156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3490 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3490  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  226  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.982364 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1332  hypothetical protein  45.87 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0471  hypothetical protein  54.02 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5388  hypothetical protein  44.35 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4016  heavy metal efflux system protein  41.28 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  49.23 
 
 		 546 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4101  hypothetical protein  38.68 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.385135 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4752  hypothetical protein  38.68 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.533115  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3415  hypothetical protein  38.68 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  41.77 
 
 		 537 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3354  hypothetical protein  41.9 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  36.54 
 
 		 538 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.31 
 
 		 537 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2763  hypothetical protein  39.45 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5191  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.255118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  39.44 
 
 		 537 aa  63.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4052  Tn4652, TnpA repressor protein TnpC, putative  42.65 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2039  hypothetical protein  39.39 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2654  hypothetical protein  39.71 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0416  hypothetical protein  38.71 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0174  hypothetical protein  31.9 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6290  hypothetical protein  36.7 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.104471 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2196  hypothetical protein  37.84 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0199  hypothetical protein  35.45 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0715  hypothetical protein  36.94 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115312  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1958  RND family efflux transporter MFP subunit  34.65 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2428  heavy metal efflux system protein, putative  37.63 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.162369  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2057  hypothetical protein  37.63 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.754499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3979  hypothetical protein  41.18 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0733  hypothetical protein  39.06 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.124707  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2477  hypothetical protein  43.75 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  35 
 
 		 504 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.89 
 
 		 512 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2010  RND family efflux transporter MFP subunit  35.14 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  38.64 
 
 		 272 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2720  hypothetical protein  43.24 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00719919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0623  hypothetical protein  35.14 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6281  RND family efflux transporter MFP subunit  34.34 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2320  hypothetical protein  42.17 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2407  hypothetical protein  33.64 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2782  cation efflux system protein, putative  33.64 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1463  hypothetical protein  39.58 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1637  hypothetical protein  34.18 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.214754  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4560  hypothetical protein  40.91 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2049  RND family efflux transporter MFP subunit  43.33 
 
 		 523 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00264035 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 517 aa  57  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0023  hypothetical protein  40.52 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.803739 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3914  hypothetical protein  47.17 
 
 		 108 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248976  normal  0.907588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4028  hypothetical protein  47.17 
 
 		 108 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0335786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0023  hypothetical protein  40.52 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.814264  hitchhiker  0.0010274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0025  hypothetical protein  40.52 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.130406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3489  hypothetical protein  37.97 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5034  periplasmic copper-binding protein  39.73 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.152463 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2551  hypothetical protein  41.18 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  37.5 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132756  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3403  RND family efflux transporter MFP subunit  37.5 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2667  hypothetical protein  34.94 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.866517  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3042  RND family efflux transporter MFP subunit  33.94 
 
 		 487 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3912  hypothetical protein  30.43 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438117  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5848  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4456  hypothetical protein  30.43 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4550  hypothetical protein  40.3 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0069  cation efflux system domain-containing protein  39.13 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.323301 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4113  RND family efflux transporter MFP subunit  35.42 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2293  hypothetical protein  36.76 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119473  normal  0.136633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4353  RND family efflux transporter MFP subunit  36.96 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0871487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5684  hypothetical protein  47.17 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00534  periplasmic copper-binding protein  32.35 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3056  periplasmic copper-binding protein  32.35 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00523  hypothetical protein  32.35 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3073  periplasmic copper-binding protein  32.35 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0493  hypothetical protein  35.82 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119099 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3072  hypothetical protein  28.97 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 488 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561063  hitchhiker  0.00444957 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0620  periplasmic copper-binding protein  32.35 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000654239  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0591  periplasmic copper-binding protein  32.35 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00546027  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5685  RND family efflux transporter MFP subunit  32.99 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0152011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0021  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 488 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.249144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0023  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 488 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  31.86 
 
 		 540 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0591  periplasmic copper-binding protein  30.88 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.877525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3892  RND family efflux transporter MFP subunit  39.73 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3386  cation efflux system protein  41.94 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3365  hypothetical protein  36.76 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000106692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2442  putative copper efflux system periplasmic protein CusF  45 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2549  secretion protein HlyD  45.61 
 
 		 490 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0116  hypothetical protein  44.64 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1168  hypothetical protein  30.68 
 
 		 124 aa  51.2  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5386  CzcB family heavy metal RND efflux membrane fusion protein  32 
 
 		 490 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2262  hypothetical protein  37.93 
 
 		 112 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1326  hypothetical protein  36.36 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2891  hypothetical protein  25 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.94364  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0538  hypothetical protein  35.71 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0654  periplasmic copper-binding protein  30.88 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.380565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2325  RND family efflux transporter MFP subunit  37.84 
 
 		 513 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.757874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5183  RND family efflux transporter MFP subunit  34.67 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4298  periplasmic copper-binding protein  26.09 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3346  RND family efflux transporter MFP subunit  37.35 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7872  hypothetical protein  42.86 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3424  periplasmic copper-binding protein  26.09 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>