205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06145 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06145  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  697    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.871394  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2520  glycosyl transferase family protein  38.08 
 
 		 354 aa  245  9e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2876  hypothetical protein  35.96 
 
 		 359 aa  221  9e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3091  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase-like protein  26.72 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3035  glycosyl transferase family 9  22.34 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.128179 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0589  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  28.52 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  22.89 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  24.01 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1264  heptosyl transferase I  22.87 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  25.89 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0560  putative heptosyltransferase  23.96 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1808  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  24.41 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4134  glycosyl transferase family 9  23.44 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.09 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  20 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.89 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3557  glycosyl transferase family protein  23.12 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.970932 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.17 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1991  glycosyl transferase family protein  21.07 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.010394  normal  0.201882 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1939  glycosyl transferase family protein  22.09 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.21219 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0093  heptosyltransferase  20.71 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.283951  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1433  heptosyltransferase family protein  20.34 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561852  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  24.31 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1482  heptosyltransferase family protein  21.75 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000479014  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2252  heptosyltransferase family protein  23.47 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.548459  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6413  glycosyl transferase family 9  29.59 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  20 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1703  glycosyl transferase family 9  21.35 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.17 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0080  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.49427  normal  0.135541 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0778  glycosyl transferase family 9  24.1 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0371  glycosyl transferase family protein  20.97 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3406  glycosyl transferase family 9  22.74 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  22.34 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4835  glycosyl transferase family protein  22.15 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0140311  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0669  heptosyltransferase  23.39 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.822838  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0579  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.99 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0417722 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.14 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2622  glycosyl transferase family 9  26.53 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.980475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1967  putative heptosyltransferase (O-antigen related)  23.05 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0282  glycosyl transferase family 9  21.63 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0576  heptosyltransferase  23.05 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0545  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  22.46 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0086605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.48 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  19.26 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.91 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0116  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  21.38 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0162  glycosyl transferase family protein  20.47 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3383  glycosyl transferase family 9  31.52 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0063  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  20.56 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.877737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  21.33 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  22.03 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4147  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  20.56 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.75 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0069  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  20.56 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270694  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.91 
 
 		 349 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0742  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.36 
 
 		 393 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.010597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  19.44 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5653  glycosyl transferase family protein  23.55 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.680336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0813  glycosyl transferase family protein  23.32 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3108  glycosyl transferase family 9  25.12 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  21.33 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  22.59 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4097  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  20.14 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  20.7 
 
 		 347 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.91 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3214  glycosyl transferase family 9  22.34 
 
 		 367 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360505  normal  0.269759 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2514  glycosyl transferase family protein  21.51 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.566705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3479  glycosyl transferase family 9  21.4 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2604  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  22.53 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00142989  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  21.55 
 
 		 349 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1275  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  21.11 
 
 		 342 aa  53.5  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.336205  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  23.29 
 
 		 340 aa  53.1  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.77 
 
 		 346 aa  53.1  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3702  glycosyl transferase family protein  18.66 
 
 		 359 aa  53.1  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  20.34 
 
 		 364 aa  53.1  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0085  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20.69 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000038978  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3957  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  20.69 
 
 		 348 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000313085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4993  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  20.69 
 
 		 348 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3831  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  20.69 
 
 		 348 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000276456  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  21.71 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1699  glycosyl transferase family protein  22.84 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4047  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  20.69 
 
 		 348 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000910947  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2311  glycosyl transferase family protein  22.84 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  28.71 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1247  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  19.53 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.313368  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2415  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  22.15 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275437 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1403  putative heptosyltransferase III waaq  24.4 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.308915  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0089  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  20.69 
 
 		 348 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000834595  normal  0.156713 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4123  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  20.69 
 
 		 348 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0437858  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03477  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  20.34 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000025219  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3991  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  19.8 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  21.33 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0661  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  20.07 
 
 		 336 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.796134 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  20.93 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03428  hypothetical protein  20.34 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000123646  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4036  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  19.8 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3683  glycosyl transferase family protein  20.49 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.761404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3910  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  19.8 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  20 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>