28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0031 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0031  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119612  normal  0.0428239 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0032  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16727 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0033  hypothetical protein  99.33 
 
 		 149 aa  303  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.901847  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0032  hypothetical protein  97.32 
 
 		 149 aa  279  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0693135 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0033  hypothetical protein  85.23 
 
 		 149 aa  242  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.61549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0019  hypothetical protein  47.01 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.644907 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0019  hypothetical protein  47.01 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0018  hypothetical protein  47.01 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.354059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0019  hypothetical protein  47.01 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.975768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0019  hypothetical protein  47.01 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0034  putative transcription regulator  44.64 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.373461  normal  0.126602 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0035  putative transcription regulator  43.59 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920795  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0033  putative transcriptional regulator  44.64 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191558  normal  0.0305605 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1270  putative transcriptional regulator  31.01 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.474734 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3198  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  32.97 
 
 		 436 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000108152  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B3983  transcriptional regulatory protein, C  30.1 
 
 		 254 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3964  transcriptional regulatory protein C  30.1 
 
 		 254 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4087  transcriptional regulator C  30.1 
 
 		 254 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4037  transcriptional regulator C  30.1 
 
 		 254 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.975119  normal  0.932239 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4134  transcriptional regulator, CadC  31.53 
 
 		 267 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.907655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0868  transcriptional regulator, CadC  28.03 
 
 		 269 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2994  transcriptional regulatory protein, C terminal  28.03 
 
 		 269 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000031675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4116  transcriptional regulatory protein  28.24 
 
 		 269 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000375254 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0842  transcriptional regulator, CadC  28.03 
 
 		 269 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4728  transcriptional regulator, CadC  30.3 
 
 		 256 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000608596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3169  transcriptional regulatory protein, C terminal  28.03 
 
 		 269 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4726  transcriptional regulator, CadC  30.3 
 
 		 255 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0273728  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_0195  transcriptional regulator, CadC  26.19 
 
 		 277 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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