 aa  71.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0956689  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1092  Signal transduction histidine kinase  23.17 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0028584  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0235  ATP-binding region, ATPase-like protein  24.14 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21.98 
 
 		 488 aa  70.9  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2933  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.51 
 
 		 806 aa  70.9  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.907124  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>