More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4290 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4290  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 308 aa  624  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3911  LysR family transcriptional regulator  59.27 
 
 		 311 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.954756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0807  LysR family transcriptional regulator  57.91 
 
 		 310 aa  361  7.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0259  LysR family transcriptional regulator  51.48 
 
 		 330 aa  330  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3570  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0065  transcription regulator protein  40.27 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3361  transcriptional regulator, LysR family  38.83 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3684  transcriptional regulator, LysR family  38.51 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1113  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.293194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2289  transcriptional regulator, LysR family  38.8 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1971  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4797  transcriptional regulator, LysR family  35.97 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0282773  hitchhiker  0.00000720419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1864  LysR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 331 aa  185  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708451  normal  0.0358907 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 313 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 313 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 313 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0237  putative transcriptional regulator  36.82 
 
 		 355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04020  Transcriptional regulator, LysR family  36.7 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.010464  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 313 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1581  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 351 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 351 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 351 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 351 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  35.45 
 
 		 351 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 351 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 351 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4325  LysR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 315 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4041  LysR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 315 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 351 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0305  transcriptional regulator, LysR family  35.91 
 
 		 367 aa  179  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4285  LysR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 315 aa  178  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.300927 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4420  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 367 aa  178  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0287989 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01980  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 312 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.445097 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0031  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 362 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10730  transcriptional regulator, LysR family  38.18 
 
 		 311 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 313 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 298 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 313 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4777  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 299 aa  175  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2575  transcriptional regulator, LysR family  38.64 
 
 		 301 aa  175  9e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0931431  normal  0.61434 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  38.18 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3196  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3128  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1701  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0936  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0750  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.63163  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1679  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1855  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0412  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1469  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3069  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3186  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651713  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1021  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1681  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 315 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446962  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0969  LysR family substrate binding transcriptional regulator  33.56 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3252  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  33.56 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000563268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4475  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  35.14 
 
 		 301 aa  172  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2931  LysR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 352 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52930  transcriptional regulator  35.81 
 
 		 314 aa  172  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0056  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  36.39 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3147  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 349 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315246 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3131  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 349 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154836  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4638  transcriptional regulator  35.81 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1894  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 324 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2518  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 349 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2049  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535454  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4214  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.383155 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3220  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000114793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3167  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000529291  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6676  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.454387  normal  0.341133 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1914  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00000121317  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6482  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.833038 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5833  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3740  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3627  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 305 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  35.59 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0864  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6200  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0503075 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  35.35 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4343  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 327 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5836  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0596  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1839  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2624  transcriptional regulator  33.77 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210848  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0872  LysR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5996  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.48899 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2557  LysR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5024  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205227  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>