More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB01060 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_01949  ATP-dependent RNA helicase has1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBY1]  70.77 
 
 
609 aa  743    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.429941  normal  0.205998 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25999  predicted protein  68.17 
 
 
485 aa  665    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01060  conserved hypothetical protein  100 
 
 
607 aa  1253    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0340674  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81459  RNA-dependent helicase  75.77 
 
 
567 aa  730    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.3042 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46259  predicted protein  64.92 
 
 
589 aa  615  1e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13235  fructose-bisphosphate aldolase  43.17 
 
 
627 aa  375  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00390046  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42318  predicted protein  39.92 
 
 
481 aa  352  1e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.712949  normal  0.0619314 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00589  ATP-dependent RNA helicase dbp4 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFU1]  40.82 
 
 
812 aa  351  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51414  ATP-dependent RNA helicase DBP4 (Helicase CA4) (Helicase UF1)  38.2 
 
 
765 aa  311  2e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07420  hypothetical protein  37.31 
 
 
859 aa  295  1e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.592915  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_28984  predicted protein  40.11 
 
 
433 aa  279  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_1733  predicted protein  35.85 
 
 
583 aa  273  6e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0224275 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_1703  nucleolar DEAD-box protein required for synthesis of 60S ribosomal subunits  40.22 
 
 
672 aa  258  2e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04233  ATP-dependent rRNA helicase rrp3 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5E7]  36.77 
 
 
465 aa  252  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.078552  normal  0.363381 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1511  predicted protein  34 
 
 
560 aa  250  5e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.485737  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41606  predicted protein  36.41 
 
 
755 aa  249  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.323573 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19237  predicted protein  36.41 
 
 
710 aa  248  2e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.554541  normal  0.150728 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40877  predicted protein  38.33 
 
 
546 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14032  predicted protein  39.11 
 
 
467 aa  245  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02650  conserved hypothetical protein  38.58 
 
 
808 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.77 
 
 
494 aa  242  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.36 
 
 
511 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14161  helicase_3  33.27 
 
 
540 aa  239  8e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26724  predicted protein  36.75 
 
 
466 aa  239  8e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.593125  normal  0.152821 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.59 
 
 
525 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.59 
 
 
515 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02850  ATP-dependent RNA helicase, putative  38.65 
 
 
484 aa  239  1e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.59 
 
 
525 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.59 
 
 
526 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2955  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.8 
 
 
487 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46542  predicted protein  38.12 
 
 
545 aa  238  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.893722  normal  0.156385 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9989  predicted protein  33.74 
 
 
620 aa  238  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.860977  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01497  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.74 
 
 
480 aa  236  7e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.48 
 
 
513 aa  236  9e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.19 
 
 
549 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  37.85 
 
 
495 aa  236  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3150  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.11 
 
 
488 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.308485  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.91 
 
 
578 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10125  ATP-dependent RNA helicase (Drs1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14990)  38.03 
 
 
814 aa  234  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00305342  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16073  predicted protein  35.59 
 
 
474 aa  234  3e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.760064  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.19 
 
 
549 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.85 
 
 
535 aa  233  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03176  ATP-dependent rRNA helicase spb4 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F4]  35.91 
 
 
638 aa  231  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.541811  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.75 
 
 
550 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24935  helicase_1  38.01 
 
 
455 aa  232  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05770  DNA/RNA helicase, superfamily II  34.81 
 
 
551 aa  230  5e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000174624  hitchhiker  0.00467584 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.22 
 
 
522 aa  230  7e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3042  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.29 
 
 
478 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00902237  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.71 
 
 
477 aa  229  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1024  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.75 
 
 
451 aa  228  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.88 
 
 
439 aa  228  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  35.79 
 
 
506 aa  228  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0448  DEAD/DEAH box helicase-like  36.46 
 
 
458 aa  227  5.0000000000000005e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0687758  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3164  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.88 
 
 
580 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.536296  normal  0.424534 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.39 
 
 
571 aa  227  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05150  conserved hypothetical protein  34.55 
 
 
606 aa  226  8e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.53 
 
 
567 aa  226  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.581814 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43135  predicted protein  32.4 
 
 
587 aa  226  8e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.6 
 
 
482 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57234  ATP-dependent rRNA helicase RRP3  40.3 
 
 
396 aa  226  1e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0347564  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.86 
 
 
527 aa  225  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2571  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.4 
 
 
510 aa  225  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.948447  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.36 
 
 
466 aa  225  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2794  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.4 
 
 
510 aa  225  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15323  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.33 
 
 
454 aa  225  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2926  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.55 
 
 
468 aa  225  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60418  ATP-dependent RNA helicase DBP7 (DEAD-box protein 7)  30.85 
 
 
733 aa  225  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.174628 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2135  DEAD/DEAH box helicase-like  35.79 
 
 
435 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.16 
 
 
522 aa  224  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5998  DEAD/DEAH box helicase  34.79 
 
 
484 aa  224  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  36.59 
 
 
527 aa  224  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.48 
 
 
497 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.28 
 
 
496 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3362  ATP-dependent RNA helicase  37.1 
 
 
484 aa  224  4.9999999999999996e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.67 
 
 
487 aa  223  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2013  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.91 
 
 
545 aa  223  6e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.14682  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  37.4 
 
 
492 aa  223  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.29 
 
 
491 aa  223  6e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00204  ATP-dependent RNA helicase dbp7 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGX6]  30.34 
 
 
778 aa  223  7e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.27 
 
 
678 aa  223  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3520  DEAD/DEAH box helicase-like  36.66 
 
 
579 aa  223  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3358  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.39 
 
 
390 aa  223  9e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00456117  normal  0.742173 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2294  hypothetical protein  33.64 
 
 
589 aa  223  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2267  hypothetical protein  33.64 
 
 
589 aa  222  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  36.62 
 
 
445 aa  222  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1769  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.21 
 
 
467 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327095  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2699  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.2 
 
 
486 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.411563  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.01 
 
 
463 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0945  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.83 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2059  DEAD/DEAH box helicase-like  34.2 
 
 
486 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311638  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2670  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.2 
 
 
486 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.91 
 
 
463 aa  222  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.2 
 
 
479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381467  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.2 
 
 
480 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0181544  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.7 
 
 
511 aa  221  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0454  superfamily II DNA/RNA helicase  37.29 
 
 
528 aa  221  3e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.93 
 
 
506 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.88 
 
 
515 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.33 
 
 
482 aa  220  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1950  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.14 
 
 
522 aa  220  5e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>