191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0560 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0560  putative heptosyltransferase  100 
 
 
390 aa  781    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4134  glycosyl transferase family 9  88.24 
 
 
391 aa  680    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3557  glycosyl transferase family protein  77.05 
 
 
396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.970932 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.17 
 
 
346 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0491  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.66 
 
 
354 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  29.64 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.16 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0389  glycosyl transferase family 9  21.94 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.84 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1820  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.39 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.87 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  28.48 
 
 
341 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  29.87 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0032  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.55 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0291  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.52 
 
 
346 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0586  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.52 
 
 
346 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2419  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  30.52 
 
 
346 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  30.84 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.48 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4832  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.23 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329757  hitchhiker  0.0000441962 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.54 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03477  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.82 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000025219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0085  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.27 
 
 
348 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000038978  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03428  hypothetical protein  25.82 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000123646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0089  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.82 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000834595  normal  0.156713 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4047  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.82 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000910947  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3957  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.82 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000313085  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3831  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.82 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000276456  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4123  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.82 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0437858  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4993  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  26.75 
 
 
348 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211589  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4036  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  24.52 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3910  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  24.52 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4097  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  24.52 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3929  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  24.52 
 
 
348 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0337  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.22 
 
 
343 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3991  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  24.52 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06145  hypothetical protein  23.96 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.871394  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1535  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.15 
 
 
346 aa  70.9  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3033  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0282  glycosyl transferase family 9  26.41 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0116  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  26.61 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1852  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.9 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3949  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  24.84 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0156  glycosyl transferase family 9  25.6 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0639777  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2553  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.18 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2022  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.51 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2633  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.51 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609317  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0665  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.18 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5248  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0108577 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4089  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.4 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.07 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0545  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.62 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0086605  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0229  glycosyl transferase family 9  24.18 
 
 
348 aa  66.2  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  28.43 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0372  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
369 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17200  glycosyl transferase family 9  26.89 
 
 
360 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4826  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  27.44 
 
 
348 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290967  hitchhiker  0.000199841 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0073  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23.47 
 
 
356 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0114  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.45 
 
 
367 aa  65.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0393  glycosyl transferase family protein  19.5 
 
 
385 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.326109  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0170  lipopolysaccharide heptosyltransferase III  23 
 
 
361 aa  64.3  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2876  hypothetical protein  20.13 
 
 
359 aa  63.2  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  25.08 
 
 
354 aa  63.2  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3296  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.39 
 
 
337 aa  63.2  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.4 
 
 
344 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1775  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.6 
 
 
389 aa  62.8  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0175609  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0063  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.87 
 
 
354 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.877737  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4147  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  26.16 
 
 
354 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0579  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.74 
 
 
347 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0417722 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0069  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  26.16 
 
 
354 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270694  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0520  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
344 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1433  heptosyltransferase family protein  23.22 
 
 
372 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561852  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.84 
 
 
349 aa  62  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.46 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.911139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3226  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 
364 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  23.48 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  25.07 
 
 
347 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0626  glycosyl transferase family protein  19.8 
 
 
340 aa  61.2  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0429094  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4370  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  25.91 
 
 
355 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2520  glycosyl transferase family protein  20.52 
 
 
354 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0366  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.83 
 
 
349 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4362  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 
368 aa  60.1  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.68 
 
 
360 aa  60.1  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.539129  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.83 
 
 
349 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4386  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.7 
 
 
415 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  24.18 
 
 
334 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5964  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.15 
 
 
329 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.65 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0026899  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.83 
 
 
349 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3841  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.65 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03489  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.65 
 
 
352 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.339394  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0160  glycosyl transferase family 9  23.43 
 
 
345 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.081148  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0172  ADP-heptose:LPS heptosyltransferase II  26.38 
 
 
350 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.063279  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.12 
 
 
339 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.5 
 
 
349 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2662  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.8 
 
 
329 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879845  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0152  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  24.4 
 
 
367 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3967  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  22.65 
 
 
352 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  24.1 
 
 
335 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0465  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.54 
 
 
344 aa  57  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>