85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0246 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0246  thiamine phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 		 197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1602  thiamine monophosphate synthase  36.59 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6577  thiamine monophosphate synthase  44.88 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2460  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.67 
 
 		 409 aa  92  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2467  thiamine monophosphate synthase  39.86 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324772  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2109  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.47 
 
 		 647 aa  68.9  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.671125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0622  thiamine monophosphate synthase  28.57 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.88 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.08 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0261  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.15 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.243144  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24.35 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  30.15 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000901813 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.73 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1457  hypothetical protein  26.28 
 
 		 488 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0610  transcriptional regulator TenI  25.52 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1691  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.55 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0247781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  27.7 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.35 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  24 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.53 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2226  thiamine monophosphate synthase  30.1 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.324904  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0342  thiamine monophosphate synthase  27.27 
 
 		 206 aa  47.8  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.11 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.35 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1414  transcriptional regulator TenI  25.7 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.29 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.54 
 
 		 351 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.56 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2023  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.78 
 
 		 650 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2382  phosphomethylpyrimidine kinase  30.5 
 
 		 530 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.43 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.56 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.56 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.56 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.56 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.56 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.56 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1348  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.23 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.35 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  29.47 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0815  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  28 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.339712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  24.38 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1526  hypothetical protein  24.36 
 
 		 488 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.83 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2025  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.47 
 
 		 650 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308953 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0492  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.37 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  28.47 
 
 		 490 aa  45.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0613  thiamine monophosphate synthase  27.27 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0220  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.87 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.615766  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  26.25 
 
 		 497 aa  45.1  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0602  thiamine monophosphate synthase  32.1 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323651  normal  0.0553543 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0580  thiamine monophosphate synthase  28.21 
 
 		 218 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1531  thiamine monophosphate synthase  28.57 
 
 		 212 aa  44.7  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.28 
 
 		 208 aa  44.7  0.0009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3885  thiamine monophosphate synthase  30.69 
 
 		 202 aa  44.7  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1405  thiamine monophosphate synthase  25.74 
 
 		 213 aa  44.7  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00145  Thiamine monophosphate synthase  26.49 
 
 		 526 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.34 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  23.13 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1923  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.1 
 
 		 637 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  25.61 
 
 		 484 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.14 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2056  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.21 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0577  Thiamine-phosphate diphosphorylase  24.85 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.09 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.8 
 
 		 365 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.27 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4985  Thiamine-phosphate diphosphorylase  27.48 
 
 		 242 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.399872  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  25.61 
 
 		 484 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  27.34 
 
 		 492 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4935  Thiamine-phosphate diphosphorylase  27.21 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.539276  normal  0.373697 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2438  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.08 
 
 		 632 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4471  thiamine-phosphate diphosphorylase  27.21 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2322  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.08 
 
 		 632 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.756854  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.18 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0633  thiamine monophosphate synthase  27.1 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.81 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1282  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.64 
 
 		 206 aa  42  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.536618  normal  0.780941 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  22.67 
 
 		 223 aa  42  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25.9 
 
 		 236 aa  42  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  21.47 
 
 		 223 aa  42  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2663  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  25 
 
 		 209 aa  41.6  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1499  thiamine monophosphate synthase  25 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1015  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  21.71 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.51 
 
 		 205 aa  41.2  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>