More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1570 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 		 302 aa  621  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.117163  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  56.58 
 
 		 315 aa  350  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1053  methionyl-tRNA formyltransferase  55.92 
 
 		 312 aa  343  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4814  methionyl-tRNA formyltransferase  56.9 
 
 		 297 aa  335  5.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1221  methionyl-tRNA formyltransferase  53.62 
 
 		 304 aa  332  5e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.820089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1490  methionyl-tRNA formyltransferase  51.97 
 
 		 316 aa  306  3e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1921  hypothetical protein  50 
 
 		 297 aa  291  7e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0138  methionyl-tRNA formyltransferase  50 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.483644  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2549  methionyl-tRNA formyltransferase  44 
 
 		 320 aa  279  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09618  methionyl-tRNA formyltransferase  46.38 
 
 		 315 aa  268  5.9999999999999995e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315311  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2023  methionyl-tRNA formyltransferase  45.16 
 
 		 323 aa  267  1e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.030686 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  44.22 
 
 		 310 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  43.38 
 
 		 318 aa  259  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  43.05 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3339  methionyl-tRNA formyltransferase  43.38 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.376602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1529  methionyl-tRNA formyltransferase  42.43 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  41.91 
 
 		 311 aa  248  7e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0487  methionyl-tRNA formyltransferase  42.43 
 
 		 314 aa  248  9e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3217  methionyl-tRNA formyltransferase  40.53 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.163749  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0244  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  41.06 
 
 		 313 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1570  methionyl-tRNA formyltransferase  41.37 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793908 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0899  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 		 317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0130  methionyl-tRNA formyltransferase  39.4 
 
 		 317 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  42.76 
 
 		 318 aa  238  9e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1714  methionyl-tRNA formyltransferase  43.56 
 
 		 309 aa  236  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1705  methionyl-tRNA formyltransferase  40.92 
 
 		 317 aa  235  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  40 
 
 		 319 aa  235  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  42.42 
 
 		 318 aa  235  7e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1860  methionyl-tRNA formyltransferase  41.78 
 
 		 315 aa  235  9e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.346485  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  42.42 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1996  methionyl-tRNA formyltransferase  43.23 
 
 		 309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0898  methionyl-tRNA formyltransferase  40.86 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.212157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1787  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 319 aa  232  6e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  41.41 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  39.39 
 
 		 329 aa  228  7e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  44.15 
 
 		 310 aa  226  2e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1472  methionyl-tRNA formyltransferase  39.8 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4228  methionyl-tRNA formyltransferase  41.2 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2491  methionyl-tRNA formyltransferase  39.29 
 
 		 319 aa  225  6e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  38.16 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0858  methionyl-tRNA formyltransferase  39.33 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0079  methionyl-tRNA formyltransferase  39.4 
 
 		 316 aa  223  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0761  methionyl-tRNA formyltransferase  39.6 
 
 		 314 aa  223  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194014 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 		 315 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  40.74 
 
 		 320 aa  222  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  39.47 
 
 		 308 aa  222  7e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 		 309 aa  222  7e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  39.87 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  38.08 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1678  methionyl-tRNA formyltransferase  40.52 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 		 318 aa  219  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  39.6 
 
 		 313 aa  219  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 		 315 aa  219  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 		 315 aa  219  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 		 318 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  37.42 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  37.82 
 
 		 320 aa  219  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  38.08 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  36.54 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  38.21 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2313  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490925  hitchhiker  0.0006759 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  38.61 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  39.4 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  38.87 
 
 		 315 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  37.54 
 
 		 327 aa  215  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  39 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1005  methionyl-tRNA formyltransferase  40.06 
 
 		 317 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00554605  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.06 
 
 		 321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0074  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 		 321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  40.86 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  40.86 
 
 		 311 aa  212  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  35.06 
 
 		 310 aa  211  9e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  38.21 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  38.21 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  37.34 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  37.34 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  38.21 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  38.33 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  38.21 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  38.05 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  43.14 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  38.67 
 
 		 318 aa  210  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  39.03 
 
 		 323 aa  209  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  37.87 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  38.54 
 
 		 315 aa  209  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  39.03 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  39.61 
 
 		 319 aa  209  5e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>