More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1777 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1777  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
152 aa  300  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.520822  hitchhiker  0.000000145352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4893  response regulator receiver protein  95.39 
 
 
170 aa  290  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.867558  normal  0.279081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3355  two component Fis family transcriptional regulator  82.24 
 
 
158 aa  253  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.798424  hitchhiker  0.00000556117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 
955 aa  87.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1555  response regulator receiver protein  40.46 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.120693  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
1297 aa  77.8  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1458  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 
585 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 
882 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 
865 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.81 
 
 
656 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  36 
 
 
1303 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 
666 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 
666 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
242 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
519 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  32.77 
 
 
242 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.06 
 
 
1431 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 
708 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3889  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
794 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
794 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410783  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
1419 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2452  histidine kinase  37.61 
 
 
459 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.137495  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 
1557 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 
1000 aa  71.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.97 
 
 
823 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
701 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.11 
 
 
1184 aa  70.9  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
245 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 
1478 aa  70.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
889 aa  70.5  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
1287 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  34.29 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 
844 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.64 
 
 
844 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 
628 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1392  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  35.34 
 
 
988 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.659485  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3046  heavy metal ABC transporter permease protein/ATP-binding protein/response regulator  35.34 
 
 
988 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3174  heavy metal ABC transporter permease protein/ATP-binding protein/response regulator  35.34 
 
 
988 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1016  putative ABC transporter, ATP-binding protein  35.34 
 
 
988 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2280  putative ABC transporter, ATP-binding protein  35.34 
 
 
988 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 
664 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1304  putative ABC transporter, ATP-binding protein  35.34 
 
 
988 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02235  composite two-component sensor kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  36.8 
 
 
796 aa  68.9  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 
1002 aa  68.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 
663 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4889  two component AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 
288 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  hitchhiker  0.00503781 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  35.48 
 
 
725 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
672 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4245  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
654 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  31.93 
 
 
242 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 
587 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.12 
 
 
243 aa  67  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 
1267 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 
225 aa  67  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3270  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
796 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.498059 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  32.48 
 
 
226 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  32.2 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4016  CheA signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
989 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 
781 aa  67  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4054  CheA signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
989 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264346  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 
1344 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09580  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.29 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0818  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.501115  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  37.29 
 
 
659 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0370  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
1070 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
1331 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1221  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.21 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.655279  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.45 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  29.13 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3028  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 
702 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.337956  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1492  histidine kinase  38.1 
 
 
519 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.416072 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5171  histidine kinase  33.08 
 
 
584 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.944283 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 
568 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
768 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2964  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.61 
 
 
441 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.108805 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
768 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.48 
 
 
1242 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
768 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41160  Response regulator  33.62 
 
 
261 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  33.33 
 
 
1347 aa  64.7  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  33.86 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0059  response regulator receiver domain-containing protein  31.09 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.157498  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4854  two component transcriptional regulator  32.8 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1492  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 
606 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216645  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000815  C4-dicarboxylate transport transcriptional regulatory protein  32.03 
 
 
449 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  31.75 
 
 
961 aa  64.3  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3134  histidine kinase  39.83 
 
 
702 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22778  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 
660 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3169  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.78 
 
 
444 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254755  normal  0.187976 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.25 
 
 
231 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0496  two component AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 
543 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2956  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 
752 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.660632  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1338  histidine kinase  33.61 
 
 
293 aa  64.3  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0669  transcription regulator CtrA  32 
 
 
231 aa  63.9  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.7626  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.7 
 
 
869 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2781  two component LuxR family transcriptional regulator  38.32 
 
 
204 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.35 
 
 
720 aa  63.9  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>