More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1023 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  100 
 
 		 287 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1002  alpha/beta family hydrolase  46.26 
 
 		 292 aa  279  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  44.48 
 
 		 287 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  44.48 
 
 		 287 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  44.48 
 
 		 287 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  43.42 
 
 		 288 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  42.35 
 
 		 288 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  43.06 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4067  alpha/beta hydrolase fold  41.4 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241995  normal  0.431683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  40.21 
 
 		 293 aa  228  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  36.61 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  36.61 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  32.1 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  31.37 
 
 		 271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 273 aa  108  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  29.15 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 316 aa  105  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 295 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 361 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  29.18 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 		 302 aa  99.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 		 350 aa  98.6  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 277 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  27.63 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 		 279 aa  96.7  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2891  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 288 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.265351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 283 aa  95.9  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 		 282 aa  95.9  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 279 aa  95.9  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  29.21 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 281 aa  94  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 350 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 290 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 277 aa  92.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 284 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  29.82 
 
 		 289 aa  89.7  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  26.77 
 
 		 256 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  27.93 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 268 aa  89.7  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3549  HOMODA hydrolase (CmtE)  26.78 
 
 		 301 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  29.52 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 		 322 aa  88.2  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  25.91 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  23.62 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  25.55 
 
 		 263 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.77 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 290 aa  86.3  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 265 aa  85.9  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 		 340 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  29.83 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  26.77 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  26.77 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  26.77 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.77 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  26.77 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  26.77 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  26.14 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  26.14 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.78 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  25.7 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>