78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3552 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3552  OmpA/MotB  100 
 
 		 196 aa  373  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237192  normal  0.244916 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2987  OmpA/MotB domain-containing protein  59.69 
 
 		 179 aa  184  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.221024  normal  0.129145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2055  OmpA/MotB domain-containing protein  67.29 
 
 		 179 aa  138  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0263919  normal  0.321427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1878  OmpA/MotB domain protein  67.29 
 
 		 179 aa  138  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3940  OmpA/MotB domain-containing protein  47.18 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0125128  normal  0.230028 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2121  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  57.14 
 
 		 823 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.475646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2357  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  58.1 
 
 		 842 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131798  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2800  OmpA/MotB domain-containing protein  61.61 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.705658  normal  0.415796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3709  OmpA/MotB domain protein  38.22 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1793  OmpA/MotB  45.45 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.557894 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  61.54 
 
 		 557 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  51.58 
 
 		 517 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  51.58 
 
 		 517 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  51.58 
 
 		 517 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  55.21 
 
 		 538 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  51.58 
 
 		 525 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  51.58 
 
 		 525 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  51.58 
 
 		 525 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  60.94 
 
 		 532 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  51.04 
 
 		 525 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  60.94 
 
 		 532 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  60.94 
 
 		 532 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  50.53 
 
 		 525 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  59.38 
 
 		 535 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  59.38 
 
 		 535 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  59.38 
 
 		 532 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  62.12 
 
 		 544 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  59.38 
 
 		 531 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0102  outer membrane related peptidoglycan-associated lipoprotein  47.92 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207037  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.65 
 
 		 560 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  33.11 
 
 		 543 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6457  OmpA/MotB domain-containing protein  32.03 
 
 		 186 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  33.11 
 
 		 544 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 587 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.43 
 
 		 542 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0287  OmpA/MotB  38.68 
 
 		 513 aa  48.1  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  38.67 
 
 		 301 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  39.39 
 
 		 321 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  39.39 
 
 		 321 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  42.37 
 
 		 300 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2746  OmpA family protein  36 
 
 		 451 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1355  OmpA domain-containing protein  35.59 
 
 		 560 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1467  OmpA/MotB domain-containing protein  35.59 
 
 		 560 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.459953  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  42.42 
 
 		 310 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 308 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  35.29 
 
 		 317 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 313 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1725  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.94 
 
 		 286 aa  45.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.972471  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  44.44 
 
 		 310 aa  45.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2475  OmpA/MotB  34.92 
 
 		 447 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.201724  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  33.61 
 
 		 270 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3405  OmpA domain-containing protein  31.78 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 324 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.46 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2312  OmpA/MotB  34.43 
 
 		 225 aa  43.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 569 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  34.23 
 
 		 262 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0417  OmpA/MotB domain protein  28.99 
 
 		 585 aa  43.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.846597  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1980  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.85 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2832  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 512 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1412  OmpA/MotB domain-containing protein  35.44 
 
 		 321 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.166227  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2189  ompA family protein  34.34 
 
 		 271 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1724  TonB box domain-containing protein  31.85 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.036293 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2703  OmpA domain-containing protein  33.9 
 
 		 560 aa  42.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.74535  normal  0.0183644 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1676  hypothetical protein  36.79 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2689  hypothetical protein  34.86 
 
 		 465 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  32.47 
 
 		 280 aa  42.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  33.01 
 
 		 648 aa  42.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 316 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2645  OmpA/MotB  39.06 
 
 		 225 aa  41.6  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0918  peptidoglycan-associated lipoprotein  26.6 
 
 		 170 aa  41.6  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3127  OmpA domain-containing protein  40.98 
 
 		 550 aa  41.6  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  36.84 
 
 		 302 aa  41.2  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  34.34 
 
 		 271 aa  41.2  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  28.71 
 
 		 412 aa  41.2  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1393  polyketide synthase, type I  44.23 
 
 		 4555 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0122  OmpA/MotB domain protein  35.65 
 
 		 310 aa  41.2  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 383 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>