286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1237 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1096  ubiquinol cytochrome c oxidoreductase, cytochrome b subunit  74.94 
 
 		 414 aa  639    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1237  cytochrome B  100 
 
 		 419 aa  842    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1449  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  75.54 
 
 		 415 aa  630  1e-179  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1319  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  73.14 
 
 		 416 aa  614  1e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1200  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  73.38 
 
 		 416 aa  615  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0544  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b subunit  72.9 
 
 		 416 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1815  pathogenicity island encoded protein: SPI3  70.41 
 
 		 414 aa  598  1e-170  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00139349  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1920  cytochrome B(N-)/b6/PetB subfamily protein  68.5 
 
 		 414 aa  592  1e-168  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1832  Cytochrome b/b6 domain protein  68.42 
 
 		 418 aa  592  1e-168  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.485298  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0741  Cytochrome b/b6 domain protein  68.42 
 
 		 418 aa  592  1e-168  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1920  cytochrome b/b6-like  61.81 
 
 		 404 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000165644  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1454  Cytochrome b/b6 domain protein  52.21 
 
 		 394 aa  420  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000126052  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0117  Cytochrome b/b6 domain protein  41.62 
 
 		 386 aa  293  4e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1832  cytochrome B subunit of cytochrome bc1  41 
 
 		 410 aa  281  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.255708  normal  0.197515 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0677  cytochrome b/b6-like  38.31 
 
 		 429 aa  276  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.206684  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2218  Cytochrome b/b6 domain protein  44.01 
 
 		 469 aa  276  5e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.905711  normal  0.211353 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1961  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  38.04 
 
 		 459 aa  276  5e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0992  cytochrome b/b6-like  37.86 
 
 		 410 aa  272  8.000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.747252  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2873  fused ubiquinol-cytochrome c reductase and cytochrome b/b6  40 
 
 		 426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00318002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1139  Cytochrome b/b6 domain protein  42.78 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.222795  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0357  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.92 
 
 		 401 aa  268  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000177804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.25 
 
 		 440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  0.0553063 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2210  cytochrome b/b6  41.6 
 
 		 413 aa  266  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.226305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2469  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.56 
 
 		 410 aa  265  8e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00715647  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0925  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.81 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3161  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  40.79 
 
 		 747 aa  265  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1403  Cytochrome b/b6 domain protein  41.56 
 
 		 422 aa  264  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.62 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.387629  normal  0.411139 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3277  cytochrome b  37.67 
 
 		 449 aa  264  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0326  cytochrome b/b6-like  38.08 
 
 		 451 aa  264  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.756049 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1344  cytochrome b/b6-like protein  37.56 
 
 		 426 aa  265  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.179671  normal  0.0287438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1318  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome b  39.32 
 
 		 403 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2301  cytochrome b/c1  37.29 
 
 		 688 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.840642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4406  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.32 
 
 		 404 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4531  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.32 
 
 		 404 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0904  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.56 
 
 		 403 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1395  cytochrome b  38.14 
 
 		 445 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13070  Cytochrome b/b6  39.23 
 
 		 403 aa  263  4.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0925  cytochrome c1  35.82 
 
 		 690 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2958  cytochrome b/b6 domain-containing protein  38.39 
 
 		 424 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0062  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.91 
 
 		 445 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.422457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1385  cytochrome c1  36.3 
 
 		 688 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1303  cytochrome c1  36.59 
 
 		 689 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4691  cytochrome b/b6-like  39.33 
 
 		 403 aa  259  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.49849  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0106  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  40.82 
 
 		 421 aa  259  8e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000729315  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0155  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.74 
 
 		 418 aa  259  8e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0126  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.59 
 
 		 466 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469556  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3800  Cytochrome b/b6 domain protein  36.74 
 
 		 417 aa  258  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.306373 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2759  hypothetical protein  38.65 
 
 		 404 aa  257  3e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0737  cytochrome b/b6  37.71 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5002  putative cytochrome b  37.44 
 
 		 403 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0257192  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57560  putative cytochrome b  39.78 
 
 		 403 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.1208  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2632  hypothetical protein  41.88 
 
 		 404 aa  256  7e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0298  cytochrome b/b6-like  37.38 
 
 		 408 aa  256  7e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.349609  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0750  Cytochrome b/b6 domain protein  40.15 
 
 		 464 aa  255  9e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0241162  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1201  cytochrome c1  36.06 
 
 		 689 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0850  cytochrome B  43.63 
 
 		 466 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.833768 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2243  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.38 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0363232  normal  0.819807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0702  cytochrome b/b6 domain-containing protein  37.65 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0895628  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1540  cytochrome b/b6 domain-containing protein  34.88 
 
 		 426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  0.652412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2777  Cytochrome b/b6 domain  34.78 
 
 		 426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0822  cytochrome b/b6-like  37.8 
 
 		 466 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.887909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2661  ubiquinol--cytochrome c reductase, cytochrome B  40.44 
 
 		 422 aa  254  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00823249  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3041  Cytochrome b/b6 domain protein  34.78 
 
 		 422 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568197  normal  0.966888 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004508  ubiquinol--cytochrome c reductase cytochrome B subunit  39.86 
 
 		 421 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000136312  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1395  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.54 
 
 		 421 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935928  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00884  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  41.34 
 
 		 421 aa  253  6e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3543  Cytochrome b/b6 domain  35.37 
 
 		 459 aa  252  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.789963  normal  0.0181862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0415  putative cytochrome B subunit transmembrane protein  35.6 
 
 		 459 aa  253  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3240  cytochrome c1  35.65 
 
 		 688 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0810  cytochrome b/b6, N-terminal:cytochrome b/b6, C-terminal  42 
 
 		 433 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000295618  hitchhiker  0.00000153677 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2165  cytochrome b/b6-like  36.1 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3934  cytochrome b/b6 domain-containing protein  44.23 
 
 		 470 aa  250  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0360  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.69 
 
 		 460 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0523678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0369  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.3 
 
 		 460 aa  250  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.723254 
 
 
-
 
NC_002978  WD1071  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  37.35 
 
 		 409 aa  249  5e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0136  Cytochrome b/b6 domain  42.54 
 
 		 466 aa  249  5e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.153935 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4439  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  37.96 
 
 		 423 aa  249  9e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2616  cytochrome c1  36.28 
 
 		 687 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.634521  normal  0.325896 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0363  cytochrome b/b6-like  37.75 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402097  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0345  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.3 
 
 		 459 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3020  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  40.48 
 
 		 404 aa  248  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000159127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0442  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.01 
 
 		 460 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0421  cytochrome b/b6 domain-containing protein  36.01 
 
 		 460 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3540  cytochrome b/b6-like  36.01 
 
 		 459 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2742  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.93 
 
 		 460 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3200  cytochrome b/b6-like protein  39.47 
 
 		 404 aa  246  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.201205  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2665  cytochrome b/b6-like  36.18 
 
 		 460 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.628042  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2813  cytochrome b/b6-like  36.49 
 
 		 442 aa  246  6.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.668626  normal  0.273997 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3700  cytochrome b/b6-like  38.81 
 
 		 422 aa  245  9e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0123315  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0795  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.92 
 
 		 410 aa  245  9e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000156903  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1542  ubiquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b  36.59 
 
 		 432 aa  245  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.836015  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1004  cytochrome b/b6-like  38.38 
 
 		 414 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661303  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1584  cytochrome b/b6-like  40.41 
 
 		 401 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.385225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3306  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.27 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0931  cytochrome b/b6 domain-containing protein  39.59 
 
 		 467 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1624  cytochrome b/b6 domain-containing protein  35.44 
 
 		 431 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1421  cytochrome b, b6 subunit  38.75 
 
 		 401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133027  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0802  cytochrome b/b6 domain-containing protein  40.05 
 
 		 404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000623655  hitchhiker  0.00979374 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3204  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome b subunit  34.13 
 
 		 422 aa  243  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.545864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>