163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0240 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0240  putative cytochrome c  100 
 
 		 130 aa  265  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2327  cytochrome c  45.36 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1287  cytochrome c class I  42.06 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1723  cytochrome c, class I  38.18 
 
 		 124 aa  93.6  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1791  cytochrome c class I  45.79 
 
 		 224 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3471  cytochrome c, class I  43.56 
 
 		 199 aa  91.3  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2269  cytochrome c class I  38.1 
 
 		 129 aa  90.9  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0688156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4360  cytochrome c, class I  44.09 
 
 		 235 aa  90.5  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5367  cytochrome c class I  44.35 
 
 		 224 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.503612  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1172  cytochrome c class I  41.41 
 
 		 121 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.109894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2099  cytochrome c, class I  43.14 
 
 		 123 aa  89.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0651  cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11  45.28 
 
 		 308 aa  88.6  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6323  cytochrome c class I  48.31 
 
 		 130 aa  88.6  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3480  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3426  cytochrome c class I  39.81 
 
 		 263 aa  87  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0675  cytochrome c class I  40.4 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3501  cytochrome c, class I  39.39 
 
 		 225 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06950  electron carrier, putative  38.46 
 
 		 111 aa  85.9  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.073604  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4608  cytochrome c class I  40.7 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0752945 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2582  cytochrome c, class I  37.38 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170551 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1601  cytochrome c, class I  38.83 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0174  cytochrome c2  34 
 
 		 131 aa  84.3  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000396379  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4138  cytochrome c, class I  46.15 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0620  cytochrome c, class I  45.05 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.363015  normal  0.813784 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0153  cytochrome c heme-binding site:cytochrome c, class IA/ IB:cytochrome c, class I  34 
 
 		 131 aa  84.3  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000226956  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6382  cytochrome c class I  43.56 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.832746  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0257  cytochrome c class I  40.21 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.466449  hitchhiker  0.00512389 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2670  cytochrome c class I  40.21 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2424  cytochrome c class I  37.86 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.385069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3552  cytochrome c, class I  39.62 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2595  cytochrome c class I  34.65 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0211957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1618  cytochrome c class I  42.31 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278765  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3480  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453541  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0032  cytochrome c, class I  38.82 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00501524  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0817  cytochrome c, class I  39.6 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.419035  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2511  cytochrome c class I  33.83 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.657545  normal  0.0330621 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3205  cytochrome c, class I  35.48 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.983514  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1808  cytochrome c, class I  39 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.115108 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2577  isocytochrome c2  39.81 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1235  cytochrome c, class I  39.81 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15043  predicted protein  36.96 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000188327  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2948  cytochrome c class I  37.74 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0157  cytochrome c class I  43.62 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4085  cytochrome c, class I  43.52 
 
 		 286 aa  80.9  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.699648  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2218  cytochrome c class I  46.15 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925658 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3651  cytochrome c, class I  42.27 
 
 		 158 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1946  cytochrome c, class I  41.24 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.719262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2961  cytochrome c class I  42.11 
 
 		 113 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0666033  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0131  cytochrome c, class I  39.18 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0513  cytochrome c class I  40.95 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78490  cytochrome c  36.05 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.635362  normal  0.967273 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0414  cytochrome c class I  44.68 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.299698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3032  cytochrome c class I  38.54 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289896  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0860  cytochrome c class I  39.36 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2801  cytochrome c  41.49 
 
 		 342 aa  78.6  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.26281 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4687  cytochrome c, class I  38.32 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0285175  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0011  cytochrome c class I  34.65 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0553485  normal  0.905582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4131  cytochrome c, class I  42.71 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0885  cytochrome c class I  38.3 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.752679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4583  cytochrome c class I  37.78 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00400374  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0924  cytochrome c class I  38.3 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.269512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3255  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000474848  decreased coverage  0.000193536 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2800  cytochrome c  35.71 
 
 		 235 aa  77.4  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1584  cytochrome c, class I  37 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0893762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2126  cytochrome c, class I  42.16 
 
 		 140 aa  76.6  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00970187  hitchhiker  0.00260519 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2922  cytochrome c, class I  38.18 
 
 		 133 aa  76.6  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4156  cytochrome c, class I  38.71 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1533  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3817  cytochrome c, class I  41.38 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.376417  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2070  cytochrome c2  34.34 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1880  cytochrome c, class I  36.36 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0287  cytochrome c, class I  35.14 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1769  cytochrome c, class I  37.63 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.027087 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1443  cytochrome c, class I  36.28 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1835  cytochrome c, class I  35.19 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.315382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1661  cytochrome C  36.84 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0420  cytochrome c class I  37.62 
 
 		 307 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_20948  predicted protein  34.48 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  40.43 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0011  cytochrome c class I  36.67 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2411  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2974  cytochrome c class I  41.57 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.835842  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2962  cytochrome c class I  35.35 
 
 		 448 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4085  cytochrome c class I  40 
 
 		 188 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0508  cytochrome c class I  39.64 
 
 		 404 aa  73.6  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.278983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2844  WD-40 repeat-containing protein  37.11 
 
 		 440 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3070  WD-40 repeat protein  37.11 
 
 		 438 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0102  cytochrome c  37.96 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.108181  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4215  cytochrome c class I  38.04 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.26019  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4031  class I cytochrome c  40.22 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.586339 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0431  cytochrome c, class I  38.05 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00210  cytochrome C2  37.78 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3944  cytochrome c class I  35.48 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0621  cytochrome c, class I  34.65 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.276705  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0016  cytochrome c class I  39.42 
 
 		 224 aa  70.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6838  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3289  cytochrome c class I  40 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.181782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0341  cytochrome c class I  35.64 
 
 		 305 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0654  cytochrome c552  32.41 
 
 		 174 aa  70.5  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0386  cytochrome c class I  35.64 
 
 		 305 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0274347  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0404  cytochrome c, class I  34.38 
 
 		 427 aa  70.5  0.000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.06087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3357  cytochrome c class I  36.19 
 
 		 179 aa  70.1  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.614662  normal  0.166545 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>