More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1063 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1063  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00754715  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0808  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  88.05 
 
 		 226 aa  402  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000531821  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0763  DNA-binding response regulator  76.68 
 
 		 224 aa  349  2e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00370439  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0978  DNA-binding response regulator  73.33 
 
 		 226 aa  342  2.9999999999999997e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0498  DNA-binding response regulator  68.75 
 
 		 224 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00199813  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1362  DNA-binding response regulator  68.3 
 
 		 224 aa  312  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1241  DNA-binding response regulator  68.3 
 
 		 224 aa  312  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1384  response regulator receiver  68.44 
 
 		 226 aa  310  9e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0780  two-component response regulator  66.96 
 
 		 224 aa  309  2e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0564  response regulator receiver  56.7 
 
 		 223 aa  261  6e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.924373  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1360  transcriptional regulatory protein BaeR  55.36 
 
 		 223 aa  247  1e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0760361  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1147  regulatory protein VanR  55.11 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0966  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease  54.46 
 
 		 223 aa  244  6e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00233107  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2094  response regulator receiver  56.76 
 
 		 225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1135  transcriptional regulatory protein BaeR  55.31 
 
 		 223 aa  242  3.9999999999999997e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.169621  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1759  two component transcriptional regulator  55.36 
 
 		 220 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0494  two-component response regulator  52.23 
 
 		 223 aa  238  5.999999999999999e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1397  DNA-binding response regulator  51.34 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1277  DNA-binding response regulator  51.34 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112244  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0464  DNA-binding response regulator  50.45 
 
 		 223 aa  227  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316679  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2131  response regulator receiver  48.67 
 
 		 223 aa  211  5.999999999999999e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.03 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00974604  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0452  response regulator ompr  45.09 
 
 		 222 aa  185  5e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 234 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3716  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.39 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422774  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  39.21 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  40.26 
 
 		 228 aa  162  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1672  DNA-binding response regulator  37.95 
 
 		 247 aa  161  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.39 
 
 		 226 aa  161  7e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2740  two component transcriptional regulator  35.5 
 
 		 231 aa  161  8.000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307567  normal  0.0284463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4245  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 240 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0492398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3138  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224709  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  36.56 
 
 		 229 aa  158  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0835  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 222 aa  158  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4562  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 		 247 aa  157  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488322  normal  0.0982939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  38.77 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0880  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220279 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4891  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.5 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  38.77 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  37.5 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  40.26 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  36.96 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  35.27 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  37.55 
 
 		 243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.99 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3566  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.291783  normal  0.121657 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  36 
 
 		 232 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  35.11 
 
 		 232 aa  155  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  35.81 
 
 		 240 aa  155  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  36.12 
 
 		 246 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.2 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.68 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3146  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  37.5 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.119762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  37.95 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3498  putative two-component response regulator  34.84 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0401889  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2529  two component transcriptional regulator  36.96 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00604151 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  35.56 
 
 		 232 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.68 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2259  response regulator protein  35.71 
 
 		 288 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1739  DNA-binding response regulator  35.27 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203383  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 275 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1019  DNA-binding response regulator  35.71 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79357  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0108  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.84 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0934  DNA-binding response regulator  35.71 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.68 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0107  DNA-binding response regulator  35.84 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  37.22 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41260  putative two-component response regulator  34.39 
 
 		 235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.923976 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  36.64 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  37.5 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  35.19 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  37 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  37.5 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  35.09 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  35.11 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.22 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  34.91 
 
 		 234 aa  152  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  35.71 
 
 		 230 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  34.84 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1426  transcriptional regulatory protein RstA  35.62 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  34.84 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.43 
 
 		 251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>