21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0033 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0033  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  300  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191558  normal  0.0305605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0035  putative transcription regulator  95.21 
 
 		 145 aa  280  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920795  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0034  putative transcription regulator  94.52 
 
 		 145 aa  277  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.373461  normal  0.126602 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0018  hypothetical protein  48.15 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.354059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0019  hypothetical protein  48.15 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.644907 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0019  hypothetical protein  48.15 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.975768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0019  hypothetical protein  48.15 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0019  hypothetical protein  48.15 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0031  hypothetical protein  45.87 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119612  normal  0.0428239 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0033  hypothetical protein  40.48 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.901847  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0032  hypothetical protein  45.87 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16727 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0032  hypothetical protein  45.87 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0693135 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0033  hypothetical protein  45.87 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.61549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1270  putative transcriptional regulator  26.13 
 
 		 270 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.474734 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3198  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  23.77 
 
 		 436 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000108152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4726  transcriptional regulator, CadC  30.43 
 
 		 255 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0273728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4134  transcriptional regulator, CadC  31.58 
 
 		 267 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.907655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004138  transcriptional activator ToxR  27 
 
 		 292 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877918  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4037  transcriptional regulator C  20.26 
 
 		 254 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.975119  normal  0.932239 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01326  hypothetical protein  27 
 
 		 290 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2923  transcriptional regulator, CadC  28.46 
 
 		 711 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>