223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3198 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3198  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  100 
 
 		 436 aa  876    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000108152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0019  hypothetical protein  22.05 
 
 		 147 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0018  hypothetical protein  22.05 
 
 		 147 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.354059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0019  hypothetical protein  22.05 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.644907 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0019  hypothetical protein  22.05 
 
 		 147 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0019  hypothetical protein  22.05 
 
 		 147 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.975768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1879  two component transcriptional regulator  38.27 
 
 		 224 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0517799  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0495  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.03 
 
 		 232 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1373  two component transcriptional regulator  37.8 
 
 		 265 aa  53.1  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2074  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4329  two component transcriptional regulator  37.97 
 
 		 236 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.077082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  32.84 
 
 		 270 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2163  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 231 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0032  hypothetical protein  33.67 
 
 		 149 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0693135 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0799  two component transcriptional regulator  25.97 
 
 		 225 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0521  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 246 aa  51.2  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  37.36 
 
 		 244 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 248 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0032  hypothetical protein  32.97 
 
 		 149 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16727 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4572  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 235 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.947729  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0031  hypothetical protein  32.97 
 
 		 149 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119612  normal  0.0428239 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0343  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 228 aa  50.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0033  hypothetical protein  32.97 
 
 		 149 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.901847  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2177  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.27 
 
 		 235 aa  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1528  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 224 aa  50.1  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3551  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.51 
 
 		 224 aa  49.7  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.375493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5381  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.26 
 
 		 235 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0373  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.13 
 
 		 237 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3334  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 223 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  30.26 
 
 		 223 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0940  transcriptional regulator domain protein  28.67 
 
 		 296 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000423424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4531  DNA-binding response regulator  32.26 
 
 		 235 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4337  DNA-binding response regulator  32.26 
 
 		 235 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4173  response regulator  32.26 
 
 		 235 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.407882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4184  response regulator  32.26 
 
 		 235 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0033  hypothetical protein  36.25 
 
 		 149 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.61549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0541  two component transcriptional regulator  31.11 
 
 		 230 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4671  DNA-binding response regulator  32.26 
 
 		 235 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.292793  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0033  putative transcriptional regulator  23.77 
 
 		 146 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191558  normal  0.0305605 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 228 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4519  DNA-binding response regulator  32.26 
 
 		 235 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02492  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  29.51 
 
 		 229 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.506678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  34.48 
 
 		 227 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  46.34 
 
 		 240 aa  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  31.96 
 
 		 975 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0367  response regulator receiver  26.61 
 
 		 233 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4677  two component transcriptional regulator  32.93 
 
 		 231 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2021  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.53 
 
 		 236 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48021  normal  0.282737 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.1 
 
 		 234 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0677  DNA-binding response regulator  31.18 
 
 		 252 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00651698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4557  DNA-binding response regulator  31.18 
 
 		 235 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4961  DNA-binding response regulator  32.93 
 
 		 231 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4223  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.53 
 
 		 226 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000102305  normal  0.0938221 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0272  DNA-binding response regulator  32.93 
 
 		 231 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1791  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.93 
 
 		 240 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0358  transcriptional regulator, CadC  30.77 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2094  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.23 
 
 		 231 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3154  two component transcriptional regulator  30.11 
 
 		 235 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0856  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.32 
 
 		 233 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4725  DNA-binding response regulator  32.93 
 
 		 231 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4567  DNA-binding response regulator  32.93 
 
 		 231 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000110456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4587  DNA-binding response regulator  32.93 
 
 		 231 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.93847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5087  DNA-binding response regulator  32.93 
 
 		 231 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0089  response regulator receiver protein  39.08 
 
 		 171 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4976  DNA-binding response regulator  32.93 
 
 		 231 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4948  DNA-binding response regulator  32.93 
 
 		 231 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4285  two component transcriptional regulator  31.18 
 
 		 235 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4989  DNA-binding response regulator  32.93 
 
 		 231 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3546  two component transcriptional regulator  35.16 
 
 		 273 aa  47  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  0.686762 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0768  two component signal transduction response regulator  27.19 
 
 		 236 aa  47.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000566504  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  32.98 
 
 		 227 aa  47  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2487  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.77 
 
 		 231 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.77 
 
 		 231 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  29.37 
 
 		 225 aa  47  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.46 
 
 		 231 aa  46.6  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1464  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 222 aa  46.6  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.286623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0395  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.65 
 
 		 240 aa  46.6  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13160  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  29.55 
 
 		 228 aa  46.6  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.719024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 243 aa  46.6  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0554  DNA-binding response regulator  27.1 
 
 		 223 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5681  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 227 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 490 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1659  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0585  DNA-binding response regulator  27.1 
 
 		 223 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2294  two component transcriptional regulator  34.02 
 
 		 228 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2870  putative transcriptional regulator, CadC  27.61 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0035  putative transcription regulator  28.95 
 
 		 145 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920795  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10143  two-component system response regulator  26.26 
 
 		 289 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 243 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  32.46 
 
 		 236 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1415  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 222 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.279939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0053  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 229 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000176822 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0051  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 229 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0034  putative transcription regulator  28.95 
 
 		 145 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.373461  normal  0.126602 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0847  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  28.26 
 
 		 700 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.704427  normal  0.802494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 243 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0937  transcriptional regulator, CadC  27.59 
 
 		 696 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004138  transcriptional activator ToxR  31.65 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877918  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6742  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 242 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0242  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 238 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.26673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>