58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0217 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0217  pantothenate kinase  100 
 
 
209 aa  423  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0993  pantothenate kinase  77.03 
 
 
209 aa  337  5.9999999999999996e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0585  transcriptional activator, Baf family  59.11 
 
 
207 aa  261  6.999999999999999e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1150  pantothenate kinase  56.25 
 
 
210 aa  256  1e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0493406  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0443  pantothenate kinase  55.29 
 
 
209 aa  246  2e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0676468  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0417  pantothenate kinase  55.29 
 
 
209 aa  245  3e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000353055  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1564  pantothenate kinase  54.81 
 
 
209 aa  243  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0481  pantothenate kinase  54.68 
 
 
207 aa  236  2e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1638  pantothenate kinase  50.24 
 
 
206 aa  217  1e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0888  pantothenate kinase  34.83 
 
 
205 aa  138  4.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.394748  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  31.15 
 
 
242 aa  62  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0188  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.88 
 
 
223 aa  61.6  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164212  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  28.43 
 
 
243 aa  59.3  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  33.05 
 
 
244 aa  59.3  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.46 
 
 
252 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1367  pantothenate kinase  27.39 
 
 
247 aa  56.2  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  25.31 
 
 
249 aa  55.1  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0613  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.37 
 
 
241 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  27.94 
 
 
249 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  28.37 
 
 
241 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  30.47 
 
 
279 aa  52  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4029  pantothenate kinase  29.61 
 
 
251 aa  52  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43701  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  29.56 
 
 
245 aa  52  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1164  Baf family transcriptional activator  27.71 
 
 
270 aa  51.6  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1218  pantothenate kinase  27.07 
 
 
266 aa  51.2  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0258135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  27.4 
 
 
248 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  25.79 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  29.01 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  28.47 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.15 
 
 
269 aa  49.7  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  33.33 
 
 
260 aa  48.5  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  26.62 
 
 
251 aa  48.1  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  28.24 
 
 
247 aa  48.1  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  25.81 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  26.47 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  27.03 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  32.99 
 
 
270 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  25.9 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  31.06 
 
 
246 aa  46.6  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  24.22 
 
 
266 aa  45.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  29.01 
 
 
244 aa  45.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3123  pantothenate kinase  24.4 
 
 
258 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0083  putative transcriptional acitvator, Baf  26.62 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2997  pantothenate kinase  24.77 
 
 
258 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  23.53 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  26.39 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  26.42 
 
 
249 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4170  pantothenate kinase  26.25 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  26.39 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1772  pantothenate kinase  34.91 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2217  pantothenate kinase  24.18 
 
 
263 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  29.1 
 
 
254 aa  43.5  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  39.02 
 
 
254 aa  42.7  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00921  transcriptional regulator  27.01 
 
 
231 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  26.39 
 
 
249 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  29.33 
 
 
248 aa  42.4  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0238  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.67 
 
 
260 aa  42  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  24.14 
 
 
251 aa  41.6  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>