85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54049 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_54049  acetyl-coa transporter  100 
 
 
646 aa  1328    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.511026  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00180  SD08430p, putative  31.13 
 
 
587 aa  218  2e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.026528  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04836  SD08430p (AFU_orthologue; AFUA_3G07290)  29.89 
 
 
576 aa  212  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33225  Acetyl-CoA transporter  31.3 
 
 
560 aa  209  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.568918  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13668  MFS family transporter: acetyl-CoA  29.75 
 
 
438 aa  202  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00275578  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 
424 aa  77.8  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  31.61 
 
 
415 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  31.61 
 
 
415 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  31.61 
 
 
415 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
411 aa  63.5  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  30.71 
 
 
465 aa  63.5  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  31.73 
 
 
414 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  30.67 
 
 
388 aa  60.8  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 
459 aa  60.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1821  transporter  31.97 
 
 
457 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  30.63 
 
 
420 aa  60.1  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0796  RhtX/FptX family siderophore transporter  32.86 
 
 
423 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0886  RhtX/FptX family siderophore transporter  32.86 
 
 
423 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47536  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2158  hypothetical protein  32.86 
 
 
423 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  30.54 
 
 
428 aa  59.7  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 
416 aa  58.9  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 
408 aa  58.2  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  29.55 
 
 
271 aa  57.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0880  putative transporter  43.06 
 
 
414 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09380  putative transporter  41.89 
 
 
414 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000449575  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  30.29 
 
 
491 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  30.29 
 
 
491 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  30.29 
 
 
491 aa  55.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  30.29 
 
 
491 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  30.29 
 
 
491 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  30.29 
 
 
491 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  30.29 
 
 
491 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  28.32 
 
 
491 aa  55.5  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  30.29 
 
 
491 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  30.29 
 
 
491 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  29.82 
 
 
412 aa  54.7  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  27.22 
 
 
413 aa  54.7  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  29.48 
 
 
456 aa  54.3  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0025  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 
445 aa  53.9  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00511907  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  27.14 
 
 
450 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0848  major facilitator transporter  28.9 
 
 
413 aa  53.5  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  26.48 
 
 
457 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 
504 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  31.86 
 
 
460 aa  51.6  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  30 
 
 
443 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
406 aa  51.2  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
425 aa  50.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2336  major facilitator transporter  31.17 
 
 
424 aa  50.8  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  27.97 
 
 
433 aa  50.4  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  32.03 
 
 
418 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 
416 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  29.55 
 
 
492 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  29.55 
 
 
492 aa  49.7  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  27.97 
 
 
433 aa  49.3  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  29.55 
 
 
492 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  28.25 
 
 
454 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  28.81 
 
 
416 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 
482 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1420  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
438 aa  48.9  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  29.55 
 
 
482 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  28.03 
 
 
396 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  28.03 
 
 
396 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  30.28 
 
 
452 aa  48.1  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  28.49 
 
 
489 aa  48.1  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 
447 aa  47.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4105  major facilitator transporter  25.97 
 
 
547 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000015602 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  26.57 
 
 
464 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  28.18 
 
 
489 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 
464 aa  45.8  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1388  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 
517 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.344668  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
475 aa  45.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0139  beta-lactamase induction signal transducer protein  28.89 
 
 
509 aa  45.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143308  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  23.53 
 
 
517 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  27.91 
 
 
419 aa  44.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  29.71 
 
 
439 aa  44.3  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1287  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 
517 aa  44.3  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0941  hypothetical protein  31.78 
 
 
598 aa  43.9  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.274634 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0128  major facilitator transporter  41.51 
 
 
422 aa  43.9  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  24.36 
 
 
395 aa  43.9  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0122  major facilitator transporter  28.89 
 
 
509 aa  43.9  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00126713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  28.47 
 
 
473 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  28.76 
 
 
473 aa  43.9  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  28.47 
 
 
473 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  28.47 
 
 
473 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0094  hypothetical protein  27.17 
 
 
511 aa  43.9  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.4429  normal  0.916942 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>