More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3274 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  100 
 
 
594 aa  1196    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  74.05 
 
 
582 aa  848    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  58.15 
 
 
573 aa  654    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  57.45 
 
 
566 aa  629  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  57.45 
 
 
580 aa  607  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  41.46 
 
 
565 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  40.7 
 
 
562 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  40.66 
 
 
555 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  40.31 
 
 
555 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  41.82 
 
 
554 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  40.03 
 
 
556 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  41.34 
 
 
533 aa  346  7e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  39.86 
 
 
556 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  39.34 
 
 
559 aa  336  5.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  39.41 
 
 
556 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  37.69 
 
 
556 aa  326  9e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  38.78 
 
 
529 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  37.39 
 
 
553 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  35.67 
 
 
563 aa  274  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  32.29 
 
 
571 aa  273  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  33.57 
 
 
595 aa  265  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  30.67 
 
 
570 aa  261  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  29.68 
 
 
576 aa  249  9e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  30.61 
 
 
574 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 
574 aa  243  7e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  29.76 
 
 
576 aa  234  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 
577 aa  231  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  29.78 
 
 
610 aa  229  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  30.98 
 
 
571 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  27.14 
 
 
580 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 
577 aa  221  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  30.46 
 
 
571 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 
621 aa  219  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  30.15 
 
 
572 aa  219  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  28.07 
 
 
590 aa  217  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  29.68 
 
 
579 aa  214  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  28.55 
 
 
596 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  27.09 
 
 
574 aa  212  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 
589 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  28.2 
 
 
606 aa  210  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 
585 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 
596 aa  208  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  27.52 
 
 
569 aa  207  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  26.76 
 
 
586 aa  206  7e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  27.99 
 
 
591 aa  206  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  44.2 
 
 
705 aa  205  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  29.44 
 
 
574 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  27.99 
 
 
569 aa  200  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  27.16 
 
 
599 aa  193  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  27.1 
 
 
548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.29 
 
 
598 aa  134  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.63 
 
 
863 aa  131  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  25 
 
 
605 aa  131  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  33.77 
 
 
618 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  30.06 
 
 
662 aa  128  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  29.53 
 
 
692 aa  128  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  31.32 
 
 
651 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 
615 aa  127  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.04 
 
 
667 aa  126  9e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 
598 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.47 
 
 
627 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  30.63 
 
 
666 aa  122  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.36 
 
 
594 aa  120  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  32.73 
 
 
691 aa  120  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 
938 aa  120  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.33 
 
 
613 aa  117  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.94 
 
 
520 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  33.82 
 
 
628 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  31.6 
 
 
623 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  30.42 
 
 
502 aa  115  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  27.74 
 
 
618 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.98 
 
 
700 aa  115  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 
565 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.94 
 
 
645 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  28.14 
 
 
894 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.91 
 
 
747 aa  114  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.27 
 
 
681 aa  114  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  31.67 
 
 
700 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 
666 aa  113  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  26.79 
 
 
761 aa  113  9e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  31.19 
 
 
661 aa  113  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.17 
 
 
916 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.27 
 
 
880 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  29.45 
 
 
625 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 
703 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  26.96 
 
 
889 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.21 
 
 
641 aa  112  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.07 
 
 
579 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  28.14 
 
 
638 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.84 
 
 
798 aa  112  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2445  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.5 
 
 
896 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  32.06 
 
 
642 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4274  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
481 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.700711  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  28.28 
 
 
455 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.42 
 
 
653 aa  111  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3077  serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 
708 aa  110  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  32.64 
 
 
503 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1817  serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 
613 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586991  normal  0.974704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4087  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 
1110 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  27.33 
 
 
617 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>