143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH00180 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH00180  SD08430p, putative  100 
 
 
587 aa  1189    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.026528  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04836  SD08430p (AFU_orthologue; AFUA_3G07290)  42.57 
 
 
576 aa  453  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33225  Acetyl-CoA transporter  42.61 
 
 
560 aa  417  9.999999999999999e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.568918  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54049  acetyl-coa transporter  30.95 
 
 
646 aa  230  5e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.511026  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13668  MFS family transporter: acetyl-CoA  30.92 
 
 
438 aa  217  5e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00275578  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  34.59 
 
 
465 aa  75.5  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  34.48 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  34.57 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0848  major facilitator transporter  33.97 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  33.1 
 
 
415 aa  72  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  33.1 
 
 
415 aa  72  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  33.1 
 
 
415 aa  72  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2158  hypothetical protein  31.94 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09380  putative transporter  35.03 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000449575  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0886  RhtX/FptX family siderophore transporter  31.94 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0796  RhtX/FptX family siderophore transporter  31.94 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1821  transporter  31.94 
 
 
457 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0880  putative transporter  35.67 
 
 
414 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  27.34 
 
 
428 aa  62.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 
408 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1773  major facilitator transporter  27.8 
 
 
630 aa  62.4  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4383  ampG protein, putative  35.34 
 
 
516 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.920569  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  31.29 
 
 
420 aa  60.5  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
416 aa  60.5  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  30.81 
 
 
450 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  30.08 
 
 
443 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03703  putative muropeptide transport protein  32.29 
 
 
448 aa  58.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  30.34 
 
 
412 aa  57.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0094  hypothetical protein  27.05 
 
 
511 aa  57.4  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.4429  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4078  AmpG-related permease  33.83 
 
 
516 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
425 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 
504 aa  57  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  32.26 
 
 
418 aa  57  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0122  major facilitator transporter  28.48 
 
 
509 aa  56.2  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00126713  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  30.26 
 
 
517 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 
452 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1388  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 
517 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.344668  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0139  beta-lactamase induction signal transducer protein  27.85 
 
 
509 aa  55.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143308  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 
447 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0941  hypothetical protein  31.16 
 
 
598 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.274634 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1287  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 
517 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 
475 aa  54.7  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  26.45 
 
 
491 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  30.22 
 
 
271 aa  54.7  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  26.45 
 
 
491 aa  54.7  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  26.45 
 
 
491 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  26.45 
 
 
491 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  26.45 
 
 
491 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  26.45 
 
 
491 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  26.45 
 
 
491 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
406 aa  54.3  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  31.37 
 
 
465 aa  54.3  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  26.49 
 
 
491 aa  54.3  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 
416 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  30.77 
 
 
388 aa  53.5  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  33.59 
 
 
396 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  33.59 
 
 
396 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1198  AmpG permease  35.25 
 
 
519 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0147  major facilitator transporter  27.78 
 
 
550 aa  53.5  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  33.1 
 
 
395 aa  53.5  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 
411 aa  53.5  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  38.36 
 
 
447 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  28.22 
 
 
492 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  28.22 
 
 
492 aa  53.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  28.22 
 
 
492 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1420  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 
438 aa  53.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  28.03 
 
 
461 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  32.81 
 
 
454 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 
459 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  28.22 
 
 
492 aa  52  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  26.49 
 
 
491 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 
482 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  26.49 
 
 
491 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  30.3 
 
 
515 aa  51.6  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  32.05 
 
 
471 aa  51.2  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  29.1 
 
 
482 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  33.85 
 
 
456 aa  51.2  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  30.77 
 
 
472 aa  50.8  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  26.9 
 
 
550 aa  50.4  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  27.64 
 
 
417 aa  50.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  30.41 
 
 
463 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  29.68 
 
 
466 aa  50.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0025  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 
445 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00511907  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4016  major facilitator transporter  24.51 
 
 
444 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  28.99 
 
 
489 aa  49.7  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  31.25 
 
 
452 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  33.08 
 
 
457 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  29.82 
 
 
465 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57100  putative permease  36.05 
 
 
594 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  29.82 
 
 
463 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  37.97 
 
 
460 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  31.17 
 
 
471 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  31.65 
 
 
478 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  31.17 
 
 
471 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0944  MSF transporter  29.32 
 
 
447 aa  49.7  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  23.96 
 
 
473 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  26.32 
 
 
428 aa  48.9  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  23.96 
 
 
473 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8458  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 
442 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0190  major facilitator transporter  29.31 
 
 
576 aa  48.9  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>