59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2873 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  624  1e-178  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  28.37 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  29.52 
 
 		 283 aa  122  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  30.12 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  32.1 
 
 		 281 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  33.33 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4308  putative dienelactone hydrolase family protein, putative signal peptide  29.6 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  24 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  30.23 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  28.06 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  28.22 
 
 		 320 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  26.79 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  27.14 
 
 		 349 aa  85.9  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  27.64 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  25.2 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  26.34 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  27.62 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  25.19 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  25.3 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  27.57 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  25.38 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  24.4 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  24.56 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  29.41 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1217  dienelactone hydrolase domain-containing protein  27.81 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  26.04 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0643  dienelactone hydrolase  25.11 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.424944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7027  hypothetical protein  24.8 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00368212  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0055  putative signal peptide protein  24.17 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.250308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  24.41 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  30.36 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5814  hypothetical protein  27.66 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.482605  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  21 
 
 		 263 aa  52.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  23.76 
 
 		 250 aa  52.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  27.88 
 
 		 263 aa  50.4  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1409  dipeptidyl-peptidase IV  42.62 
 
 		 754 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  23.79 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0738  dienelactone hydrolase  23.2 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.303831  normal  0.797206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  22.78 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  24.26 
 
 		 245 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  23.64 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  23.64 
 
 		 242 aa  46.2  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  24.76 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0328  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.83 
 
 		 800 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3272  dienelactone hydrolase  24.32 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2106  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  41.07 
 
 		 751 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1095  hypothetical protein  28.87 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.103267 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  24.35 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  29.2 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4116  dienelactone hydrolase  22.12 
 
 		 335 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0198407  normal  0.0302336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  24.5 
 
 		 241 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  20.85 
 
 		 263 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  21.25 
 
 		 262 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_002950  PG1361  dipeptidyl aminopeptidase IV, putative  24 
 
 		 732 aa  43.1  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  24.76 
 
 		 324 aa  43.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84390  dipeptidyl aminopeptidase B  34.92 
 
 		 852 aa  42.7  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.309155  normal  0.832688 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  22.99 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0541  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.12 
 
 		 518 aa  42.7  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.429802  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0914  dienelactone hydrolase  27.46 
 
 		 255 aa  42.4  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.177135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>