More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0201 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0201  cation-efflux system membrane protein  100 
 
 		 296 aa  596  1e-169  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1466  putative integral membrane protein  66.89 
 
 		 296 aa  390  1e-107  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1708  response regulator receiver  51.33 
 
 		 295 aa  300  1e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1488  response regulator receiver domain-containing protein  46.62 
 
 		 299 aa  279  4e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.47127  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0408  response regulator receiver domain-containing protein  51.68 
 
 		 296 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0244  conserved hypothetical protein, putative two-component response regulator  46.28 
 
 		 291 aa  241  9e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1595  DNA-binding response regulator, putative  46.46 
 
 		 295 aa  233  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1780  DNA-binding response regulator, putative  46.13 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.756985  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1962  DNA-binding response regulator, putative  46.13 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2013  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  28.65 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.067134 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2255  two component transcriptional regulator  32.54 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39138  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1946  transcriptional regulatory protein PhoP  32.54 
 
 		 224 aa  72  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2855  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  28.65 
 
 		 223 aa  72  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1580  two component transcriptional regulator  32.54 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.128837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1655  two component transcriptional regulator  32.54 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.014875  hitchhiker  0.000274191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1724  two component transcriptional regulator  32.54 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1608  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  28.65 
 
 		 223 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2501  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2494  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.178511  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1850  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0826767  hitchhiker  0.000859255 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1715  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  27.12 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2614  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3997  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3919  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3856  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2586  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.87 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  29.17 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2348  two component transcriptional regulator  30.95 
 
 		 224 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000162881  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01128  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  30.99 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2517  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.99 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0459987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1293  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  30.99 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2473  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  30.99 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.751348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1995  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  30.99 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1250  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  30.99 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  29.17 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1308  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  30.99 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01136  hypothetical protein  30.99 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.982846  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1185  response regulator receiver  34.19 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1542  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0817  response regulator receiver: C terminal  34.13 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0415499  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  29.17 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2804  two component transcriptional regulator  30.95 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000183823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1012  DNA-binding response regulator  34.13 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0213425  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1559  response regulator receiver  29.84 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1953  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  29.82 
 
 		 224 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2135  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  29.82 
 
 		 224 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0423358 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1332  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  29.82 
 
 		 224 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.137 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1310  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  29.82 
 
 		 224 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.237463 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1746  two component transcriptional regulator  30.95 
 
 		 224 aa  67  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000480188  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4882  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1591  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  30.99 
 
 		 223 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1348  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  29.82 
 
 		 224 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.898819 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0312  two component transcriptional regulator  31.75 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  28.47 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1791  two component transcriptional regulator  30.16 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.506547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1581  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  30.88 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  28.47 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5304  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.25 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  32.14 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  28.47 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2151  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  29.82 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  35.2 
 
 		 241 aa  65.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1186  winged helix family two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1216  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4932  two component transcriptional regulator  28.47 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3049  two component transcriptional regulator  32.52 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1620  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1170  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.72 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.454571 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1848  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.09 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0065624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1913  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.59 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1866  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  30.34 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1198  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2062  two component transcriptional regulator  29.84 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0133309  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4240  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.735778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2976  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.176642 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1643  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  28.65 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0704  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.43 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.593451 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2388  heavy metal response regulator  32.14 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000142984  normal  0.119734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2101  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  32.14 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  30.15 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  30.15 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2480  DNA-binding heavy metal response regulator  29.27 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000187636  normal  0.518539 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  30.15 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0662  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.73 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00302199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0715  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.19 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  27.19 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  36.13 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2192  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.27 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2084  DNA-binding heavy metal response regulator  29.27 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000771382  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0041  two component transcriptional regulator  32.58 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0890  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.64 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000284562  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1915  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  34.91 
 
 		 467 aa  62.8  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0712701  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4230  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3305  DNA-binding response regulator BaeR  36.7 
 
 		 232 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.304306  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02303  two-component system regulatory protein  29.86 
 
 		 225 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3400  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 224 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  32.73 
 
 		 224 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  27.19 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0745  two-component regulator  27.93 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.802142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>