201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN00510 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006683  CNN00510  L-fucose permease, putative  100 
 
 
929 aa  1906    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04378  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06630)  39.87 
 
 
885 aa  311  4e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580996  normal  0.307389 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58479  L-fucose permease Glucose/galactose transporter  31.53 
 
 
372 aa  189  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.851861  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05742  l-fucose permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06730)  31.56 
 
 
459 aa  186  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.227595 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  30.98 
 
 
468 aa  163  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  29.85 
 
 
409 aa  161  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  27.92 
 
 
417 aa  131  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  28.81 
 
 
420 aa  128  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  28.16 
 
 
417 aa  127  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  26.53 
 
 
432 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  27.36 
 
 
412 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  27.96 
 
 
417 aa  124  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  29.27 
 
 
399 aa  124  9e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  26.49 
 
 
417 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  28.07 
 
 
389 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  28.99 
 
 
428 aa  122  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  28.72 
 
 
425 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  29.08 
 
 
413 aa  120  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  27.48 
 
 
425 aa  119  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  27.25 
 
 
437 aa  119  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  27.32 
 
 
413 aa  119  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  26.83 
 
 
414 aa  118  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  28.84 
 
 
435 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  26.79 
 
 
412 aa  115  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  25.91 
 
 
424 aa  115  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  26.84 
 
 
438 aa  115  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  27.11 
 
 
438 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  27.11 
 
 
438 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  26.84 
 
 
438 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  26.84 
 
 
438 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  27.11 
 
 
438 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  27.11 
 
 
438 aa  114  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  26.84 
 
 
438 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  26.84 
 
 
438 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  27.37 
 
 
438 aa  114  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  27.11 
 
 
438 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  26.36 
 
 
425 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07774  integral membrane protein Pth11-like, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06620)  27.04 
 
 
348 aa  112  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  25.2 
 
 
423 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  25.2 
 
 
423 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  25.2 
 
 
423 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  25.2 
 
 
423 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  25.2 
 
 
423 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  26.87 
 
 
411 aa  109  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01930  integral membrane protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07820)  22.65 
 
 
360 aa  108  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.269974  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  27.45 
 
 
433 aa  108  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  26.44 
 
 
435 aa  106  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  24.82 
 
 
431 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  25.98 
 
 
418 aa  105  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  24.44 
 
 
431 aa  105  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  26.41 
 
 
418 aa  105  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  25.33 
 
 
423 aa  105  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  25.59 
 
 
426 aa  103  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  25.56 
 
 
426 aa  101  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02249  integral membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G06670)  23.93 
 
 
439 aa  101  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00434779  normal  0.978054 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  24.87 
 
 
407 aa  101  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  23.06 
 
 
443 aa  101  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  25.6 
 
 
423 aa  101  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  25.6 
 
 
423 aa  100  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  24.34 
 
 
421 aa  99.8  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  26.42 
 
 
427 aa  99.4  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  24.2 
 
 
429 aa  98.6  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  24.34 
 
 
415 aa  98.6  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  25 
 
 
415 aa  98.2  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  24.67 
 
 
421 aa  98.2  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  24.47 
 
 
431 aa  98.2  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  24.33 
 
 
431 aa  97.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01738  conserved hypothetical protein  28.98 
 
 
343 aa  97.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505085  normal  0.192552 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1420  major facilitator transporter  30.77 
 
 
514 aa  97.4  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  25.27 
 
 
415 aa  97.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  23.94 
 
 
431 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  24.27 
 
 
420 aa  96.3  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  23.56 
 
 
436 aa  96.7  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  26.37 
 
 
434 aa  96.3  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1052  L-fucose permease  26.09 
 
 
444 aa  95.9  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.682471  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  25.17 
 
 
408 aa  95.5  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  25.36 
 
 
440 aa  95.5  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  26.2 
 
 
438 aa  95.5  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  25.63 
 
 
408 aa  94.7  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  23.73 
 
 
457 aa  94.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  23.73 
 
 
457 aa  94.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1447  L-fucose permease  24.24 
 
 
430 aa  94.7  7e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300963  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  23.73 
 
 
457 aa  94.7  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  25.17 
 
 
485 aa  94.4  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  25 
 
 
428 aa  94  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  23.2 
 
 
424 aa  92.8  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  25.13 
 
 
403 aa  92.4  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  23.96 
 
 
457 aa  92.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  23.15 
 
 
435 aa  92.8  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1614  fucose permease  22.92 
 
 
448 aa  92.4  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139111  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  22.46 
 
 
428 aa  91.3  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  23.63 
 
 
419 aa  90.9  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  24.69 
 
 
448 aa  89.7  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00178  PTH11-like integral membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G11245)  27.78 
 
 
287 aa  88.6  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  24.15 
 
 
443 aa  88.6  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  23.42 
 
 
436 aa  88.2  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  24.3 
 
 
421 aa  88.2  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02386  integral membrane protein (Pth11), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05120)  25.25 
 
 
362 aa  87.8  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  24.42 
 
 
413 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  25.36 
 
 
429 aa  86.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>