273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0897 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  100 
 
 
287 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  73.59 
 
 
284 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  72 
 
 
284 aa  417  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  72.46 
 
 
282 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  59.76 
 
 
271 aa  316  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  57.77 
 
 
271 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  59.04 
 
 
280 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  56.52 
 
 
272 aa  298  5e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  56.45 
 
 
276 aa  298  6e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  57.56 
 
 
271 aa  292  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  53.38 
 
 
271 aa  291  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  54.58 
 
 
267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  49.39 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  50.2 
 
 
273 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  46.81 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  48.16 
 
 
273 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  50.41 
 
 
270 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  49.39 
 
 
267 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  46.06 
 
 
277 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  44.77 
 
 
266 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  42.29 
 
 
271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  39.92 
 
 
264 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  39.36 
 
 
258 aa  169  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  40.43 
 
 
255 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  36.4 
 
 
270 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 
270 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  35.8 
 
 
285 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
280 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  35.8 
 
 
286 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  47.62 
 
 
176 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  34.03 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  34.16 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  34.16 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  34.57 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  32.93 
 
 
390 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  33.06 
 
 
277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
259 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  32.65 
 
 
277 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  31.93 
 
 
277 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 
275 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  24.22 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
297 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  24.34 
 
 
344 aa  62.4  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  22.96 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
406 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  25.78 
 
 
278 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  21.89 
 
 
278 aa  59.3  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  22.36 
 
 
293 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  24.16 
 
 
295 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  24.51 
 
 
387 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 
267 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  25 
 
 
377 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  24.75 
 
 
353 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 
257 aa  55.8  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  22.49 
 
 
331 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  22.7 
 
 
298 aa  56.2  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 
387 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  24.42 
 
 
352 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  26.5 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 
352 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 
353 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 
271 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
271 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  23.13 
 
 
301 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  24.02 
 
 
285 aa  53.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  24.12 
 
 
276 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  23.76 
 
 
333 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
282 aa  52.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
275 aa  52.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  23.63 
 
 
285 aa  52.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  23.11 
 
 
271 aa  52.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 
282 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 
282 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  24.43 
 
 
259 aa  52.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
268 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
308 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  28.45 
 
 
279 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 
283 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  26.78 
 
 
334 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
267 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  22.74 
 
 
300 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  22.58 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  26.96 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  26.3 
 
 
279 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
309 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>