30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0019 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B0019  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0019  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0018  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.354059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0019  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.975768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0019  hypothetical protein  99.32 
 
 		 147 aa  299  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.644907 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0032  hypothetical protein  48.72 
 
 		 149 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0693135 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0033  hypothetical protein  49.11 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.901847  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0031  hypothetical protein  49.11 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119612  normal  0.0428239 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0032  hypothetical protein  49.11 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16727 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0033  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.61549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0034  putative transcription regulator  40.44 
 
 		 145 aa  120  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.373461  normal  0.126602 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0035  putative transcription regulator  42.55 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920795  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0033  putative transcriptional regulator  48.15 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191558  normal  0.0305605 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1270  putative transcriptional regulator  28.07 
 
 		 270 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.474734 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3198  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  22.05 
 
 		 436 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000108152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4134  transcriptional regulator, CadC  28.12 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.907655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4037  transcriptional regulator C  29.36 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.975119  normal  0.932239 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0868  transcriptional regulator, CadC  28.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0842  transcriptional regulator, CadC  28.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2994  transcriptional regulatory protein, C terminal  28.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000031675  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3983  transcriptional regulatory protein, C  28.44 
 
 		 254 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4116  transcriptional regulatory protein  30.56 
 
 		 269 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000375254 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4087  transcriptional regulator C  28.44 
 
 		 254 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3169  transcriptional regulatory protein, C terminal  28.91 
 
 		 269 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3964  transcriptional regulatory protein C  29.36 
 
 		 254 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4728  transcriptional regulator, CadC  27.55 
 
 		 256 aa  51.6  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000608596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4726  transcriptional regulator, CadC  25.38 
 
 		 255 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0273728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0251  DNA-binding winged-HTH domain-containing protein  26.21 
 
 		 255 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.77 
 
 		 223 aa  41.2  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0689  putative transcriptional regulator, CadC  22.41 
 
 		 195 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>