123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0099 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0099  putative nodulin-related protein  100 
 
 		 160 aa  310  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1040  hypothetical protein  62.09 
 
 		 233 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1963  hypothetical protein  68.18 
 
 		 233 aa  174  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3654  putative nodulin-related protein  62.67 
 
 		 233 aa  172  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2712  hypothetical protein  68.67 
 
 		 235 aa  168  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4169  protein of unknown function DUF125 transmembrane  67.88 
 
 		 231 aa  167  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2089  hypothetical protein  65.47 
 
 		 235 aa  166  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3014  hypothetical protein  68 
 
 		 235 aa  166  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5214  hypothetical protein  67.15 
 
 		 231 aa  166  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4695  hypothetical protein  67.15 
 
 		 231 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0169  hypothetical protein  65.33 
 
 		 230 aa  164  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3927  hypothetical protein  58.82 
 
 		 233 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  60.67 
 
 		 234 aa  163  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.233589 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0163  protein of unknown function DUF125 transmembrane  64.75 
 
 		 232 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2740  hypothetical protein  64.71 
 
 		 233 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2446  hypothetical protein  58.97 
 
 		 228 aa  159  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0274755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3717  hypothetical protein  60.67 
 
 		 233 aa  157  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  56.67 
 
 		 231 aa  155  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4376  hypothetical protein  65.54 
 
 		 211 aa  154  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3122  protein of unknown function DUF125 transmembrane  59.48 
 
 		 231 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04429  conserved mebrane associated protein  61.33 
 
 		 231 aa  152  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2462  hypothetical protein  62.04 
 
 		 230 aa  151  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1569  hypothetical protein  60.96 
 
 		 229 aa  151  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00144859  normal  0.688354 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1998  hypothetical protein  56.55 
 
 		 242 aa  150  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0347825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6021  hypothetical protein  54.19 
 
 		 190 aa  150  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4657  hypothetical protein  56.67 
 
 		 231 aa  148  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262976  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0273  hypothetical protein  62.67 
 
 		 231 aa  149  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0802  protein of unknown function DUF125 transmembrane  57.42 
 
 		 236 aa  147  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3035  hypothetical protein  56.55 
 
 		 263 aa  143  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1537  hypothetical protein  61.69 
 
 		 235 aa  142  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  56.43 
 
 		 233 aa  141  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1872  hypothetical protein  69.29 
 
 		 231 aa  141  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00204012  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1290  integral membrane protein  53.25 
 
 		 233 aa  140  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.703645  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2425  hypothetical protein  60.4 
 
 		 231 aa  141  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2082  hypothetical protein  55 
 
 		 233 aa  136  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4471  hypothetical protein  50 
 
 		 229 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1253  hypothetical protein  56.2 
 
 		 235 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1938  hypothetical protein  50.67 
 
 		 239 aa  127  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0601853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  50.34 
 
 		 246 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1833  protein of unknown function DUF125 transmembrane  48.75 
 
 		 242 aa  124  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  47.37 
 
 		 238 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0025  hypothetical protein  57.72 
 
 		 239 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5552  hypothetical protein  53.24 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2119  hypothetical protein  59.32 
 
 		 229 aa  118  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00934524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5187  hypothetical protein  63.41 
 
 		 166 aa  117  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  45 
 
 		 232 aa  116  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1084  hypothetical protein  50.34 
 
 		 241 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0429154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1411  hypothetical protein  46.98 
 
 		 243 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0652587  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3365  hypothetical protein  51.33 
 
 		 234 aa  110  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.625585 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0332  protein of unknown function DUF125 transmembrane  52.6 
 
 		 230 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.361315  normal  0.131198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0153  integral membrane protein  52.6 
 
 		 230 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1077  hypothetical protein  43.04 
 
 		 245 aa  103  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.040986  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5770  hypothetical protein  40.26 
 
 		 357 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2869  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.36 
 
 		 235 aa  98.2  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5704  protein of unknown function DUF125 transmembrane  42.96 
 
 		 265 aa  98.2  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36050  uncharacterized membrane protein  48.97 
 
 		 240 aa  97.4  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.787149  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  33.99 
 
 		 227 aa  95.9  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1320  hypothetical protein  38.85 
 
 		 237 aa  95.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230604  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  44.9 
 
 		 343 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0836  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.94 
 
 		 233 aa  91.7  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.30782  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1363  hypothetical protein  40.13 
 
 		 237 aa  90.1  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  37.18 
 
 		 376 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14200  hypothetical protein  41.26 
 
 		 250 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0798  hypothetical protein  35.57 
 
 		 226 aa  88.2  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  39.87 
 
 		 376 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.144378 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0592  hypothetical protein  38.3 
 
 		 227 aa  85.9  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000251129  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  40.56 
 
 		 374 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0493  hypothetical protein  34.13 
 
 		 228 aa  85.1  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  38.78 
 
 		 372 aa  84.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1566  hypothetical protein  29.8 
 
 		 226 aa  84.3  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.332495  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1741  protein of unknown function DUF125 transmembrane  42.36 
 
 		 229 aa  84.3  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0272  hypothetical protein  49.33 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2315  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0746  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.1 
 
 		 372 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0747  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.1 
 
 		 372 aa  81.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0141065  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1567  hypothetical protein  35.57 
 
 		 229 aa  80.9  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.537256  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1508  hypothetical protein  32.7 
 
 		 230 aa  80.9  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00139077  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  37.41 
 
 		 371 aa  80.9  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0211  protein of unknown function DUF125 transmembrane  46.76 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0482  hypothetical protein  32.3 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0454361  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1793  hypothetical protein  32.3 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0494  hypothetical protein  33.79 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.167313  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4934  hypothetical protein  41.96 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0131166  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  43.54 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3979  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.67 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4534  hypothetical protein  38.78 
 
 		 249 aa  70.5  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0182642 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  45.74 
 
 		 365 aa  67.8  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2727  hypothetical protein  30.77 
 
 		 244 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0431  protein of unknown function DUF125 transmembrane  44.97 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.748606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0481  hypothetical protein  29.79 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00758654  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1792  hypothetical protein  29.79 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  40.43 
 
 		 376 aa  65.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  42.55 
 
 		 368 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3441  protein of unknown function DUF125 transmembrane  34.64 
 
 		 235 aa  63.9  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.720672  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3434  hypothetical protein  32.05 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.195788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3497  hypothetical protein  32.05 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3445  hypothetical protein  32.05 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.997991  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0525  hypothetical protein  42.45 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.453815  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2329  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.89 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.497478  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.3 
 
 		 396 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19200  uncharacterized membrane protein  42.67 
 
 		 323 aa  61.2  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.243725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>