53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1270 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1270  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 270 aa  556  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.474734 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4037  transcriptional regulator C  28.89 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.975119  normal  0.932239 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4087  transcriptional regulator C  28.52 
 
 		 254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3983  transcriptional regulatory protein, C  28.52 
 
 		 254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3964  transcriptional regulatory protein C  28.89 
 
 		 254 aa  135  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0842  transcriptional regulator, CadC  31.88 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3169  transcriptional regulatory protein, C terminal  31.52 
 
 		 269 aa  122  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0868  transcriptional regulator, CadC  31.52 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2994  transcriptional regulatory protein, C terminal  31.52 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000031675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4116  transcriptional regulatory protein  31.16 
 
 		 269 aa  119  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000375254 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0019  hypothetical protein  28.07 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0019  hypothetical protein  28.07 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.975768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0018  hypothetical protein  28.07 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.354059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0019  hypothetical protein  28.07 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0019  hypothetical protein  28.07 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.644907 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0032  hypothetical protein  30.09 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0693135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0032  hypothetical protein  30.09 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16727 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0031  hypothetical protein  30.09 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.119612  normal  0.0428239 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0033  hypothetical protein  30.09 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.901847  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1500  transcriptional regulator, CadC  29.41 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0034  putative transcription regulator  26.5 
 
 		 145 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.373461  normal  0.126602 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0033  putative transcriptional regulator  27.05 
 
 		 146 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191558  normal  0.0305605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0035  putative transcription regulator  25.98 
 
 		 145 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.920795  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0033  hypothetical protein  28.83 
 
 		 149 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.61549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4726  transcriptional regulator, CadC  26.92 
 
 		 255 aa  48.9  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0273728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3304  transcriptional regulatory protein-like protein  30.23 
 
 		 580 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0505  cholera toxin transcriptional activator  27.27 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4134  transcriptional regulator, CadC  22.86 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.907655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5151  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 330 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5241  LuxR family DNA-binding response regulator  27.27 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0097  two component transcriptional regulator  30.59 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0397  two component transcriptional regulator  30.23 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0298  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.23 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.77813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0293  two component transcriptional regulator  30.23 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.973428  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0286  two component transcriptional regulator  30.23 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0294  two component transcriptional regulator  30.23 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  33.66 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4392  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0025821  decreased coverage  0.00000564878 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7053  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.87 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00262574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1213  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.21 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0109  response regulator receiver  31.76 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000662688  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4783  two component transcriptional regulator  30.59 
 
 		 225 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000784885  unclonable  0.00000000984925 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2923  transcriptional regulator, CadC  33.33 
 
 		 711 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4110  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 225 aa  43.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0827  transcriptional regulator, CadC  28 
 
 		 261 aa  43.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3534  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 225 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.868885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5788  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.91 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4467  transcriptional regulator, CadC  26 
 
 		 427 aa  42.7  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0689  putative transcriptional regulator, CadC  22.61 
 
 		 195 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1875  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  33.33 
 
 		 183 aa  42.7  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4728  transcriptional regulator, CadC  30.1 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000608596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2919  transcriptional regulatory protein-like protein  24.68 
 
 		 604 aa  42.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.104867  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26840  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.52 
 
 		 227 aa  42.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.871857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>