More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2049 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2049  hypothetical protein  100 
 
 
533 aa  1061    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0008  flagellar hook protein  45.07 
 
 
546 aa  437  1e-121  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2290  fagellar hook-basal body protein  41.55 
 
 
567 aa  377  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1520  flagellar hook protein FlgE  37.94 
 
 
541 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0058  flagellar hook protein  37.7 
 
 
545 aa  310  5.9999999999999995e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0081  flagellar hook protein  37.52 
 
 
545 aa  309  6.999999999999999e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0042  flagellar hook protein  37.52 
 
 
545 aa  309  8e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1618  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.38 
 
 
525 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0298  flagella basal body rod domain-containing protein  28.26 
 
 
501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  28.32 
 
 
519 aa  147  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  28.68 
 
 
463 aa  146  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  25.89 
 
 
508 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1808  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.27 
 
 
501 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1769  flagellar hook protein FlgE  34.26 
 
 
911 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1862  flagellar hook protein FlgE  35.25 
 
 
814 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0031  hypothetical protein  30.25 
 
 
430 aa  128  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2291  flagellar hook protein FlgE  35.8 
 
 
851 aa  126  8.000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2091  protein of unknown function DUF1078 domain protein  25.44 
 
 
499 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0508836  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  27.27 
 
 
401 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  27.36 
 
 
401 aa  124  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2040  flagellar hook protein FlgE  34.84 
 
 
819 aa  123  9e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0032  flagellar hook protein FlgE  33.73 
 
 
718 aa  118  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0107  flagellar hook protein FlgE  33.09 
 
 
814 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000370744  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5537  putative flagellar hook protein flgE  27.83 
 
 
601 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0639187 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1896  flagellar hook protein FlgE  33.19 
 
 
845 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1537  hypothetical protein  33.33 
 
 
770 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2951  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  27.75 
 
 
501 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.431038 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2103  flagellar hook protein FlgE  32.76 
 
 
875 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0025  flagellar hook protein FlgE  33.81 
 
 
838 aa  102  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  24.04 
 
 
496 aa  100  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  33.17 
 
 
419 aa  99.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4173  hypothetical protein  25.14 
 
 
452 aa  99.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  37.33 
 
 
441 aa  98.2  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  36.06 
 
 
398 aa  97.8  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1293  hypothetical protein  30.24 
 
 
705 aa  97.4  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  32.21 
 
 
419 aa  96.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2833  flagellar basal-body rod protein FlgG  41.04 
 
 
265 aa  96.3  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  33.5 
 
 
394 aa  96.7  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.77 
 
 
415 aa  96.3  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2506  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.99 
 
 
266 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.0019956  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2602  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.99 
 
 
266 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.300868  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1351  flagellar basal-body rod FlgG  36.3 
 
 
266 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00836433  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4197  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.96 
 
 
263 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529691  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  33.33 
 
 
440 aa  95.1  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0823  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.5 
 
 
263 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214606  hitchhiker  0.00937776 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  34.43 
 
 
405 aa  94.7  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4712  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.23 
 
 
263 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  36.87 
 
 
564 aa  94.7  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1156  flagellar basal body rod protein FlgG  33.89 
 
 
261 aa  94.4  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0392  flagellar basal body rod protein FlgG  40 
 
 
261 aa  94.4  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.190258  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1261  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.77 
 
 
808 aa  94.4  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1303  putative flagellar hook protein  23.13 
 
 
465 aa  94  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.96 
 
 
390 aa  94  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2963  hypothetical protein  23.13 
 
 
465 aa  94  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  37.24 
 
 
475 aa  94  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0111  hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  94  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000402789  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3245  flagellar basal-body rod protein FlgG  34.29 
 
 
263 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313627  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0257  hypothetical protein  33.96 
 
 
623 aa  93.2  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  32.64 
 
 
451 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.29 
 
 
454 aa  93.2  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  31.07 
 
 
417 aa  91.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3271  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.57 
 
 
263 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.687506  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3047  flagellar basal-body rod protein FlgG  32.57 
 
 
263 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.517234  normal  0.668581 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.93 
 
 
413 aa  91.7  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3100  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.18 
 
 
270 aa  91.3  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0388691  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1205  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.5 
 
 
261 aa  91.3  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3379  flagellar hook protein FlgE  30.92 
 
 
434 aa  91.3  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  29.31 
 
 
399 aa  91.3  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0466  flagellar basal-body rod protein FlgG  39.1 
 
 
261 aa  91.3  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  30 
 
 
417 aa  91.3  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2013  hypothetical protein  25.9 
 
 
464 aa  90.9  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  42.75 
 
 
266 aa  90.9  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.38 
 
 
397 aa  90.5  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1973  flagellar basal-body rod FlgG  37.78 
 
 
260 aa  90.5  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0255  hypothetical protein  33.81 
 
 
750 aa  90.5  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  30 
 
 
442 aa  90.1  9e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  29.57 
 
 
409 aa  90.1  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0947  flagellar basal-body rod protein FlgG  40.44 
 
 
261 aa  90.1  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000672469  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.66 
 
 
462 aa  90.1  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1250  flagellar basal-body rod protein FlgG  36.76 
 
 
261 aa  90.1  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24050  flagellar basal-body rod protein  34.46 
 
 
260 aa  89  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2400  hypothetical protein  39.85 
 
 
856 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1614  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.33 
 
 
513 aa  88.6  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.621437  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1328  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.14 
 
 
636 aa  89  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2674  hypothetical protein  39.69 
 
 
498 aa  89  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2923  flagellar basal-body rod FlgG  35.51 
 
 
263 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1019  flagellar basal body rod protein FlgG  39.13 
 
 
264 aa  88.2  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1007  flagellar basal body rod protein FlgG  38.97 
 
 
264 aa  88.2  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2409  flagellar basal body rod protein FlgG  37.04 
 
 
260 aa  88.2  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3449  flagellar basal body rod protein FlgG  36.03 
 
 
262 aa  88.2  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  32.77 
 
 
401 aa  87.4  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4106  flagellar basal body rod protein FlgG  36.03 
 
 
262 aa  87.4  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  31.74 
 
 
433 aa  87.4  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2431  hypothetical protein  30.62 
 
 
442 aa  87  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254601  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1147  flagellar basal-body rod protein FlgG  37.78 
 
 
262 aa  87  8e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000153607  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  35.62 
 
 
266 aa  86.7  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.31 
 
 
545 aa  86.7  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  29.57 
 
 
383 aa  87  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1467  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.2 
 
 
584 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  30.69 
 
 
410 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>