More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2780 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2780  ABC transporter related  100 
 
 		 263 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.949494  normal  0.138295 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2362  ABC transporter related  84.71 
 
 		 255 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2619  ABC transporter related  77.17 
 
 		 254 aa  396  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1101  ABC transporter related  68.22 
 
 		 260 aa  342  5e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1017  ABC transporter related  67.83 
 
 		 260 aa  341  7e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2552  ABC transporter related  69.69 
 
 		 260 aa  327  8e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2794  ABC transporter related  64.96 
 
 		 267 aa  304  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1542  ABC transporter-related protein  61.87 
 
 		 266 aa  293  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264868  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2662  ABC transporter-related protein  50.42 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2305  ferric-citrate ABC transporter ATPase  48.43 
 
 		 276 aa  192  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.830465  normal  0.891449 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  43.57 
 
 		 262 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3077  ABC transporter related protein  43.59 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00414894  normal  0.257844 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0514  iron ABC transporter ATP-binding protein  43.9 
 
 		 267 aa  169  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0275192  normal  0.0986315 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  41.74 
 
 		 536 aa  168  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  36.21 
 
 		 266 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8853  ABC transporter related  42.92 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0889132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  35.78 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  42.54 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  42.34 
 
 		 271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  39.02 
 
 		 490 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  32.91 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3756  ABC transporter related protein  41.42 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  42.91 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  44.03 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  44.73 
 
 		 282 aa  159  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  38.15 
 
 		 414 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40.83 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0371  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATPase component  36.44 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.140536  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0231  ABC transporter-like protein  40.16 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1102  ABC transporter related  38.91 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  42.13 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  38.2 
 
 		 424 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  40.16 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  42.8 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0023  ABC transporter related  38.91 
 
 		 273 aa  155  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  41.63 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  38.89 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3529  ABC transporter related  39.84 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  43.42 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  39.15 
 
 		 259 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  42.49 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0584  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3013  ABC transporter related  39.09 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  39.37 
 
 		 263 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3932  ABC transporter related  40.59 
 
 		 271 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28070  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  43.78 
 
 		 258 aa  149  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4653  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  38.86 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  32.28 
 
 		 409 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  39.67 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  40.08 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  39.48 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  38.86 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  38.05 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4372  ABC transporter related  34.8 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.5 
 
 		 625 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  41.33 
 
 		 251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  40.69 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  40 
 
 		 255 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  40 
 
 		 255 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  40 
 
 		 255 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  36.73 
 
 		 419 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40 
 
 		 255 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  32.76 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  41.74 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2583  ABC transporter related protein  40.59 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  40 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  38.02 
 
 		 286 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  44.23 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  39.24 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  39.13 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  43.75 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 		 265 aa  143  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  38.29 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4439  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.36 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4289  ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4784  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.36 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4079  ABC transporter related  40 
 
 		 269 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  40.77 
 
 		 265 aa  143  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4214  ABC transporter related  34.75 
 
 		 272 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  41.13 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1001  ABC transporter related  42.04 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796453  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  37.69 
 
 		 272 aa  143  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0625  ABC transporter, ATP-binding protein  31.82 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0601394  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3151  ABC transporter related  45.96 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4668  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.92 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4278  ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118015  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1631  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  40.61 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0942936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4658  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3299  ABC transporter related  37.9 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  34.76 
 
 		 265 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5816  ABC transporter related  38.67 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0864104 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  34.76 
 
 		 265 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4499  ABC transporter related  39.75 
 
 		 271 aa  142  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01766  hypothetical protein  34.36 
 
 		 267 aa  143  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  39.48 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1188  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 		 296 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0427  ABC transporter related  39.39 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.299152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>